Závěrečná práce NCONZO
1 svazek : grafy, tabulky ; 30 cm +
Staphylococcus aureus is a major bacterial human pathogen that causes a wide variety of clinical manifestations. The main aim of the presented study was to determine and optimize a novel sequencing independent approach that enables molecular typing of S. aureus isolates and elucidates the transmission of emergent clones between patients. In total, 987 S. aureus isolates including both methicillin-resistant S. aureus (MRSA) and methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) isolates were used to evaluate the novel typing approach combining high-resolution melting (HRM) analysis of multilocus sequence typing (MLST) genes (mini-MLST) and spa gene (spa-HRM). The novel approach's discriminatory ability was evaluated by whole-genome sequencing (WGS). The clonal relatedness of tested isolates was set by the BURP and BURST approach using spa and MLST data, respectively. Mini-MLST classified the S. aureus isolates into 38 clusters, followed by spa-HRM classifying the isolates into 101 clusters. The WGS proved HRM-based methods to effectively differentiate between related S. aureus isolates. Visualizing evolutionary relationships among different spa-types provided by the BURP algorithm showed comparable results to MLST/mini-MLST clonal clusters. We proved that the combination of mini-MLST and spa-HRM is rapid, reproducible, and cost-efficient. In addition to high discriminatory ability, the correlation between spa evolutionary relationships and mini-MLST clustering allows the variability in population structure to be monitored. IMPORTANCE Rapid and cost-effective molecular typing tools for Staphylococcus aureus epidemiological applications such as transmission tracking, source attribution and outbreak investigations are highly desirable. High-resolution melting based methods are effective alternative to those based on sequencing. Their good reproducibility and easy performance allow prospective typing of large set of isolates while reaching great discriminatory power. In this study, we established a new epidemiological approach to S. aureus typing. This scheme has the potential to greatly improve epidemiological investigations of S. aureus.
- MeSH
- kontrola infekce * MeSH
- lidé MeSH
- methicilin rezistentní Staphylococcus aureus genetika izolace a purifikace MeSH
- molekulární typizace metody MeSH
- multilokusová sekvenční typizace MeSH
- prospektivní studie MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- stafylokokové infekce diagnóza mikrobiologie MeSH
- Staphylococcus aureus klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- techniky typizace bakterií metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
Autoři předkládají první zkušenosti s CT vyšetřováním hrudníku u pacientů s infekcí COVID-19 od začátku pandemie tohoto onemocnění v České republice. Rozebírají časovou křivku počtu vyšetření v korelaci s výsledky testu PCR i s dalšími metodami. Dále diskutují praktická hlediska provedení CT vyšetření s ohledem na hygienické podmínky a ochranu personálu. V diskusi pak zmiňují nejvýznamnější témata v souvislosti s indikacemi, technickým provedením i hodnocením nálezů jednotlivých zobrazovacích metod.
Authors present their first experiencies with CT imaging of thorax in patients with COVID-19 infection since the beginning of pandemy of this disease in the Czech Republic. Number of examination timeline is discussed in correla-tion with PCR tests and other methods. Practical aspects of CT examination is also mentioned, especially hygiene measures and staff protection. Discussion is focused to the most frequent topic linked with imaging method indications, technical issues and results of the individual imaging methods.
- MeSH
- hygiena rukou MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí * prevence a kontrola MeSH
- klostridiové infekce prevence a kontrola MeSH
- kontrola infekčních nemocí * organizace a řízení MeSH
- lidé MeSH
- zákonodárství jako téma MeSH
- zákonodárství nemocniční MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Zvyšující se počet hospitalizovaných seniorů byl jedním z důvodů, proč byl v letech 2011–2015 ve FN Brno úspěšně zaveden nový koncept prevence a kontroly infekcí. Ten je v praxi založen na práci sester prevence a kontroly infekcí, partnerském přístupu a na multioborové spolupráci. Při formování systému v praxi jsme vycházeli z textů V. Jindráka, D. Hedlové a J. Prattingerové Současný koncept prevence a kontroly infekcí spojených se zdravotní péčí, který byl uveřejněn ve Zprávách Centra epidemiologie a mikrobiologie v roce 2012.
The growing number of hospitalised seniors was one of the reasons why a new concept of infection prevention and control was successfully introduced in the University Hospital Brno, between the years 2011 and 2015. In practice it is based on the nurses' work in terms of infection prevention and control, partnership approach and multidisciplinary cooperation. When forming the system, we based our approach on texts by V. Jindrák, D. Hedlová a J. Prattingerová. The current concept of prevention and control of diseases associated with healthcare has been published in the News of the Epidemiology and microbiology centre in 2012.
- MeSH
- environmentální zdraví metody MeSH
- hygiena MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí * epidemiologie prevence a kontrola MeSH
- lidé MeSH
- nemocnice fakultní organizace a řízení MeSH
- organizace a řízení MeSH
- primární prevence organizace a řízení MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Klíčová slova
- pracovní prostředí, studie, recenzovaný článek,
- MeSH
- chirurgie MeSH
- pracovní úrazy MeSH
- rizikové faktory MeSH
