BACKGROUND: Primary ciliary dyskinesia (PCD) is a heterogenous disease caused by mutations of miscellaneous genes which physiologically play an important role in proper structure and/or function of various cellular cilia including sperm flagella. Besides male infertility, the typical phenotypes, based on decreased mucociliary clearance, are lifelong respiratory issues, i.e., chronic bronchitis leading to bronchiectasis, chronic rhinosinusitis, and chronic otitis media. Moreover, since motile cilia are important during embryological development in the sense of direction of gut rotation, 50% of affected individuals develop situs inversus - so-called Kartagener's syndrome. CASE PRESENTATION: We present two cases of PCD as a rare cause of male infertility. CONCLUSIONS: Primary ciliary dyskinesia should be suspected in infertile males having (sub)normal sperm concentration values with persistent zero motility together with patient's and/or family history of respiratory symptoms like bronchiectasis, chronic cough, rhinitis, recurrent sinusitis, and otitis media. Due to more than 50 identified mutations until now, the causal mechanism of male infertility is miscellaneous and not in all cases known in detail. Besides impaired sperm motility, other mechanisms significantly decreasing efficacy of assisted reproduction techniques play a pivotal role. Thus, proper diagnostic work-up including, among others, sperm DNA fragmentation, is mandatory to avoid ineffective treatment burden.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Doporučené postupy klinické péče o nosiče patogenních variant v klinicky relevantních genech predisponujících ke vzniku Lynchova syndromu a karcinomu kolorekta definují kroky primární a sekundární prevence, která by měla být osobám ve vysokém riziku vzniku dědičných nádorů v ČR poskytnuta. Tvorba doporučených postupů byla organizována pracovní skupinou onkogenetiky Společnosti lékařské genetiky a genomiky při České lékařské společnosti J. E. Purkyně ve spolupráci se zástupci onkologie, onkogynekologie a gastroenterologie. Doporučené postupy vycházejí z aktuálních doporučení National Comprehensive Cancer Network (NCCN), Evropské společnosti pro klinickou onkologii (ESMO) a zohledňují kapacitní možnosti našeho zdravotnictví.
The guidelines for clinical practice for carriers of pathogenic variants in clinically relevant genes predisposing to Lynch syndrome and colorectal cancer define the steps of primary and secondary prevention that should be provided to the individuals at high risk of developing hereditary cancer in the Czech Republic. The drafting of the guidelines was organized by the Oncogenetics Working Group of the Society for Medical Genetics and Genomics of J. E. Purkyně Czech Medical Society, in cooperation with representatives of oncology, oncogynecology, and gastroenterology. The guidelines are based on the current recommendations of the National Comprehensive Cancer Network (NCCN), European Society of Medical Oncology (ESMO) and take into account the capacity of the Czech healthcare system.
- MeSH
- adhezní molekula epiteliálních buněk genetika MeSH
- dědičné nepolypózní kolorektální nádory genetika MeSH
- genetická predispozice k nemoci * genetika MeSH
- kolorektální nádory * genetika MeSH
- mismatch repair endonukleáza PMS2 genetika MeSH
- MutL homolog 1 genetika MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- zárodečné mutace genetika MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Doporučené postupy klinické péče o nosiče patogenních variant v klinicky relevantních nádorových predispozičních genech definují kroky primární a sekundární prevence, která by měla být těmto osobám ve vysokém riziku vzniku dědičných nádorů v ČR poskytnuta. Tvorba doporučení byla organizována pracovní skupinou onkogenetiky Společnosti lékařské genetiky a genomiky (SLG ČLS JEP) ve spolupráci se zástupci onkologie a onkogynekologie. Doporučené postupy vycházejí z aktuálních doporučení National Comprehensive Cancer Network (NCCN), European Society of Medical Oncology (ESMO) a zohledňují kapacitní možnosti našeho zdravotnictví.
The Guidelines for Clinical Practice for carriers of pathogenic variants in clinically relevant cancer predisposition genes define the steps of primary and secondary prevention that should be provided to these individuals at high risk of developing hereditary cancer in the Czech Republic. The drafting of the guidelines was organized by the Oncogenetics Working Group of the Society for Medical Genetics and Genomics of J. E. Purkyně Czech Medical Society (SLG ČLS JEP) in cooperation with the representatives of oncology and oncogynecology. The guidelines are based on the current recommendations of the National Comprehensive Cancer Network (NCCN), European Society of Medical Oncology (ESMO) and take into account the capacity of the Czech healthcare system.
- MeSH
- ATM protein genetika MeSH
- checkpoint kinasa 2 genetika MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- geny BRCA1 MeSH
- geny BRCA2 MeSH
- nádory prostaty diagnóza genetika prevence a kontrola MeSH
- nádory prsu diagnóza genetika prevence a kontrola MeSH
- nádory slinivky břišní diagnóza genetika prevence a kontrola MeSH
- nádory vaječníků diagnóza genetika prevence a kontrola MeSH
- primární prevence metody MeSH
- protein FANCN genetika MeSH
- sekundární prevence metody MeSH
- směrnice pro lékařskou praxi jako téma MeSH
- zárodečné mutace MeSH
Endometrial cancer (EC) is the most common gynecological malignancy in developed countries. The present study aimed to determine the frequency of germline pathogenic variants (PV) in patients with EC. In this multicenter retrospective cohort study, germline genetic testing (GGT) was performed in 527 patients with EC using a next generation sequencing panel targeting 226 genes, including 5 Lynch syndrome (LS) and 14 hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) predisposition genes, and 207 candidate predisposition genes. Gene-level risks were calculated using 1,662 population-matched controls (PMCs). Patients were sub-categorized to fulfill GGT criteria for LS, HBOC, both or none. A total of 60 patients (11.4%) carried PV in LS (5.1%) and HBOC (6.6%) predisposition genes, including two carriers of double PV. PV in LS genes conferred a significantly higher EC risk [odds ratio (OR), 22.4; 95% CI, 7.8-64.3; P=1.8×10-17] than the most frequently altered HBOC genes BRCA1 (OR, 3.9; 95% CI, 1.6-9.5; P=0.001), BRCA2 (OR, 7.4; 95% CI, 1.9-28.9; P=0.002) and CHEK2 (OR, 3.2; 95% CI, 1.0-9.9; P=0.04). Furthermore, >6% of patients with EC not fulfilling LS or HBOC GGT indication criteria carried a PV in a clinically relevant gene. Carriers of PV in LS genes had a significantly lower age of EC onset than non-carriers (P=0.01). Another 11.0% of patients carried PV in a candidate gene (the most frequent were FANCA and MUTYH); however, their individual frequencies did not differ from PMCs (except for aggregated frequency of loss-of-function variants in POLE/POLD1; OR, 10.44; 95% CI, 1.1-100.5; P=0.012). The present study demonstrated the importance of GGT in patients with EC. The increased risk of EC of PV carriers in HBOC genes suggests that the diagnosis of EC should be included in the HBOC GGT criteria.
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- lidé MeSH
- nádory kůže * etiologie genetika MeSH
- syndrom bazocelulárního névu genetika patologie prevence a kontrola MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- MeSH
- genetická predispozice k nemoci MeSH
- genetické poradenství MeSH
- genetické testování MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * etiologie genetika MeSH
- nádory vaječníků * etiologie genetika MeSH
- profylaktická mastektomie MeSH
- rizikové faktory MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Rozšířené panelové testování dědičných nádorových dispozic metodou masivně paralelního sekvenování vede k nálezu heterozygotních patogenních variant v genech pro autozomálně recesivně dědičné nádorové syndromy. Ke stanovení míry rizika rozvoje solidních nádorů a vhodné dispenzarizace pro heterozygoty nejsou u většiny těchto genů v současnosti k dispozici klinická guidelines ani není definován postup pro další genetické vyšetření v rodině a u jejich partnerů. Naším cílem bylo na základě současných poznatků vytvořit "české guidelines" pro tyto případy. V předkládané práci uvádíme přehled vybraných genů pro autozomálně recesivně dědičné nádorové syndromy, rozdělený do dvou skupin - geny pro Fanconiho anémii a geny pro ostatní autozomálně recesivně dědičné nádorové syndromy. V každé části je vytvořena souhrnná tabulka, která obsahuje frekvenci heterozygotů mutace daného genu v populaci, riziko nádorů u heterozygotů a návrh dispenzarizace a doporučení pro predikce v rodině a ke genetickému vyšetření partnerů heterozygotů. Prediktivní vyšetření je vhodné provádět tam, kde je u heterozygotů zvýšené riziko nádorových onemocnění a/nebo je předpoklad další reprodukce a vyšší frekvence heterozygotů v populaci, tedy i zvýšeného rizika autozomálně recesivního syndromu pro děti nosiče mutace. Uvedené návrhy a doporučení vycházejí ze současných poznatků a v budoucnosti je bude potřeba dále korigovat dle přibývajících znalostí o stávajících nebo dalších, dosud neprozkoumaných, genech.
Expanded gene panel testing for hereditary cancer predispositions using massive parallel sequencing can identify heterozygous pathogenic variants of genes that cause autosomal recessive inherited cancer syndromes. There are no clinical guidelines regarding assessment of the risk of developing solid tumors or for developing appropriate surveillance strategies for heterozygotes for most of these genes, nor is there delineation with respect to the management for genetic testing of relatives and partners. Based on current knowledge, our aim was to create "Czech guidelines" for these cases. Here, we present an overview of the selected genes for autosomal recessive inherited tumor syndromes. The genes were divided into two groups: genes causing Fanconi anemia and genes causing other autosomal recessive inherited tumor syndromes. A summary table was created for each group. The table shows the population frequency of heterozygotes, the cancer risk for heterozygotes, the proposed surveillance strategy, and recommendations for family prediction and genetic testing of partners. Predictive testing should be performed in the case of heterozygotes that have an increased risk of cancer and/or as prerequisite to further reproduction of heterozygotes for a given gene with significant population frequency (this allows an estimation of the risk of autosomal recessive syndrome for children of heterozygote for mutation). These suggestions and recommendations are based on current knowledge and would need to be further corrected in the future based on increasing knowledge of existing or as-yet-unidentified genes.
- Klíčová slova
- autozomálně recesivní dědičnost, riziko nádorů,
- MeSH
- dědičné nádorové syndromy * MeSH
- genetické testování MeSH
- heterozygot MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- nádory genetika MeSH
- riziko MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
Inherited ichthyoses belong to a large and heterogeneous group of mendelian disorders of cornification, and can be distinguished by the quality and distribution of scaling and hyperkeratosis, by other dermatologic and extracutaneous involvement, and by inheritance. We present the genetic analysis results of probands with X-linked ichthyosis, autosomal recessive congenital ichthyosis, keratinopathic ichthyosis, and a patient with Netherton syndrome. Genetic diagnostics was complemented by in silico missense variant analysis based on 3D protein structures and commonly used prediction programs to compare the yields of these two approaches to each other. This analysis revealed various structural defects in proteins coded by mutated genes while no defects were associated with known polymorphisms. Two patients with pathogenic variants in the ABCA12 gene have a premature termination codon mutation on one allele and a silent variant on the second. The silent variants c.69G > A and c.4977G > A are localised in the last nucleotide of exon 1 and exon 32, respectively, and probably affect mRNA splicing. The phenotype of both patients is very severe, including a picture harlequin foetus after birth; later (at 3 and 6 years of age, respectively) ectropin, eclabion, generalised large polygonal scaling and erythema.
- MeSH
- ABC transportéry genetika MeSH
- fenotyp MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika MeSH
- ichtyóza etiologie genetika MeSH
- lidé MeSH
- nesmyslný kodon genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- dopisy MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
