Enterococcus alcedinis sp. nov., isolated from common kingfisher (Alcedo atthis)
Jazyk angličtina Země Velká Británie, Anglie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
23416573
DOI
10.1099/ijs.0.049833-0
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- bakteriální geny MeSH
- DNA bakterií genetika MeSH
- DNA řízené RNA-polymerasy genetika MeSH
- Enterococcus klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- fenylalanin-tRNA-ligasa genetika MeSH
- fylogeneze * MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- peptidové mapování MeSH
- ptáci mikrobiologie MeSH
- ribotypizace MeSH
- RNA ribozomální 16S genetika MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- superoxiddismutasa genetika MeSH
- techniky typizace bakterií MeSH
- zastoupení bazí MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Názvy látek
- DNA bakterií MeSH
- DNA řízené RNA-polymerasy MeSH
- fenylalanin-tRNA-ligasa MeSH
- RNA polymerase alpha subunit MeSH Prohlížeč
- RNA ribozomální 16S MeSH
- superoxiddismutasa MeSH
Two Gram-positive, catalase-negative bacterial strains were isolated from the cloaca of common kingfishers (Alcedo atthis). Repetitive sequence-based PCR fingerprinting using the (GTG)5 primer grouped these isolates into a single cluster separated from all known enterococcal species. The two strains revealed identical 16S rRNA gene sequences placing them within the genus Enterococcus with Enterococcus aquimarinus LMG 16607(T) as the closest relative (97.14 % similarity). Further taxonomic investigation using sequencing of the genes for the superoxide dismutase (sodA), phenylalanyl-tRNA synthase alpha subunit (pheS) and the RNA polymerase alpha subunit (rpoA) as well as application of whole-cell protein fingerprinting, automated ribotyping and extensive phenotyping confirmed that both strains belong to the same species. Based on data from this polyphasic study, these strains represent a novel species of the genus Enterococcus, for which the name Enterococcus alcedinis sp. nov. is proposed. The type strain is L34(T) (= CCM 8433(T) = LMG 27164(T)).
Citace poskytuje Crossref.org
GENBANK
JX948095, JX948096, JX948097, JX948098, JX948099, JX948100, JX948101, JX948102