V letech 2002-2017 jsme analyzovali genomovou DNA od 123 nepříbuzných probandů se suspektní progresivní či rekurentní intrahepatální cholestázou (PFIC nebo BRIC). Mutační analýza ATP8B1, ABCB11, a TJP2 byla provedena u 82 nemocných s normální aktivitou GGT. ABCB4 byl sekvenován u 41 nemocných se zvýšenou aktivitou GGT. U 38 (30,8%) probandů se podařilo potvrdit dg PFIC1 (n=1), PFIC2 (n=14), BRIC (n=10), PFIC3 (n=5) a mírných forem deficitu MDR3 (n=8). U 85 (69,2%) nemocných je dg nejasná. Naším cílem je zjistit molekulární příčinu a mechanizmus choroby u většiny či alespoň u některých z těchto 85 pacientů. K jeho dosažení plánujeme provést sekvenování exomu a v odůvodněných případech i sekvenování genomu, analýzu počtu kopií či RNAseq u většiny z těchto 85 pacientů a jejich rodinných příslušníků. Exprese mutovaných proteinů bude studována imunohistologicky. Patogenita nových mutací bude testována na úrovni mRNA a proteinu na transfekovaných buněčných liniích. Očekávané výsledky viz Specifické cíle v sekci Cíle projektu.; Between 2002- 2017 we analyzed gDNA of 123 unrelated index patiens with suspect progressive or recurrent intrahepatic cholestasis (PFIC or BRIC). Mutation analysis of ATP8B1, ABCB11, ABCB4 and TJP2 was run in 82 patiens with low GGT cholestasis, ABCB4 was sequenced in 41 patients with high GGT cholestasis. The diagnosis of PFIC1, PFIC2, BRIC, PFIC3 and mild forms of MDR3 deficiency were confirmed in 1, 14, 10, 5 and 8 patients, respectively. The diagnosis was established in 38 (30.8%) index patients. The diagnosis remains unclear in 85 (69.2%) patients. Our goal is to find molecular basis and mechanism of the disease in most (or at least some) of these 85 patients and in several patients expected to come in 2018-2021. To achieve this, we plan to perform whole exome sequencing and, when appropriate, genome sequencing, copy number analysis or RNAseq, in most of these patients and their family members. Expression of mutated proteins will be detected on immunohistology. Pathogenicity of novel mutations will be tested in transfected cultured cells. For expected results see Aims.

• Klíčová slova
• intrahepatální cholestáza, žluč, sekvenování exomu, intrahepaticcholestasis, bile, whole exome sequencing,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• MeSH
• cholestáza * etiologie   genetika   klasifikace   MeSH
• Criglerův-Najjarův syndrom etiologie   genetika   klasifikace   MeSH
• familiární hyperbilirubinemie diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• genetické nemoci vrozené * diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• Gilbertova nemoc diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• hyperbilirubinemie * etiologie   genetika   klasifikace   MeSH
• intrahepatální cholestáza etiologie   genetika   klasifikace   MeSH
• komplikace těhotenství diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• lidé MeSH
• žloutenka chronická idiopatická diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• MeSH
• deficit alfa1-antitrypsinu * diagnóza   genetika   MeSH
• hemochromatóza * diagnóza   genetika   MeSH
• hepatolentikulární degenerace * diagnóza   etiologie   terapie   MeSH
• intrahepatální cholestáza * diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• jaterní porfyrie * diagnóza   genetika   MeSH
• lidé MeSH
• nemoci jater * genetika   MeSH
• vrozené poruchy metabolismu * genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

• MeSH
• bilirubin * MeSH
• hem MeSH
• hemodynamika * MeSH
• Publikační typ
• komentáře MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• úvodníky MeSH

Cílem projektu je zjistit příspěvek vzácných genových variant v SLCO1B1, SLCO1B3 a v dalších známých či dosud neznámých kandidátních genech k mechanismu vzniku statiny indukované myopatie. Přítomnost variant u cca 70 nemocných se statinovou myopatií bude zjišťována kombinací genomických metod. Výsledky budou validovány standardními technikami mutační analýzy a zhodnoceny pomocí bioinformatických nástrojů.; The project objective is to determine the contribution of rare gene variants in SLCO1B1, SLCO1B3, and other known or unknown candidate genes to the mechanism of statin-induced myopathy. The presence of variants in approximately 70 patients with statin myopathy will be determined combination of genomic methods. The results will be validated by standard techniques of mutation analysis and evaluated using bioinformatics tools.

• MeSH
• genetická predispozice k nemoci MeSH
• genomika MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• nemoci svalů genetika   chemicky indukované   MeSH
• statiny škodlivé účinky   terapeutické užití   MeSH
• výpočetní biologie MeSH

• Konspekt
• Experimentální medicína
• NLK Obory
• experimentální medicína
• genetika, lékařská genetika
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

AIM: To investigate the contribution of ABCB4 mutations to pediatric idiopathic gallstone disease and the potential of hormonal contraceptives to prompt clinical manifestations of multidrug resistance protein 3 deficiency. METHODS: Mutational analysis of ABCB4, screening for copy number variations by multiplex ligation-dependent probe amplification, genotyping for low expression allele c.1331T>C of ABCB11 and genotyping for variation c.55G>C in ABCG8 previously associated with cholesterol gallstones in adults was performed in 35 pediatric subjects with idiopathic gallstones who fulfilled the clinical criteria for low phospholipid-associated cholelithiasis syndrome (LPAC, OMIM #600803) and in 5 young females with suspected LPAC and their families (5 probands, 15 additional family members). The probands came to medical attention for contraceptive-associated intrahepatic cholestasis. RESULTS: A possibly pathogenic variant of ABCB4 was found only in one of the 35 pediatric subjects with idiopathic cholesterol gallstones whereas 15 members of the studied 5 LPAC kindreds were confirmed and another one was highly suspected to carry predictably pathogenic mutations in ABCB4. Among these 16, however, none developed gallstones in childhood. In 5 index patients, all young females carrying at least one pathogenic mutation in one allele of ABCB4, manifestation of LPAC as intrahepatic cholestasis with elevated serum activity of gamma-glutamyltransferase was induced by hormonal contraceptives. Variants ABCB11 c.1331T>C and ABCG8 c.55G>C were not significantly overrepresented in the 35 examined patients with suspect LPAC. CONCLUSION: Clinical criteria for LPAC syndrome caused by mutations in ABCB4 cannot be applied to pediatric patients with idiopathic gallstones. Sexual immaturity even prevents manifestation of LPAC.

• MeSH
• alely MeSH
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• fosfolipidy metabolismus   MeSH
• genotyp MeSH
• intrahepatální cholestáza genetika   MeSH
• kojenec MeSH
• kontraceptiva orální hormonální škodlivé účinky   MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mutace * MeSH
• mutační analýza DNA MeSH
• P-glykoproteiny nedostatek   genetika   MeSH
• předškolní dítě MeSH
• žlučové kameny metabolismus   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• dospělí MeSH
• kojenec MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• předškolní dítě MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Úvod shrnuje klasickou dráhu degradace hemu a z ní odvozené rozdělení žloutenek. Následuje popis vrozených žloutenek známých jako Crigler‑Najjarův, Gilbertův, Dubin‑Johnsonův a Rotorův syndrom s důrazem na vysvětlení molekulární podstaty těchto metabolických poruch. Zvláštní pozornost je věnována nedávno objevenému molekulárnímu mechanizmu Rotorova syndromu spočívajícímu v neschopnosti jater zpětně vychytávat frakci konjugovaného bilirubinu vylučovaného primárně do krve a nikoliv do žluči. Snížená schopnost jater vychytávat konjugovaný bilirubin přispívá i k rozvoji hyperbilirubinemie u běžných onemocnění jater a žlučových cest a k toxicitě xenobio­tik a léků využívajících transportní proteiny pro konjugovaný bilirubin.

The introductory summarises the classical path of heme degradation and classification of jaundice. Subsequently, a description of neonatal types of jaundice is given, known as Crigler‑Najjar, Gilbert's, Dubin‑Johnson and Rotor syndromes, emphasising the explanation of the molecular mechanisms of these metabolic disorders. Special attention is given to a recently discovered molecular mechanism of the Rotor syndrome. The mechanism is based on the inability of the liver to retrospectively uptake the conjugated bilirubin fraction primarily excreted into the blood, not bile. A reduced ability of the liver to uptake the conjugated bilirubin contributes to the development of hyperbilirubinemia in common disorders of the liver and bile ducts and to the toxicity of xenobio­tics and drugs using transport proteins for conjugated bilirubin.

• Klíčová slova
• OATP1B1, OATP1B3, Rotorův syndrom, Gilbertův syndrom, Dubin-Johnsonův syndrom,
• MeSH
• bilirubin metabolismus   MeSH
• Criglerův-Najjarův syndrom genetika   patofyziologie   terapie   MeSH
• familiární hyperbilirubinemie * diagnóza   genetika   MeSH
• Gilbertova nemoc diagnóza   genetika   MeSH
• hem MeSH
• lidé MeSH
• přenašeče organických aniontů nezávislé na sodíku metabolismus   MeSH
• přenašeče organických aniontů metabolismus   MeSH
• žloutenka chronická idiopatická diagnóza   genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• bilirubin genetika   metabolismus   MeSH
• erytrocyty fyziologie   metabolismus   patologie   MeSH
• familiární hyperbilirubinemie diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• genetické jevy fyziologie   genetika   imunologie   MeSH
• genetické techniky využití   MeSH
• genetický výzkum MeSH
• glukuronáty biosyntéza   chemie   krev   MeSH
• hepatocyty fyziologie   metabolismus   patologie   MeSH
• lidé MeSH
• metaanalýza jako téma MeSH
• mutace genetika   imunologie   MeSH
• přenašeče organických aniontů biosyntéza   krev   metabolismus   MeSH
• transportní proteiny genetika   metabolismus   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• komentáře MeSH