Processing bodies (P-bodies) are dynamic cytoplasmic structures involved in mRNA degradation, but the mechanism that governs their formation is poorly understood. In this paper, we address a role of Like-Sm (LSm) proteins in formation of P-bodies and provide evidence that depletion of nuclear LSm8 increases the number of P-bodies, while LSm8 overexpression leads to P-body loss. We show that LSm8 knockdown causes relocalization of LSm4 and LSm6 proteins to the cytoplasm and suggest that LSm8 controls nuclear accumulation of all LSm2-7 proteins. We propose a model in which redistribution of LSm2-7 to the cytoplasm creates new binding sites for other P-body components and nucleates new, microscopically visible structures. The model is supported by prolonged residence of two P-body proteins, DDX6 and Ago2, in P-bodies after LSm8 depletion, which indicates stronger interactions between these proteins and P-bodies. Finally, an increased number of P-bodies has negligible effects on microRNA-mediated translation repression and nonsense mediated decay, further supporting the view that the function of proteins localized in P-bodies is independent of visible P-bodies.
- MeSH
- autoantigeny metabolismus MeSH
- buněčné jádro metabolismus MeSH
- cytoplazmatická granula metabolismus MeSH
- DEAD-box RNA-helikasy metabolismus MeSH
- fluorescenční mikroskopie MeSH
- lidé MeSH
- malý jaderný ribonukleoprotein U4-U6 metabolismus fyziologie MeSH
- N-terminální acetyltransferasa C metabolismus fyziologie MeSH
- posttranskripční úpravy RNA * MeSH
- proteiny vázající RNA metabolismus MeSH
- protoonkogenní proteiny metabolismus MeSH
- rekombinantní fúzní proteiny metabolismus MeSH
- ribonukleoproteiny malé jaderné metabolismus MeSH
- transport proteinů MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
The U4/U6·U5 tri-small nuclear ribonucleoprotein particle (tri-snRNP) is an essential pre-mRNA splicing factor, which is assembled in a stepwise manner before each round of splicing. It was previously shown that the tri-snRNP is formed in Cajal bodies (CBs), but little is known about the dynamics of this process. Here we created a mathematical model of tri-snRNP assembly in CBs and used it to fit kinetics of individual snRNPs monitored by fluorescence recovery after photobleaching. A global fitting of all kinetic data determined key reaction constants of tri-snRNP assembly. Our model predicts that the rates of di-snRNP and tri-snRNP assemblies are similar and that ∼230 tri-snRNPs are assembled in one CB per minute. Our analysis further indicates that tri-snRNP assembly is approximately 10-fold faster in CBs than in the surrounding nucleoplasm, which is fully consistent with the importance of CBs for snRNP formation in rapidly developing biological systems. Finally, the model predicted binding between SART3 and a CB component. We tested this prediction by Förster resonance energy transfer and revealed an interaction between SART3 and coilin in CBs.
- MeSH
- antigeny nádorové genetika metabolismus MeSH
- buněčné jádro genetika metabolismus MeSH
- Cajalova tělíska genetika metabolismus MeSH
- HeLa buňky MeSH
- jaderné proteiny metabolismus MeSH
- kinetika MeSH
- lidé MeSH
- malý jaderný ribonukleoprotein U4-U6 genetika metabolismus MeSH
- malý jaderný ribonukleoprotein U5 genetika metabolismus MeSH
- molekulární modely MeSH
- nádorové buněčné linie MeSH
- prekurzory RNA genetika metabolismus MeSH
- proteiny vázající RNA genetika metabolismus MeSH
- ribonukleoproteiny malé jaderné genetika metabolismus MeSH
- RNA-helikasy genetika metabolismus MeSH
- sestřih RNA genetika MeSH
- spliceozomy genetika metabolismus MeSH
- vazba proteinů genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
4., přeprac. vyd. 239 s. : il., tab. ; 21 cm
Tato učebnice pojednává o anatomii a fyziologii člověka.
- Konspekt
- Anatomie člověka a srovnávací anatomie
- Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
- NLK Obory
- biologie
- fyziologie
- anatomie
- NLK Publikační typ
- učebnice středních škol
2. uprav. vyd. 136 s. : il., tab. ; 30 cm
II. doplněné vydání.
- MeSH
- anatomie MeSH
- fyziologie MeSH
- Konspekt
- Lékařské vědy. Lékařství
- NLK Obory
- anatomie
- fyziologie
- NLK Publikační typ
- učebnice středních škol
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
13 l. ; 32 cm
Diagnostika aktivní infekce CMV na základě výskytu různých časných proteinů (antigenů) CMV. Porovnání těchto výsledků s kultivací viru na buňkách LEP s určením cytopatického efektu, s výskytem specifického sérového IgM a s klinickým stavem pacienta.
- MeSH
- alkoholismus prevence a kontrola MeSH
- dítě MeSH
- kouření MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- poruchy spojené s užíváním psychoaktivních látek prevence a kontrola MeSH
- školy MeSH
- střídmost MeSH
- zdravotní výchova MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mladiství MeSH
- Geografické názvy
- Slovenská republika MeSH