Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
nestr.
Prevence vzniku nádorů u nosičů dědičných alterací nádorových predispozičních genů vyžaduje jasnou identifikaci zodpovědných patogenních mutací. Při analýze nádorové predispozice je odhalena řada variant s nejasným významem (VUS) komplikujících klinickou interpretaci výsledků. Pokud VUS postihují proces sestřihu transkriptu příslušného genu, lze je považovat za patogenní. V projektu se zaměříme na vyhodnocení změn sestřihového vzorce mRNA transkriptů u nosičů dědičných variant genů predisponujících ke vzniku dědičné formy karcinomu (ca) prsu a ovarií (CHEK2, PALB2, NBN, TP53, RAD51C/D, MLH1, MSH2/6, BRIP1). Nejprve provedeme identifikaci jejich sestřihových variant v normálních tkáních (leukocyty, mamární a tuková tkáň) zdravých osob bez přítomnosti dědičných variant pomocí multiplexní PCR (mPCR) umožňující amplifikaci všech sestřihových oblastí s následnou charakterizací sekvenovánín nové generace (NGS). Vyšetření RNA od nosičů VUS umožní kvalitativně (fragmentační a mPCR/NGS analýza) i kvantitativně (qPCR) identifikovat VUS způsobující změny sestřihového vzorce příslušného genu.; Clinical management that enables efficient cancer prevention in carriers of germ-line alterations in cancer susceptibility genes requires and unequivocal characterization of the pathogenic mutation. Current cancer predisposition analyses reveal many variants of unknown clinical significance (VUS) which complicate the clinical interpretation of results. The VUS that change splicing of corresponding gene product may be considered as pathogenic. Our project aims to identify splicing alterations in carriers of VUS in genes predisposing to breast and ovarian cancer (CHEK2, PALB2, NBN, TP53, RAD51C/D, MLH1, MSH2/6, BRIP1). First, we aim to perform a comprehensive characterization of naturally occurring splicing variants of analyzed genes in normal lymphocytes, mammary and adipose tissues from non-cancer individuals using multiplex (m)PCR/next generation sequencing (NGS) analysis. Subsequently, the analyses of RNA from carriers of VUS will enable to characterize the qualitative (fragment analysis, mPCR/NGS) and quantitative (qPCR) changes in splicing pattern of corresponding genes.
- MeSH
- dědičný syndrom nádoru prsu a vaječníků genetika klasifikace MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika klasifikace MeSH
- geny nádorové genetika MeSH
- prekurzory RNA MeSH
- sestřih RNA genetika MeSH
- sestřihové faktory MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- genetika, lékařská genetika
- gynekologie a porodnictví
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Současná onkologie se zaměřuje především na hledání nových prognostických a prediktivních biomarkerů, nových terapeutik a léčebných strategií se zaměřením na personalizaci léčby. Současná diagnostika karcinomu prsu se opírá o stanovení exprese estrogenového, progesteronového a HER2 receptoru, jejichž pozitivita predikuje odpověď na endokrinní, respektive anti-HER2 terapii a vypovídá rovněž o prognóze onemocnění. V nedávné době bylo do klinické praxe zavedeno i testování genů BRCA1 a BRCA2, jejichž mutace jsou prediktorem dobré odpovědi na léčbu inhibitory PARP (poly(ADP-ribóza) polymeráza). Za poslední desetiletí byla identifikována celá řada biomarkerů, jejichž klinická validita musí být potvrzena nezávislou prospektivní studií. Význam dostatečně validovaných biomarkerů je pro dnešní personalizovanou onkologii obrovský.
Current oncology is mainly focused towards the search of novel prognostic and predictive biomarkers, new therapeutics and therapeutic strategies leading to the development of personalized medicine. Current diagnostics of breast cancer uses the estrogen, progesterone and HER2 expression for prediction of endocrine and anti-HER2 therapy response and prognosis determining. Recently, BRCA1 and BRCA2 mutation testing for prediction of response to PARP inhibitors was introduced into clinical practice. In last decade, a number of biomarkers have been identified, however, they must be clinically validated by independent prospective study. The properly validated biomarkers have huge significance in current personalized oncology.
- MeSH
- cílená molekulární terapie * metody trendy MeSH
- dědičný syndrom nádoru prsu a vaječníků genetika MeSH
- farmakoterapie metody trendy MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika klasifikace MeSH
- genetické testování metody trendy MeSH
- lidé MeSH
- modulátory estrogenních receptorů terapeutické užití MeSH
- nádorové biomarkery izolace a purifikace klasifikace MeSH
- nádory prsu * diagnóza genetika klasifikace MeSH
- PARP inhibitory terapeutické užití MeSH
- prediktivní hodnota testů MeSH
- prognóza MeSH
- receptor erbB-2 antagonisté a inhibitory genetika imunologie MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- MeSH
- afázie genetika klasifikace MeSH
- chromozomální aberace klasifikace MeSH
- dyslexie genetika MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika klasifikace MeSH
- koktavost genetika MeSH
- mentální retardace genetika komplikace MeSH
- poruchy řeči epidemiologie genetika MeSH
- rozštěp patra etiologie genetika komplikace MeSH
- rozštěp rtu etnologie genetika komplikace MeSH
- vývojové poruchy řeči * genetika MeSH
- MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika klasifikace MeSH
- hypertenze diagnóza epidemiologie farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- lymfatické metastázy patologie MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mutace genetika MeSH
- nádorové biomarkery krev MeSH
- nádory ledvin * diagnostické zobrazování genetika chirurgie MeSH
- neuroendokrinní nádory diagnostické zobrazování genetika MeSH
- paragangliom diagnostické zobrazování genetika patologie MeSH
- prognóza MeSH
- sukcinátdehydrogenasa genetika MeSH
- tinnitus diagnóza epidemiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
- MeSH
- arytmogenní dysplazie pravé komory genetika patologie MeSH
- dilatační kardiomyopatie genetika MeSH
- familiární hypertrofická kardiomyopatie * genetika MeSH
- genetická predispozice k nemoci * genetika klasifikace MeSH
- genetické testování metody MeSH
- hypertrofická kardiomyopatie genetika MeSH
- izolovaná nekompaktnost myokardu komor genetika MeSH
- lidé MeSH
- restriktivní kardiomyopatie genetika MeSH
- srdeční selhání * diagnóza genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci epidemiologie etiologie klasifikace MeSH
- geny erbB-2 genetika MeSH
- karcinom genetika klasifikace patologie MeSH
- lidé MeSH
- nádory podle histologického typu MeSH
- nádory prsu * diagnóza etiologie terapie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Klíčová slova
- Diabetes mellitus monogenní MODY,
- MeSH
- diabetes mellitus 2. typu * diagnóza klasifikace terapie MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody trendy využití MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci * etiologie klasifikace prevence a kontrola MeSH
- genetické techniky * trendy využití MeSH
- inzulin genetika izolace a purifikace MeSH
- nemoci novorozenců diagnóza etiologie MeSH
- senioři MeSH
- statistika jako téma MeSH
- těhotenství při diabetu prevence a kontrola terapie MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- senioři MeSH
- MeSH
- anamnéza MeSH
- dědičné nádorové syndromy diagnóza genetika klasifikace MeSH
- dítě MeSH
- financování organizované MeSH
- genetická predispozice k nemoci klasifikace prevence a kontrola MeSH
- geny BRCA1 MeSH
- geny BRCA2 MeSH
- lidé MeSH
- Liův-Fraumeniho syndrom genetika prevence a kontrola terapie MeSH
- nádory prsu u mužů MeSH
- nádory prsu genetika terapie vrozené MeSH
- nádory žaludku diagnóza genetika vrozené MeSH
- Peutzův-Jeghersův syndrom genetika prevence a kontrola terapie MeSH
- syndrom mnohočetného hamartomu diagnóza genetika vrozené MeSH
- věkové faktory MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
