Kolorektální karcinom má v České republice nejvyšší četnost výskytu a zaujímá jednu z čelních příček incidence na světě. Pouze nemocní s resekovatelnými vzdálenými metastázami mají naději na vyléčení. Hlavním cílem onkologické léčby tedy zůstává prodloužení přežití a zlepšení kvality života. Možnosti klasické chemoterapie se v současnosti zdají být vyčerpány. Další prodloužení přežití pacientů s metastazujícím kolorektálním karcinomem (mKRK) přinesla cílená biologická léčba. Klíčové je nalezení vhodných prediktivních biomarkerů, které dovolí identifikaci cílové populace pacientů. V přehledovém článku je analyzován stav mutace RAS vzhledem k možné sekvenci cílené biologické léčby u nemocných s mKRK.

Colorectal cancer has the highest incidence rate in the Czech Republic and occupies one of the leading positions in incidence worldwide. Only patients with resectable distant metastases have hope for a cure. Prolongation of survival and improvement in the quality of life thus remain the main goal of cancer treatment. The possibilities of classic chemotherapy appear to be currently exhausted. Further prolongation of survival of patients with metastatic colorectal cancer (mCRC) has been provided by targeted biological therapy. It is crucial to find suitable predictive biomarkers that will allow identification of a target population of patients. The review article analyses the RAS mutation status with respect to the possible sequence of targeted biological therapy in patients with mCRC.

• MeSH
• analýza přežití MeSH
• biologická terapie metody   trendy   MeSH
• geny ras * genetika   MeSH
• kolorektální nádory * diagnóza   farmakoterapie   genetika   MeSH
• lidé MeSH
• metastázy nádorů farmakoterapie   genetika   MeSH
• mutace genetika   MeSH
• nádorové biomarkery * analýza   genetika   krev   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

Karcinóm prostaty patrí medzi najčastejšie sa vyskytujúce nádorové ochorenia mužov vo veku nad 50 rokov. Na vzniku ochorenia sa podieľajú genetická predispozícia ako aj získané genetické a epigenetické zmeny. Najviac študovanou epigenetickou zmenou pri karcinóme prostaty je metylácia cytozínu v CpG ostrovčekoch promótorových oblastí rôznych génov pomocou metylačne špecifi ckej PCR. Kvôli hymermetylácii DNA dochádza pomerne často a relatívne špecificky v tkanivách karcinómu prostaty k vypnutiu génov ako GSTP1, APC alebo RASF1. Detekciu metylácie DNA je však možné prevádzať nielen na vzorkách tkanív, ale aj v moči, ejakuláte alebo sére. Translačný výskum preto ďalej hľadá nové biomarkery pre včasnú detekciu a prognózu karcinómu prostaty, vzhľadom na pomerne veľké rozdiely v použitých metódach ako aj v pacientskych súboroch však boli získané tak sľubné, tak aj kontroverzné výsledky. Preto sú na zistenie skutočného významu detekcie hypermetylácie DNA pre diagnostiku a prognózu karcinómu prostaty potrebné ďalšie randomizované prospektívne klinické štúdie a štadardizácia použitých metód.

Prostate cancer is one of the most common malignant diseases in men above the age of 50. A genetic predisposition and/ or acquired genetic and epigenetic changes together with lifestyle contribute to the development of the disease. The most studied epigenetic modifi cation in prostate cancer is the methylation of the cytosine located within the dinucleotide CpG of promoter regions of diff erent genes by methylation specifi c PCR. The evidence of gene silencing by DNA methylation in genes like GSTP1, APC or RASF1 is a common and relatively specifi c event in prostate cancer. DNA methylation testing can be performed on tissue samples or urine, ejaculate or serum. Translational research is searching for new bio markers for early detection and prognosis of prostate cancer, but because of large methodological diff erences in applied techniques and patient cohorts, the investigations have yielded promising, but also some controversial results. More prospective randomized trials and standardized methods are needed to assess the true value of methylation for the diagnosis and prognosis of prostate cancer.

• MeSH
• CpG ostrůvky genetika   MeSH
• financování organizované MeSH
• lidé MeSH
• metylace DNA MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory prostaty diagnóza   genetika   MeSH
• prognóza MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Kolorektální karcinom má v České republice nejvyšší četnost výskytu a zaujímá jednu z čelních příček incidence na světě. Pouze nemocní s resekovatelnými vzdálenými metastázami mají naději na vyléčení. Hlavním cílem onkologické léčby tedy zůstává prodloužení přežití a zlepšení kvality života. Možnosti klasické chemoterapie se v současnosti zdají být vyčerpány. Další prodloužení přežití pacientů s metastazujícím kolorektálním karcinomem (mKRK) přinesla cílená biologická léčba. Klíčové je nalezení vhodných prediktivních biomarkerů, které dovolí identifikaci cílové populace pacientů. V přehledovém článku je analyzován stav mutace RAS vzhledem k možné sekvenci cílené biologické léčby u nemocných s mKRK s ohledem na nová data, která byla prezentována na ASCO 2014.

Colorectal cancer has the highest incidence rate in the Czech Republic and occupies one of the leading positions in incidence worldwide. Only patients with resectable distant metastases have hope for a cure. Prolongation of survival and improvement in the quality of life thus remain the main goal of cancer treatment. The possibilities of classic chemotherapy appear to be currently exhausted. Further prolongation of survival of patients with metastatic colorectal cancer (mCRC) has been provided by targeted biological therapy. It is crucial to find suitable predictive biomarkers that will allow identification of a target population of patients. The review article analyses the RAS mutation status with respect to the possible sequence of targeted biological therapy in patients with mCRC with regard to the new data presented at ASCO 2014.

• Klíčová slova
• sekvence cílené léčby, FOLFOX, FOLFIRI,
• MeSH
• bevacizumab MeSH
• cetuximab MeSH
• cílená molekulární terapie MeSH
• erbB receptory antagonisté a inhibitory   MeSH
• exony MeSH
• geny ras * genetika   MeSH
• humanizované monoklonální protilátky terapeutické užití   MeSH
• klinické zkoušky, fáze II jako téma MeSH
• klinické zkoušky, fáze III jako téma MeSH
• kolorektální nádory * farmakoterapie   genetika   MeSH
• kombinovaná farmakoterapie MeSH
• lidé MeSH
• monoklonální protilátky terapeutické užití   MeSH
• mutace MeSH
• nádorové biomarkery * genetika   MeSH
• panitumumab MeSH
• protinádorové látky terapeutické užití   MeSH
• protokoly protinádorové kombinované chemoterapie MeSH
• randomizované kontrolované studie jako téma MeSH
• vaskulární endoteliální růstový faktor A MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• práce podpořená grantem MeSH
• přehledy MeSH

• MeSH
• biologické markery MeSH
• biologické vědy MeSH
• genetické markery MeSH
• geny MeSH

• Konspekt
• Biologické vědy
• NLK Obory
• biologie
• NLK Publikační typ
• elektronické časopisy

• MeSH
• CD8-pozitivní T-lymfocyty cytologie   imunologie   MeSH
• cytotoxické T-lymfocyty * MeSH
• exprese genu MeSH
• HIV infekce imunologie   MeSH
• HIV * imunologie   patogenita   MeSH
• inhibitory kontrolních bodů * analýza   MeSH
• klinické zkoušky jako téma MeSH
• lidé MeSH
• poměr CD4 a CD8 lymfocytů MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• stanovení celkové genové exprese MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• MeSH
• bcr-abl fúzní proteiny MeSH
• chronická myeloidní leukemie MeSH
• genový targeting využití   MeSH
• leukemie B-buněčná MeSH
• mikročipová analýza MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• receptor 1 pro vaskulární endoteliální růstový faktor MeSH
• sirolimus MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Publikační typ
• sborníky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• biologie
• hematologie a transfuzní lékařství

Male infertility is a global public health concern. Teratozoospermia is a qualitative anomaly of spermatozoa morphology, contributing significantly to male infertility, whereas azoospermia is the complete absence of spermatozoa in the ejaculate. Thus, there is a serious need for unveiling the common origin and/or connection between both of these diseases, if any. This study aims to identify common potential biomarker genes of these two diseases via an in silico approach using a meta-analysis of microarray data. In this study, a differential expression analysis of genes was performed on four publicly available RNA microarray datasets, two each from teratozoospermia (GSE6872 and GSE6967) and azoospermia (GSE145467 and GSE25518). From the analysis, 118 DEGs were found to be common to teratozoospermia and azoospermia, and, interestingly, sperm autoantigenic protein 17 (SPA17) was found to possess the highest fold change value among all the DEGs (9.471), while coiled-coil domain-containing 90B (CCDC90B) and coiled-coil domain-containing 91 (CCDC91) genes were found to be common among three of analyses, i.e., Network Analyst, ExAtlas, and GEO2R. This observation indicates that SPA17, CCDC90B, and CCDC91 genes might have significant roles to play as potential biomarkers for teratozoospermia and azoospermia. Thus, our study opens a new window of research in this area and can provide an important theoretical basis for the diagnosis and treatment of both these diseases.

• MeSH
• azoospermie * diagnóza   genetika   MeSH
• biologické markery MeSH
• lidé MeSH
• mužská infertilita * genetika   MeSH
• RNA MeSH
• sperma metabolismus   MeSH
• teratozoospermie * genetika   metabolismus   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• metaanalýza MeSH

• MeSH
• exprese genu MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory prsu * diagnóza   klasifikace   MeSH
• staging nádorů MeSH
• Publikační typ
• zprávy MeSH

Cell differentiation depends mainly on specific mRNA expression. To quantify the expression of a particular gene, the normalisation with respect to the expression of a reference gene is carried out. This is based on the assumption that the expression of the reference gene is constant during development, in different cells or tissues or after treatment. Xenopus laevis studies have frequently used eEF-1 alpha, GAPDH, ODC, L8, and H4 as reference genes. The aim of this work was to examine, by real-time RT-PCR, the expression profiles of the above-mentioned five reference genes during early development of X. laevis. It is shown that their expression profiles vary greatly during X. laevis development. The developmental changes of mRNA expression can thus significantly compromise the relative mRNA quantification based on these reference genes, when different developmental stages are to be compared. The normalisation against total RNA is recommended instead.

• MeSH
• biologické markery analýza   MeSH
• financování organizované MeSH
• stanovení celkové genové exprese MeSH
• vývojové geny MeSH
• Xenopus laevis embryologie   genetika   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• zvířata MeSH

Background The lack of effective biomarkers for the screening and early detection of ovarian cancer (OC) is one of the most pressing problems in oncogynecology. Because epigenetic alterations occur early in the cancer development, they provide great potential to serve as such biomarkers. In our study, we investigated a potential of a four-gene methylation panel (including CDH13, HNF1B, PCDH17 and GATA4 genes) for the early detection of high-grade serous ovarian carcinoma (HGSOC). Methods For methylation detection we used methylation sensitive high-resolution melting analysis and real-time methylation specific analysis. We also investigated the relation between gene hypermethylation and gene relative expression using the 2-ΔΔCt method. Results The sensitivity of the examined panel reached 88.5%. We were able to detect methylation in 85.7% (12/14) of early stage tumors and in 89.4% (42/47) of late stage tumors. The total efficiency of the panel was 94.4% and negative predictive value reached 90.0%. The specificity and positive predictive value achieved 100% rates. Our results showed lower gene expression in the tumor samples in comparison to control samples. The more pronounced downregulation was measured in the group of samples with detected methylation. Conclusions In our study we designed the four-gene panel for HGSOC detection in ovarian tissue with 100% specificity and sensitivity of 88.5%. The next challenge is translation of the findings to the less invasive source for biomarker examination, such as plasma. Our results indicate that combination of examined genes deserve consideration for further testing in clinical molecular diagnosis of HGSOC.

• MeSH
• časná detekce nádoru MeSH
• lidé MeSH
• metylace DNA * MeSH
• nádorové biomarkery krev   MeSH
• nádory vaječníků krev   diagnóza   genetika   MeSH
• senzitivita a specificita MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH