Leták, který informuje o ukončení kouření, o nebezpečnosti kouření a závislosti na tabáku a o přidružených urologických nemocech. Určeno široké veřejnosti; kuřákům.

• MeSH
• mužské urogenitální nemoci MeSH
• odvykání kouření MeSH
• poruchy vyvolané užíváním tabáku MeSH
• rizikové faktory MeSH
• ukončení užívání tabáku MeSH
• urologické nemoci MeSH
• Publikační typ
• informační letáky pro pacienty MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• adiktologie
• urologie
• zdravotní výchova

HNF1B is a transcription factor which plays a key role in ontogenesis and regulates the expression of numerous genes involved in cell cycle modulation. Epigenetic changes and mutations of HNF1B (TCF2) are involved in the tumorigenesis of certain tumors. Immuno-histochemically, these changes can be associated with the loss or overexpression of the HNF1B protein. The protein exists in several isoforms, whose number and precise characterization are presently not exactly known. Genome-wide association studies have found an association of certain single nucleotide polymorphisms with an increased or conversely decreased incidence of certain solid tumors, such as carcinomas of the prostate and endometrium. However, overall knowledge of the epigenetic and genetic changes of HNF1B and their relation to neoplasms is very limited. In our work we want to build on our previous project focused on the problematics of HNF-1B in female genital tract tumors, and extend the analysis to other types of solid tumors of this and other areas, in which HNF1B involvement in carcinogenesis can be expected.

HNF-1B je transkripční faktor, který hraje klíčovou roli při ontogenezi a reguluje expresi četných genů podílejících se na modulaci buněčného cyklu. Epigenetické změny a mutace HNF-1B (TCF2) se podílí na vzniku některých nádorů a na imunohistochemické úrovni se tyto změny mohou projevit ztrátou nebo zvýšenou expresí proteinu HNF-1ß. Protein se vyskytuje ve více izoformách, jejichž počet a přesná charakterizace však v současné době nejsou přesně známé. Celogenomové asociační studie prokázaly souvislost některých jednonukleotidových polymorfismů se zvýšenou či naopak sníženou incidencí některých solidních nádorů, jako jsou například karcinomy prostaty a endometria. Celkové znalosti týkající se epigenetických a zejména genetických změn HNF1B a jejich vztahu k nádorovým onemocněním jsou však velmi limitované. V naší práci chceme navázat na náš předchozí projekt zabývající se problematikou HNF1B u nádorů ženského genitálu a rozšířit analýzu na další typy solidních epitelových nádorů této a jiných oblastí, u kterých lze účast HNF1B v procesu karcinogeneze očekávat.

• MeSH
• epigeneze genetická MeSH
• exprese genu MeSH
• hepatocytární jaderný faktor 1-beta genetika   MeSH
• imunohistochemie metody   MeSH
• lidé MeSH
• nádory genetika   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The incidence of congenital cataract is estimated 1-6 in 10 000 newborns. In 15% of cases congenital cataract is a part of a syndromic disease, the manifestation at an early age is however often nonspecific and the diagnostic process is long and complicated placing a considerable burden on both patients and the healthcare resources. The aim of the project is to propose a novel diagnostic algorithm for children with congenital cataracts utilizing modern techniques of whole-exome and whole-genome sequencing. We expect increased rate of correct diagnosis and shortening time of making the final diagnosis in syndromes. The project will unravel mechanisms involved in hereditary cataract formation and address whether specific genotypes may influence the success of revolutionary surgical method preserving endogenous lens epithelial stem/progenitor cells. The knowledge gained can be also applied for preimplantation or prenatal diagnosis. The project will enable, in the context of personalized medicine, multidisciplinary team care approach to congenital cataract patients.

Kongenitální katarakta se vyskytuje u 1-6 dětí z 10 000, přičemž v 15% případech je součástí multisystémového onemocnění. Projevy syndromů asociovaných s kataraktou jsou v raném věku často nespecifické, což vede ke zdlouhavému diagnostickému procesu značně zatěžujícího pacienta i veřejné zdravotnictví. Cílem projektu je pomocí metod celoexomového a celogenomového sekvenování navrhnout u dětí s kongenitálními kataraktami nový diagnostický algoritmus, který povede ke zvýšení procenta stanovení diagnózy multisystémových onemocnění a zároveň zkrátí čas k jejímu určení. Projekt dále přinese odhalení molekulárních mechanismů podílejících se na vzniku kongenitálních katarakt a zjistí, zda existují i pacienti s konkrétními genotypy, kteří nejsou vhodní pro revoluční techniku chirurgie dětské katarakty využívající endogenní kmenové buňky. Získané poznatky budou využity i v rámci prenatální či preimplantační diagnostiky. Projekt umožní v kotextu personalizované medicíny zavedení multidisciplinárního přístupu k pacientům s kongenitálními kataraktami jak na úrovni klinické, tak i výzkumné.

• MeSH
• dítě MeSH
• genetické asociační studie metody   MeSH
• genetické nemoci vrozené diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• katarakta diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• lidé MeSH
• preimplantační diagnóza MeSH
• prenatální diagnóza MeSH
• týmová péče o pacienty MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• oftalmologie
• pediatrie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Significant effort has been made to understand mechanisms leading to the initiation of autoimmune diseases. One hypothesis determines infection as the triggering cause in genetically predisposed individuals. The main aim of this project is to gain new knowledge of the mechanisms and possibilities of regulation of sight-threatening autoimmune uveitis. Special emphasis will be put on clarifying the influence of microorganisms (including commensal bacteria) and participation of innate immunity in the process of uveitis, and their directed regulation. To achieve these goals, the analysis of intraocular fluids, serum and microbiome of patients with autoimmune uveitis, and model of the experimental autoimmune uveitis (EAU) in mice, including the unique gnotobiotic model, will be used. The experimental results will be compared to those from clinical research of patients with autoimmune uveitis. The acquired data will contribute to the definition of new therapeutic strategies in human uveitis and thus help to attain a higher quality of prevention of blindness in affected patients.

Mechanismus vzniku autoimunitního procesu je stále předmětem intenzívního výzkumu. Jedna z hypotéz určuje za spouštěcí prvek u geneticky predisponovaných jedinců infekční proces. Hlavním cílem navrhovaného projektu je získat nové poznatky o mechanismu vzniku a možnostech ovlivnění zrak-ohrožující autoimunitní uveitidy. Zvláštní důraz bude kladen na objasnění vlivu mikroorganismů (včetně komensálních) a podíl vrozené imunity v procesu uveitidy a na jejich cílenou regulaci. K dosažení těchto cílů bude využita analýza nitroočních tekutin, séra a mikrobiomu pacientů s autoimunitní uveitidou a model experimentální autoimunitní uveitidy (EAU) u myši, včetně unikátního modelu gnotobiotického. Výsledky získané z pokusů na experimentálním modelu budou porovnány s klinickým výzkumem u pacientů s autoimunitní uveitidou. Získané poznatky přispějí k navržení nového léčebného protokolu uveitid v humánní medicíně, a tím k dosažení vyšší kvality prevence slepoty následkem uveitidy.

• MeSH
• autoimunitní nemoci mikrobiologie   MeSH
• Escherichia coli MeSH
• gnotobiologické modely MeSH
• lidé MeSH
• mikrobiota MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• myši MeSH
• přirozená imunita MeSH
• probiotika terapeutické užití   MeSH
• uveitida mikrobiologie   MeSH
• zánět prevence a kontrola   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• myši MeSH

• Konspekt
• Ortopedie. Chirurgie. Oftalmologie
• NLK Obory
• oftalmologie
• alergologie a imunologie
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Valid prediction of response to chemotherapy in ovarian cancer patients as an important part of treatment has not been possible so far. However, it appears that some tumor subgroups, defined by molecular, expressional or other functional patterns, have similar and unique features and biological behavior. Combination of detectable functional changes (loss or overexpression of proteins) i ntumor cells, some morphological characteristics, somatic gene mutations or rearrangements and epigenetic changes may define such a pattern typical for a subgroup with specific biological behavior, i.e. with different response to systemic treatment (chemotherapy +/- targeted treatment). Tumors with hereditary inactivation of the BRCA1 or BRCA2 genes represent a group with specific biological features and behavior, which cannot be distinguished morphologically only. Mapping of morphology, protein expression, genetic and epigenetic changes in specific groups of BRCA1/2 positive tumors may lead to identification of tumor subtypes with different response to systemic treatment.

Predikce odpovědi na chemoterapii jako důležitou složku léčby nebyla dosud u ovariálního karcinomu možná. Některé skupiny nádorů jsou však zřejmě definovány molekulárním, expresním, nebo jiným funkčním vzorcem a vykazují podobné a jedinečné vlastnosti. Kombinace detekovatelných funkčních změn (výpadků nebo nadprodukce některých proteinových produktů) v nádorových buňkách, některých morfologických znaků, somatických mutací nebo větších genových přestaveb a epigenetických změn může definovat vzorec typický pro nádory s různým biologickým chováním, tedy i s odlišnou odpovědí na systémovou léčbu (chemoterapie +/- cílená léčba). Nádory s hereditární mutací genů BRCA1 a BRCA2 představují právě takovou skupinu se specifickým biologickým chováním, kterou nelze odlišit pouze morfologicky. Mapování morfologických, expresních, genetických a epigenetických změn ve skupnách nádorů definovaných přítomností, nebo nepřítomností defektů genů BRCA1 a BRCA2 může vést k identifikaci podtypů nádorů s různou odpovědí na systémovou léčbu.

• MeSH
• geny BRCA1 MeSH
• geny BRCA2 MeSH
• imunohistochemie MeSH
• kritéria léčebné odpovědi MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory cystické, mucinózní a serózní farmakoterapie   genetika   MeSH
• nádory vaječníků farmakoterapie   genetika   MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Hemodynamic assessment of coronary stenosis improves a patient’s prognosis and decreases the long-term costs of coronary intervention in a two-year follow-up period.These methods are used far less then recommended. Likely reasons for this are the high price of Adenosin and occasional ambiguity in fractional flow reserve (FFR) results. A newer method, called instantaneous wave-free ratio (iFR), has been studied less. Furthermore, the correlation between these methods (FFR-iFR) is between 80-90%, which means that different results can be achieved by assessing the same patient with both methods. The purpose of this study is to use a new method--developed and validated in animal trials in author’s workplace together with The University of Iowa--to explain discrepancies between FFR and iFR. A further target is development of a new version of the software used that can improve accuracy and reliability of FFR/iFR by using analysis of microvascular resistance in real time. This could result in more frequent usage of such methods, bringing advantages for patients and health-care providers.

Funkční hodnocení koronárních stenóz zlepšuje prognózu pacientů a snižuje náklady na koronární intervence v horizontu dvou let. Přesto jsou tato vyšetření prováděna v malém počtu. Příčinou je, kromě ceny adenosinu, někdy i nejednoznačná interpretace frakční průtokové rezervy (FFR). Novější metoda tzv. „iFR“ je limitována menším počtem dat. Navíc je korelace obou metod v rozmezí 80-90%, což znamená, že u stejného pacienta někdy poskytují různá doporučení. Cílem studie je využití nové technologie, která vznikla na řešitelském pracovišti ve spolupráci s The University of Iowa v USA a byla validována na zvířecím modelu, k vysvětlení neshod mezi FFR a iFR. Dalším cílem je vývoj nové verze technologie, která by mohla vylepšit přesnost obou metod, a to na základě analýzy mikrovaskulární rezistence v reálném čase. Výsledky tohoto projektu mohou vést ke zpřesnění funkčního hodnocení stenóz koronárních tepen a odstranění nejednoznačných nálezů. Tím by mohlo dojít k navýšení počtu těchto vyšetření v klinické praxi se všemi výhodami, které z toho pro pacienty i nemocnice vyplývají.

• MeSH
• cévní endotel MeSH
• frakční průtoková rezerva myokardu MeSH
• koronární stenóza diagnóza   MeSH
• lidé MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• optická koherentní tomografie MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH
• Publikační typ
• hodnotící studie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• kardiologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Metabolic syndrome-a risk factor for arteriosclerosis and diabetes type 2- is one of the major population health burdens while homocystinurias are rare genetic disorders complicated also by vascular disease. These seemingly unrelated conditions, however, have been both linked to disturbed metabolism of sulfur compounds including cysteine and hydrogen sulfide. We will use targeted metabolomics approach for determination of compounds related to cysteine metabolism (including markers of hydrogen sulfide synthesis and catabolism) in plasma samples obtained from patients with homocystinurias, obese patients and controls, and in cultured human cells; to get further insight into organ-specific changes we will complement research in humans by studying tissues from animal models. This project will elucidate the role of cysteine and hydrogen sulfide in selected diseases and will facilitate development of novel personalized approaches to treat metabolic syndrome or its components, and to ameliorate complications in homocystinurias by targeting specific parts of relevant metabolic pathways.

Metabolický syndrom je rizikový faktor pro atherosklerózu a diabetes 2.typu a patří mezi populačně významné stavy, naproti tomu homocystinurie s postižením cévního systému patří mezi vzácné genetické nemoci. U obou těchto zdánlivě nesouvisejících chorob však byly nalezeny změny v metabolismu cysteinu i sirovodíku. Ve studii použijeme metody cílené metabolomiky pro stanovení látek souvisejících s metabolismem cysteinu (včetně látek odrážejících syntézu a katabolismus sirovodíku) ve vzorcích plasmy získaných od pacientů s homocystinuriemi, obézních pacientů a kontrol, a dále v kultivovaných lidských buňkách. Pro porozumění orgánově specifickým změnám doplníme výzkum na humánních vzorcích studiem tkání u zvířecích modelů. Řešení tohoto projektu objasní detailně úlohu cysteinu a sirovodíku u dvou skupin nemocí a umožní tak vývoj nových postupů personalizované medicíny zacílených na určitá místa metabolických drah; tyto postupy budou využitelné při léčbě metabolického syndromu či jeho komponent a pro zmírnění komplikací u pacientů s homocystinuriemi.

• MeSH
• cystein metabolismus   MeSH
• homocystinurie etiologie   metabolismus   MeSH
• kultivované buňky MeSH
• lidé MeSH
• metabolický syndrom etiologie   metabolismus   MeSH
• metabolomika MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• sulfan metabolismus   MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• vnitřní lékařství
• neurologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Congenital Disorders of Glycosylation (CDG) represents a large group of severe inherited metabolic diseases that are caused by impaired biosynthesis of glycoproteins and glycolipids.The complexity of glycosylation pathways determines the occurrence of a large number of CDG types - currently more than 100 were described. Glycoproteins constitutes more than 50% of total protein. Their impaired biosynthesis has critical impact on the functioning of the whole organism and manifests with severe clinical symptoms with high child mortality (about 25%). The project aims are i) to elucidate the etiology of the disease in patients with suspected CDG to provide early genetic counseling in affected families; ii) to analyse profile of dolichol metabolites in the urine in order to extend the selective CDG screening in CR; iii) to study the impact of CDG on the energetic metabolism with effort to understand the pathophysiology of disease; iii) to study impaired glycosylation in the background of various pathologies in order to find a specific biomarker reflecting the current state of nutrition.

Dědičné poruchy glykosylace (CDG) představují rozsáhlou skupinu závažných dědičných metabolických onemocnění, které jsou způsobeny poruchou biosyntézy glykoproteinů a glykolipidů Složitost glykosylačních drah předurčuje výskyt velkého množství typů CDG – v současnosti jich bylo popsáno >100 a jsou objevovány stále nové. Glykoproteiny tvoří >50 % všech proteinů s obrovskou funkční rozmanitostí, jejich porušená biosyntéza má kritický dopad na fungování celého organismu. Projevuje se vážnými klinickými příznaky s vysokou mírou dětské úmrtnosti (cca 25%). Cílem projektu je: a) objasnit etiologii nemoci u pacientů s podezřením na CDG s cílem umožnit včasné genetické poradenství v postižených rodinách; b) zavedením analýzy profilu isoforem dolicholů v moči rozšířit spektrum selektivního skríningu CDG chorob v ČR; c) studovat dopad poruch glykosylace na energetický metabolismus se snahou přesněji pochopit rozvoj nemoci;.d) studovat biochemické souvislosti dysregulace glykosylace na pozadí různých patologických stavů s cílem najít specifický biomarker odrážející aktuální stav výživy

• MeSH
• biologické markery MeSH
• časná diagnóza MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• dolichol moč   MeSH
• energetický metabolismus MeSH
• lidé MeSH
• mitochondrie MeSH
• nutriční stav MeSH
• vrozené poruchy glykosylace diagnóza   etiologie   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• vnitřní lékařství
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The main goal of this project proposal is to solve selected questions related to the biology and therapy of mantle cell lymphoma (MCL), a prognostically adverse subtype of B-cell non-Hodgkin lymphoma. The project will contribute to elucidation of: 1. prognostic significance of somatic gene mutations recurrently detected in MCL using a homogenously-treated cohort of newly diagnosed patients, 2. clonal evolution of MCL associated with lymphoma progression or relapse, 3. prognostic significance of minimal residual disease (MRD) in the era of maintenance rituximab, 4. predictive markers of sensitivity of MCL cells to venetoclax and identification of optimal treatment combination between venetoclax and anticancer agents clinically or experimentally used for salvage therapy of relapsed MCL, and 5. characterization of new PDX (patient derived xenograft) models and MCL cell lines derived from MCL patients after failure of targeted therapies.

Navrhovaný projekt je zacílen na řešení vybraného okruhu otázek týkajících se biologie a léčby lymfomu z plášťových buněk (mantle cell lymfom, MCL), prognosticky nepříznivého podtypu nehodgkinského B-lymfomu. V rámci předkládaného projektu hodláme přispět k: 1. objasnění prognostického významu somatických mutací rekurentně nacházených u pacientů s nově dg. MCL léčených standardně užívanými imunochemoterapeutickými režimy, 2. odhalení molekulárně-cytogenetických změn provázejících návrat lymfomu či molekulárních aberací asociovaných s lékovou rezistencí, 3. objasnění významu stanovení a kvantifikace minimální reziduální choroby (MRD) v éře udržovací imunoterapie rituximabem, 4. identifikaci molekulárních mechanismů předvídajících citlivost / rezistenci lymfomových buněk na nově zaváděné léčivo venetoclax a odhalení optimální protinádorové kombinace venetoclaxu a dalších proti-lymfomových látek, a 5. provést robustní charakterizaci nově odvozených buněčných linií a myších PDX (patient-derived xenograft) modelů MCL.

• Klíčová slova
• venetoclax,
• MeSH
• chemorezistence MeSH
• heterografty MeSH
• lidé MeSH
• lymfom z plášťových buněk diagnóza   farmakoterapie   MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• mutace MeSH
• myši MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádorové buněčné linie MeSH
• prognóza MeSH
• protinádorové látky imunologicky aktivní terapeutické užití   MeSH
• protokoly antitumorózní kombinované chemoterapie MeSH
• recidiva MeSH
• reziduální nádor MeSH
• rituximab MeSH
• zvířata MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• myši MeSH
• zvířata MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) is the causative agent of syphilis. More than 10 million of new syphilis cases are diagnosed annually. Two different typing systems were established for molecular characterization of TPA clinical isolates, however, their typing efficiency and discriminatory power was found to be highly variable. The aim of this project is to develop a new, highly effective molecular typing scheme preferentially targeting sequences encoding proteome differences, since they can be the cause of different clinical manifestation. The discrimination power of the new typing system will be assessed on genetically diverse clinical isolates and strains of different geographical origin. The knowledge of genetic differences of contemporary syphilis strains is essential due to continuing efforts of syphilis vaccine development. The new typing scheme will be applied on clinical samples from Czech Republic to obtain the information about variability and number of particular genotypes in the Czech Republic. Molecular data will be correlated with epidemiological data.

Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) je původcem venerického onemocnění syfilis. Celosvětově je ročně diagnostikováno přes 10 milionů nových případů syfilis. S rozvojem genomiky došlo k vývoji dvou molekulárně-typizačních systémů pro charakterizaci klinických kmenů TPA, avšak jejich účinnost typování a rozlišovací schopnost značně kolísá. Cílem tohoto projektu je vytvořit nový, vysoce spolehlivý a účinný molekulární typovací systém, zaměřený na sekvence kódující proteomické rozdíly mezi TPA kmeny, které mohou být důvodem rozdílné klinické manifestace. Rozlišovací schopnost typovacího systému bude testována na geneticky odlišných klinických izolátech a vzorcích pocházejících z různých míst světa. Znalost genetické podstaty současných klinických kmenů TPA je zásadní i z hlediska pokračujících snah o vývoj vakcíny proti syfilis. Aplikace nového typovacího systému na klinické kmeny z České republiky přinese informace o odlišnosti a zastoupení jednotlivých genotypů TPA na našem území. Molekulární data budou korelována s dostupnými epidemiologickými údaji.

• MeSH
• lidé MeSH
• molekulární typizace metody   MeSH
• proteomika MeSH
• syfilis diagnóza   genetika   mikrobiologie   MeSH
• Treponema pallidum genetika   izolace a purifikace   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• bakteriologie
• dermatovenerologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR