- MeSH
- albuminurie diagnóza etiologie MeSH
- diabetické nefropatie * diagnóza etiologie metabolismus MeSH
- experimenty na zvířatech * MeSH
- glutathion izolace a purifikace metabolismus MeSH
- metabolomika metody MeSH
- oxidační stres imunologie účinky léků MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí metody využití MeSH
- potkani inbrední SHR MeSH
- produkty pokročilé glykace izolace a purifikace metabolismus MeSH
- proteomika metody MeSH
- pyruvaldehyd * metabolismus škodlivé účinky terapeutické užití MeSH
- stanovení celkové genové exprese metody využití MeSH
- vysokoúčinná kapalinová chromatografie metody využití MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Cíl práce: Zahájením pravidelného očkování se výskyt epidemické parotitidy v ČR významně snížil. V posledních letech je však pozorován zvýšený počet onemocnění, a to i v očkované populaci, která tvoří převážnou část nemocných. Cílem této studie bylo zjistit, zda vysoká nemocnost vakcinovaných je důsledkem primárního nebo sekundárního selhání vakcinace pomocí testování avidity IgG protilátek a zda je rozdíl v aviditě anamnestických protilátek mezi vakcinovanými a přirozeně promořenými. S ohledem na problematickou laboratorní diagnostiku příušnic ve vysoce proočkované populaci byla posuzována i výpovědní hodnota stanovení IgM, IgA a IgG protilátek a možnost využití avidity pro zkvalitnění laboratorního průkazu z jednoho vzorku krve jako nejčastěji vyšetřovaného klinického materiálu při podezření na onemocnění příušnicemi. Materiál a metody: Do studie byl zahrnut soubor 64 pacientů s laboratorně potvrzeným onemocněním příušnicemi a známým vakcinačním stavem (soubor 1 a 2). Současně byl vyšetřen soubor 30 zdravých přirozeně promořených osob (soubor 3) a soubor 22 vakcinovaných 2–4letých dětí bez etiologické souvislosti s virem příušnic (soubor 4). Pro stanovení indexu avidity (IA) byla využita souprava Enzygnost Anti-Mumps/IgG, Siemens a 6M urea, která má schopnost vyvolat disociaci vazby antigen-protilátka, úměrnou aviditě protilátek. Protilátky IgM, IgG a IgA byly testovány soupravami Enzygnost Anti-Mumps/IgM a /IgG, Siemens a Mastazyme Mumps IgA, Mast Diagnostica. Jako zdroj epidemiologických údajů byl využit systém EPIDAT. Výsledky: Výsledky vyšetření studovaného souboru ukázaly, že virus příušnic indukuje protilátky s nízkým IA jak po vakcinaci, a to i nedávné, tak i po přirozené infekci. Vysokoavidní protilátky byly detekovány pouze v rekonvalescentních sérech vakcinovaných osob nebo u reinfekcí osob přirozeně promořených, a to v souvislosti s recentním stykem s virem příušnic. Porovnáním výsledků vyšetření akutních sér bylo zjištěno, že u vakcinovaných bylo na základě IgA pozitivity laboratorně potvrzeno 56 % případů, což je o 20 % více než při rutinně prováděném vyšetření pomocí IgM protilátek, u nevakcinovaných bylo 87 % IgA a 74 % IgM pozitivních případů. Závěr: Výsledky avidity IgG protilátek svědčí pro to, že vysoká nemocnost vakcinovaných je důsledkem sekundárního selhání vakcinace označovaného též jako vyvanutí imunity. Diagnostické využití avidity je přínosné při vyšetření rekonvalescentních sér a/nebo akutních sér s odběrem od 6. dne po začátku onemocnění, a to u vakcinovaných či přirozeně promořených osob, kdy dochází k signifikantnímu nárůstu IA. Srovnáním sérologických metod na stanovení IgM, IgG a IgA protilátek v akutním séru bylo zjištěno, že nejvyšší průkaznosti infekce virem příušnic bylo dosaženo na základě pozitivity IgA protilátek. Zařazení této sérologické metody výrazně zefektivnilo laboratorní diagnostiku příušnic, a to zejména u vakcinovaných osob.
Aim: Regular vaccination against mumps resulted in a significant reduction in epidemic mumps in the Czech Republic. However, mumps cases have recently shown an upward trend, even in the vaccinated population where a considerable proportion of cases have occurred. The aim of this study was to find out, by mumps virus IgG antibody avidity testing, whether the high incidence of mumps in the vaccinated population is a result of primary or secondary vaccine failure and whether the vaccinated differ from the naturally immunised in anamnestic antibody avidity. Given the problematic laboratory diagnosis of mumps in the population with high vaccination coverage, the informative value of the detected IgM, IgA, and IgG antibodies was also considered as well as the potential of antibody avidity testing for improving laboratory diagnosis from a single sample of blood, the most commonly analysed clinical material, in patients with suspected mumps. Material and methods: Sixty-four patients laboratory confirmed with mumps, whose vaccination status was known, were included in the study (groups 1 and 2). Other study groups were 30 healthy naturally immunised subjects (group 3) and 22 vaccinated children 2–4-years of age with no etiological link to the mumps virus (group 4). The avidity index (AI) was determined using the Siemens Enzygnost Anti-Mumps/IgG kit and 6M urea, able to induce the dissociation of antigen-antibody bonds proportionally to the antibody avidity. IgM, IgG, and IgA antibodies were tested using the Siemens Enzygnost Anti-Mumps/IgM and /IgG, and Mast Diagnostica Mastazyme Mumps IgA kits. The EPIDAT system served as the data source. Results: The results showed that the mumps virus induces antibodies with a low AI after both vaccination, even recent, and natural immunisation. Antibodies with a high AI were only detected in convalescent sera of the vaccinated patients or in re-infected, naturally immunised persons, as a result of recent contact with the mumps virus. The comparison of the results of acute sera testing revealed that in the vaccinated patients, 56% of cases were laboratory confirmed based on IgA positivity, i.e. 20% more cases in comparison with routine detection of IgM antibodies, while of unvaccinated cases, 87% were IgA positive and 74% IgM positive. Conclusion: The results of mumps virus IgG antibody avidity testing suggest that the high proportion of cases in the vaccinated patients result from secondary vaccine failure, also known as waning immunity. Diagnostic benefit from antibody avidity testing has been observed in convalescent sera and/or acute sera from both vaccinated and naturally immunised patients collected from day 6 after the onset of the disease when significant increase in AI occurs. The comparison of the serological methods for the detection of IgM, IgG, and IgA antibodies in acute sera revealed that the highest percentage of mumps infection was detected by IgA antibody testing. The addition of this serological method to mumps laboratory diagnosis made the latter considerably more effective, particularly in the vaccinated patients.
- MeSH
- afinita protilátek MeSH
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- imunoglobulin A analýza krev MeSH
- imunoglobulin G * analýza krev MeSH
- imunoglobulin M analýza krev MeSH
- lidé MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí přístrojové vybavení využití MeSH
- předškolní dítě MeSH
- příušnice * diagnóza epidemiologie krev MeSH
- sérologické testy využití MeSH
- vakcína proti příušnicím terapeutické užití MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- dospělí MeSH
- lidé MeSH
- předškolní dítě MeSH
Leptin down-regulates orexigenic and up-regulates anorexigenic neuropeptide gene expression in hypothalamus. Surgical removal of adipose tissue leads to decrease in circulating leptin concentrations in rats. In the present study, we tested: (a) regulation of neuropeptide gene expression in hypothalamus, (b) food intake, and (c) standard growth rate after removal of adipose tissue in rats. Partial lipectomy caused an approximately 10-fold reduction of subcutaneous, retroperitoneal and epididymal adipose tissue weight (at the end of experiments adipose tissue weight was 1.5 ± 0.9 in lipectomy and 15 ± 3.9 g in control rats; statistically significant). Compared to control rats, the animals subjected to lipectomy presented increased food intake, standard growth rate, and decreased serum leptin concentrations (2.6 ± 0.8 vs. 3.7 ± 1.2 ng/mL in the controls, statistically significant). These changes were associated with approximately twofold increase in neuropeptide Y, threefold increase in agouti-related peptide (orexigenic neuropeptides) and about 50% decrease in pro-opiomelanocortin and cocaine–amphetamine-regulated transcript peptide (anorexigenic neuropeptides) mRNA levels in the hypothalamus. These results suggest that partial lipectomy, leading to a decrease in circulating leptin concentrations, may exert an effect on hypothalamic orexigenic and anorexigenic neuropeptide gene expression, and consequently modulate food intake and standard growth rate in rats.
- MeSH
- AGRP protein genetika izolace a purifikace metabolismus MeSH
- bílá tuková tkáň chirurgie metabolismus účinky léků MeSH
- biomedicínský výzkum metody trendy MeSH
- experimenty na zvířatech MeSH
- hypothalamus * účinky léků zranění MeSH
- kokain analogy a deriváty izolace a purifikace MeSH
- leptin izolace a purifikace krev MeSH
- lipektomie * metody využití MeSH
- neuropeptid Y genetika metabolismus MeSH
- peptidové hormony genetika izolace a purifikace metabolismus MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí metody využití MeSH
- potkani Wistar MeSH
- pro-opiomelanokortin genetika izolace a purifikace metabolismus MeSH
- regulace genové exprese * fyziologie genetika účinky léků MeSH
- statistika jako téma MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- mužské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Východiská: V uvedenej práci sme sa zamerali na výskyt a prognostickú hodnotu niekoľkých významných genetických markerov u pacientov s diagnózou akútnej myeloblastovej leukémie (acute myeloid leukemia –AML). Pacienti a metódy: Vyšetrených bolo 90 pacientov s AML: 42 mužov (priemerný vek 54,5 rokov) a 49 žien (priemerný vek 59 rokov). Genetická analýza leukemických vzoriek bola realizovaná pomocou konvenčnej cytogenetiky, interfázovej fluorescenčnej in situ hybridizácie ako aj štandardizovaného RT‑PCR protokolu. Výsledky: V 34,4 % pacientov sme zistili aspoň jeden z analyzovaných genetických markerov s výnimkou translokácie CBFB‑MYH11, ktorú sme nezaznamenali. Translokácia t(8;21)/AML1‑ETO bola zachytená v 4,4 % pacientov s priemerným vekom 45,4 rokov, pričom žiadny z týchto pacientov nebol starší ako 55 rokov. Translokácia t(15;17)/PML‑RARA bola potvrdená v 5,5 % pacientov s priemerným vekom 52,6 rokov a takmer rovnakým podielom mladších a starších pacientov. Prestavby MLL génu boli potvrdené v 6,6 % pacientov, aberácie typu –5/5q–a/alebo –7/7q– zachytené v 7,7 % pacientov, pričom najčastejšou genetickou abnormalitou v našej štúdii bola trizómia chromozómu 8 (10 %). Navyše sme zistili priaznivý klinický priebeh u pacientov exprimujúcich fúzne gény AML1-ETO, alebo PML‑RARA na rozdiel od nepriaznivého klinického priebehu u pacientov s prestavbami MLL génu a deléciami –5q/–5 a –7q/–7. U pacientov s potvrdenou trizómiou chromozómu 8 pozorujeme stredne dobrú prognózu. Záver: Zistili sme súlad medzi našími a publikovanými výsledkami v incidencii a prognostickej hodnote niekoľkých dobre definovaných genetických aberácii asociovaných s AML. Táto jednoduchá geneticky‑orientovaná klasifikácia nám pomáha rozdeliť pacientov na tých s dobrou, strednou a zlou prognózou a zabezpečiť im následne najlepšiu momentálne dostupnú liečbu. Avšak, zlý klinický priebeh predovšetkým u pacientov so zlou prognózou, jasne poukazuje na potrebu hľadania nových genetických faktorov ochorenia AML pre zabezpečenie vývoja lepších terapeutikých ako aj diagnostických postupov. Kľúčové slová: akútna myeloblastová leukémia – genetické aberácie – fúzne gény – cytogenetika – výskyt – klinický priebeh Táto práca bola podporená grantom z Európskeho Regionálneho Rozvoja OPVaV-2009/2.2/05-SORO (ITMS kód: 26220220143). Autoři deklarují, že v souvislosti s předmětem studie nemají žádné komerční zájmy. Redakční rada potvrzuje, že rukopis práce splnil ICMJE kritéria pro publikace zasílané do biomedicínských časopisů. Obdržané: 15. 10. 2013 Prijaté: 29. 1. 2015
Background: In this work, we evaluated the incidence and prognostic value of several genetic aberrations in patients with a diagnosis of acute myeloid leukemia (AML). Patients and Methods: We analysed 90 patients: 42 males (mean age 54.5 years) and 48 females (mean age 59 years), with AML. The genetics of all leukemia samples was studied using conventional cytogenetics, the interphase fluorescence in situ hybridisation as well as the standardized RT‑PCR protocol. Results: In 34.4% of patients, we detected at least one of the analysed genetic aberrations, except the CBFB‑MYH11, which we did not detect. Translocation t(8;21)/AML1‑ETO was found in 4.4% of patients with a mean age of 45.4 years, while none of these patients was older than 55 years. Translocation t(15;17)/PML‑RARA was found in 5.5% of patients with a mean age of 52.6 years and an almost equal distribution between younger and older patients. The MLL gene rearrangements were found in 6.6% of patients, the –5/5q– and/or –7/7q– aberrations in 7.7% of patients, while the most frequent genetic abnormality in our study was trisomy 8 (10%). Moreover, we found a favorable clinical outcome in patients expressing fusion genes AML1-ETO or PML‑RARA in contrast to an adverse clinical outcome with few remissions and death in AML patients with MLL, –5q/–5 and –7q/7–. Finally, an intermediate prognosis was found in patients with trisomy 8. Conclusion: In this study, we found a good congruence with published literature on the incidence and prognostic value of several well established AML‑associated genetic aberrations. This simple genetic‑based classification system helps us to identify patients with a favorable, intermediate or unfavorable prognosis and to treat them with the best currently available therapy. However, analysis of new genetically defined abnormalities in AML is necessary for development of better therapeutic strategies and/or diagnostics.
- MeSH
- akutní lymfatická leukemie * genetika MeSH
- chromozomální aberace * MeSH
- cytogenetické vyšetření metody využití MeSH
- dospělí MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční využití MeSH
- incidence MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- nádorové biomarkery genetika MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí využití MeSH
- prognóza MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- translokace genetická MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mladý dospělý MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Rotavírusy sú najčastejšou príčinou závažných hnačkových ochorení u dojčiat a malých detí na celom svete, vrátane európskych krajín. Rotavírusovú gastroenteritídu prekonajú prakticky všetky deti do 5 rokov. Vo vyspelých krajinách je problémom pre vysoký výskyt ochorenia, častejšiu potrebu hospitalizácie ako iné akútne gastroenteritídy a ako najčastejšia príčina nozokomiálnych infekcií u detí. Najlepšiou ochranou pred rotavírusovou infekciou je očkovanie. Vakcíny sú vysoko účinné pri ochrane pred závažnou infekciou u detí v prvých rokoch života. V Slovenskej republike bolo v roku 2013 zaočkovaných 17,5 % dojčiat. Pri takejto miere zaočkovanosti nemožno počítať s podstatným znížením chorobnosti (v rokoch 2009–2013 je priemerná chorobnosť 840,1/100 000; rozpätie 643,5/100 000–1125,3/100 000) ani s ovplyvnením nozokomiálneho prenosu na detských oddeleniach (proporcia nozokomiálneho výskytu je priemerne 16,2 %; rozpätie 11,7–23,6 %) z detí do 5 rokov hospitalizovaných s dg. rotavírusová gastroenteritída.
Rotaviruses are the most common cause of severe diarrheal diseases in infants and children all around the world, including European countries. Virtually all children under 5 years old overcome Rotavirus gastroenteritis (RVGE) at some point. The problem in developed countries is the high incidence of the disease and more frequent need of hospitalization than any other acute gastroenteritis and as the most frequent cause of nosocomial infection in children. Rotavirus vaccination is the best way to protect children against rotavirus disease. The vaccines are very effective at preventing severe rotavirus disease in infants and young children. 17, 5 % of infants were vaccinated against rotavirus infection in 2013 in Slovak Republic. A significant decrease of incidence should not be expected with such vaccination ratio (during 2009–2013 the average incidence was 840.1/100 000; the span 643.5/100 000–1125.3/100 000) nor should there be any expectations regarding influencing the nosocomial transmission in paediatric wards (proportion of nosocomial incidence is on average 16.2 %; span 11.7–23.6 %) in children under 5 years old hospitalized with rotavirus gastroenteritis diagnosis.
- Klíčová slova
- Vakcíny Rotarix a RotaTek, mezinárodní porovnání,
- MeSH
- dehydratace diagnóza prevence a kontrola terapie MeSH
- elektronová mikroskopie MeSH
- ELISA MeSH
- Evropská unie MeSH
- gastroenteritida * diagnóza etiologie virologie MeSH
- klinické laboratorní techniky metody využití MeSH
- klinický obraz nemoci MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí metody využití MeSH
- předškolní dítě MeSH
- rotavirové infekce * diagnóza farmakoterapie prevence a kontrola MeSH
- statistika jako téma MeSH
- vakcinace metody využití MeSH
- vodní a elektrolytová nerovnováha diagnóza prevence a kontrola terapie MeSH
- Check Tag
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- předškolní dítě MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Slovenská republika MeSH
Cílem práce bylo zavedení molekulární real-time PCR metodiky doporučené CDC (Centers for Disease Control and Prevention) pro účely detekce bakterií Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae a Streptococcus pneumoniae v klinických (kultivačně negativních) vzorcích při podezření na invazivní bakteriální onemocnění. Klinické vzorky jsou zasílány do NRL pro meningokokové nákazy Oddělení bakteriálních vzdušných nákaz CEM SZÚ z různých regionů České republiky. Jedná se především o likvor, nesrážlivou krev či sérum, výjimečně sekční materiál. NRL má zavedenou molekulární diagnostiku těchto bakteriálních původců menigitid a sepsí z klinických vzorků již od roku 1999. Původně se jednalo o seminested polymerázovou řetězovou reakci s elektroforetickým vyhodnocením. V roce 2014 byla implementována molekulární metoda real-time PCR s kvalitativním hodnocením.
The study aim was to implement a molecular real-time polymerase chain reaction (PCR) assay recommended by the CDC (Centers for Disease Control and Prevention) for the detection of Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, and Streptococcus pneumoniae in clinical (culture negative) specimens from patients with suspected invasive bacterial disease. Clinical specimens are referred to the National Reference Laboratory (NRL) for Meningococcal Infections, Unit for Airborne Bacterial Infections, Centre for Epidemiology and Microbiology, National Institute of Public Health from various regions of the Czech Republic. Clinical specimens are, in particular, cerebrospinal fluid, anti-coagulated blood or serum and, exceptionally, post-mortem specimens. The NRL has implemented molecular diagnosis of these bacterial pathogens involved in meningitis and sepsis from clinical specimens since 1999. The first diagnostic method was semi-nested PCR followed by electrophoretic analysis. In 2014, a molecular qualitative real-time PCR assay was implemented.
- MeSH
- DNA bakterií analýza MeSH
- Haemophilus influenzae * genetika izolace a purifikace MeSH
- lidé MeSH
- Neisseria meningitidis * genetika izolace a purifikace MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí využití MeSH
- reprodukovatelnost výsledků MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Streptococcus pneumoniae * genetika izolace a purifikace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Cíle studie: Získat prvotní zkušenosti s alternativním odběrem vzorku (samoodběrem) pro testování přítomnosti HPV za účelem skríninku karcinomu děložního čípku. Typ studie: Původní práce. Název a sídlo pracoviště: Ústav molekulární a translační medicíny, LF UP a FN Olomouc. Metodika: Na základě předem projeveného zájmu o HPV vyšetření byly 215 ženám zaslány samoodběrové sady Evalyn? Brush. Cervikovaginální stěry obdržené poštou byly analyzovány v naší laboratoři na přítomnost HPV infekce systémem Cobas 4800 HPV (Roche) s následnou genotypizací pomocí PapilloCheck? HPV-Screening (Greiner Bio-One). Náhodně vybraným 60 ženám z našeho souboru byl společně se samodběrovou sadou zaslán dotazník zaměřený na jejich zkušenost se samoodběrem. Výsledky: Z rozeslaných 215 samoodběrových sad bylo k analýze doručeno 174 (81 %) cervikovaginálních stěrů. Všechny vzorky byly odebrány správně a bylo možné je vyšetřit Cobas 4800 HPV testem. PapilloCheck? HPV-Screening systémem bylo možné za zisku validního výsledku vyšetřit 98 % vzorků (171/174). Z vyšetřených 174 vzorků bylo 125 vzorků (72 %) HPV negativních, u 7 vzorků (4 %) byla detekována pouze přítomnost nízkorizikové HPV infekce a u 42 vzorků (24 %) jsme detekovali přítomnost vysokorizikové HPV infekce. Nejčastěji detekovanými vysoce rizikovými genotypy byly HPV 16 (11/42; 26 %) a HPV 53 (6/42; 14 %). V 10 případech byla detekována současná infekce několika hrHPV, v 5 z nich byla nalezena současně infekce lrHPV. Z 60 odeslaných dotazníků bylo zasláno zpět 48 (80 %). Z této skupiny ohodnotilo svou zkušenost se samoodběrovou sadou jako dobrou až výbornou 47 (98 %) dotázaných žen. Návod k použití Evalyn? Brush byl považován za dobrý až vynikající všemi ženami (100 %). Všechny ženy také ohodnotily použití samoodběrové sady jako dobré až vynikající. Podle očekávání většina žen z našeho souboru (n = 42 [88 %]) dává přednost samoodběru před odběrem vzorku lékařem. Závěr: Samoodběr cervikovaginálního stěru vede při použití dvou testovaných molekulárně genetických metod k validním výsledkům a byl českými ženami velmi dobře přijat. Zavedení samoodběru jako způsobu účasti na cervikálním skríninku by mohlo vést ke zvýšení návštěvnosti skríninkového programu karcinomu děložního čípku, a napomohlo by tak ke snížení incidence i mortality tohoto onemocnění v české populaci.
Objective: To get initial experience with alternative sampling (self-sampling) for HPV testing as the means of cervical cancer screening program. Design: Original work. Setting: Institute of Molecular and Translational Medicine, Faculty of Medicine and Dentistry, Palacky University in Olomouc. Methods: Based on expression of interest, 215 self-sampling kits were posted to women. Evalyn? Brush Vaginal swabs obtained by self-sampling were analyzed for the presence of HPV infection by Cobas 4800 HPV (Roche) followed by genotyping using PapilloCheck? HPV-Screening (Greiner Bio-One). Sixty women randomly chosen from our sample were sent a questionnaire focused on their experience with self-sampling. Results: One hundred seventy-four of 215 (81%) distributed self-sampling devices have been delivered to analysis. All cervicovaginal swabs were sampled correctly and it was possible to analyze them by Cobas 4800 HPV test. Similarly, 98% (171/174) samples were analyzable by PapilloCheck? HPV-Screening. One hundred twenty-five (72%) of 174 tested samples were HPV negative. Low risk HPV infection was detected only in 7 samples (4%), and high risk HPV (hrHPV) infection was present in 42 samples (24%). The most frequently detected hrHPV genotypes were HPV16 (11/42; 26%) and HPV53 (6/42; 14%). HrHPV co-infection was detected in 10 cases, in 5 of them lrHPV infection was find also. Of the 60 questionnaires, 48 (80%) were returned. From this group, 47 (98%) women rated their experience with self-sampling device as good to excellent. User manual of self-sampling device was considered good to excellent by all women (100%). All women also rated the convenience of self-sampling device using as good to excellent. As expected, most of the women (n = 42 [88%]) preferred self-sampling to physician sampling. Conclusion: Cervicovaginal self-sampling leads to valid results of HPV screening using two molecular genetics methods and was accepted by Czech women very well. The self-sampling as an opportunity to participate in cervical cancer screening could increase the attendance of the screening program and would help to reduce the incidence and mortality for this disease in the Czech population.
- MeSH
- autoaplikace metody MeSH
- časná detekce nádoru metody přístrojové vybavení MeSH
- cervix uteri virologie MeSH
- genotypizační techniky MeSH
- infekce papilomavirem * diagnóza prevence a kontrola MeSH
- klinické laboratorní techniky * přístrojové vybavení MeSH
- lidé MeSH
- nádory děložního čípku diagnóza prevence a kontrola MeSH
- odběr biologického vzorku metody MeSH
- Papillomaviridae * izolace a purifikace MeSH
- pilotní projekty MeSH
- plošný screening MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí využití MeSH
- prevalence MeSH
- průzkumy a dotazníky MeSH
- spokojenost pacientů MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Úvod: Cílem práce je posoudit význam CEA, EGFR a hTERT jako markerů okultních nádorových buněk v břišní laváži v predikci léčebných výsledků u adenokarcinomu pankreatu, včetně stanovení jejich cut-off hodnot. Metoda: Práce porovnává skupinu 87 pacientů operovaných pro duktální adenokarcinom pankreatu ve stadiu III - IV (UICC) u nichž byl proveden paliativní výkon (biliodigestivní spojka, odběr biologického materiálu pro následnou onkologickou léčbu) s kontrolní skupinou 24 pacientů. U všech pacientů byly odebrány vzorky peritoneální laváže za použití 100 ml fyziologického roztoku (phosphate buffered saline, pH=7,2) do transportních lahví obsahujících 1,5 ml 0,5M EDTA a 10 ml fetálního bovinního séra. Celková RNA všech vzorků byla purifikována a zpracována procesem reverzní transkripce. Okultní nádorové buňky v peritoneální laváži byly detekovány RT-PCR metodou využitím CEA, EGFR a hTERT. Sekundárním cílem studie bylo stanovení cut-off hodnot exprese těchto markerů. Pro statistické analýzy byly použity softwary R (www.r-project.org) a Statistica (StatSoft, Inc., USA). Výsledky: Průměrná exprese CEA, EGFR a hTERT v peritoneální laváži kontrolní skupiny byla 2501, 716749, resp. 104 kopií mRNA/?g RNA. Prahové, cut-off hodnoty, byly stanoveny jako „průměr + 2x směrodatná odchylka“. Hodnoty absolutní exprese byly dále normalizovány na expresi house-keepingového genu glyceraldehdyd-3-fosfát dehydrogenázy (GAPDH). Cut-off hodnoty testovaných markerů po normalizaci byly 4,89; 115,88 resp. 0,02 kopií mRNA genu/kopií mRNA GAPDH. V případě absolutní exprese testovaných markerů, pouze hTERT dokáže statisticky významně (p <0,001) odlišit obě analyzované skupiny, kdy pacienti s pokročilým adenokarcinomem pankreatu mají vyšší hodnotu exprese hTERT. Absolutní exprese CEA ani EGFR nevykazovala statisticky signifikantní rozdíly mezi skupinou s pokročilým karcinomem pankreatu a kontrolní skupinou. Použitím přesnějších - normalizovaných hodnot exprese testovaných markerů byla prokázána statisticky významně vyšší exprese CEA a hTERT (p<0,005, resp. p<0,001) u pacientů s pokročilým adenokarcinomem pankreatu v porovnání s kontrolní skupinou. Závěr: Absolutní exprese hTERT v peritoneální laváži pacientů s pokročilým adenokarcinomem pankreatu byla signifikantně vyšší v porovnání s kontrolní skupinou. Naopak absolutní exprese CEA a EGFR nebyla signifikantně rozdílná.
Introduction: The aim of this study is to assess the significance of CEA, EGFR and hTERT as markers of occult tumor cells for predicting treatment outcomes in pancreatic cancers, as well as determining the cut-off values of these markers individually in peritoneal lavage. Method: The study compared 87 patients undergoing palliative operations (bypass surgery, biological sampling for subsequent oncological treatment) for either stage III or IV (UICC) pancreatic ductal adenocarcinomas with a control group of 24 healthy patients. Abdominal cavity lavage was performed at the beginning of the surgery in both groups, using 100 ml of physiological solution (phosphate buffered saline, pH 7.2). The samples were transported in bottles containing 1.5 ml 0.5 M EDTA and 10 ml of fetal bovine serum. Total RNA samples were all processed and purified by reverse transcription. Occult tumor cells in the peritoneal lavage were detected by the real-time RT-PCR method using CEA, EGFR and hTERT as markers of tumor cells. Another aim was to calculate the cut-off values of these markers. Statistical analysis was done using software R (www.r-project.org) and Statistica (StatSoft, Inc. USA). Results: Mean expression of CEA, EGFR and hTERT in peritoneal lavage in the control group was 2501, 716749 and 104 copies of mRNA / mg RNA. Threshold, cut-off values were determined as the “mean + 2 times standard deviation”. Absolute expression values were further normalized to expression of the house-keeping gene glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH). After normalization, cut-off values of the tested markers were 4.89, 115.88 and 0.02 copies of mRNA/GAPDH mRNA. As regards absolute expression of the markers tested, only hTERT was able to statistically significantly (p<0.001) distinguish the analysed groups, where patients with advanced pancreatic adenocarcinoma had a higher expression of hTERT. Absolute expression of CEA or EGFR was not able to discriminate between the two groups. The more accurate normalized expression values of the test markers demonstrated a statistically significantly higher expression of hTERT (p<0.005) and CEA (p<0.001) in patients with advanced adenocarcinoma compared to the control group. Conclusion: Absolute hTERT expression in peritoneal lavage of patients with advanced pancreatic cancer was significantly higher compared to the control group.
- MeSH
- adenokarcinom * genetika patologie MeSH
- erbB receptory MeSH
- exprese genu MeSH
- karcinoembryonální antigen analýza MeSH
- lidé MeSH
- nádorové biomarkery analýza MeSH
- nádory slinivky břišní * genetika patologie MeSH
- peritoneální výplach využití MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí * využití MeSH
- RNA analýza MeSH
- telomerasa genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Úvod: Virové hemoragické horečky jsou způsobovány zástupci čtyř virových čeledí a patří mezi choroby s velmi vysokou smrtností. Pro jejich diagnostiku není dostupný žádný komerční kit. Výsledky: Vytvořili jsme real time RT-PCR panel pro detekci a identifikaci virů Ebola, Marburg, Lassa, Guanarito, Machupo, Sabiá, Seoul, Puumala, Hantaan, virus krymsko-konžské hemoragické horečky a horečky Rift Valley. Protokol funguje na principu jednotných reakčních podmínek a byl testován na různých PCR přístrojích jak kapilárních, tak i destičkových včetně polní verze termocykleru Ruggedized Advanced Pathogen Identification Device (R.A.P.I.D.) (Idaho Technology, Inc.). Závěr: V kombinaci s adaptovanými protokoly z již publikovaných prací představujeme jednoduchý detekční systém pro rychlou identifikaci původců virových hemoragických horeček z čeledí filoviru, arenavirů a bunyavirů s dostatečnou senzitivitou a specificitou pro použití laboratořích prvního kontaktu a pro diagnostiku v polních podmínkách.
Background: Viral hemorrhagic fevers are caused by viruses from four viral families and develop diseases with high fatality rates. However, no commercial diagnostic assay for these pathogens is available. Findings: We developed real-time RT-PCR assays for viruses Ebola, Marburg, Lassa, Guanarito, Machupo, Junin, Sabiá, Seoul, Puumala, Hantaan, Crimean-Congo hemorrhagic fever virus and Rift Valley fever virus. The assays were optimized for identical reaction conditions and can be performed using several types of real-time PCR instruments, both capillary and plate, including a portable Ruggedized Advanced Pathogen Identification Device (R.A.P.I.D.) (Idaho Technology, Inc.). Conclusions: In combination with primers and probes from previously published studies, we present a simple system for rapid identification of hemorrhagic filoviruses, arenaviruses and bunyaviruses with sufficient sensitivity for first contact laboratory and diagnosis under field conditions.
- MeSH
- hemoragická horečka Ebola diagnóza MeSH
- hemoragické horečky virové * diagnóza klasifikace MeSH
- horečka Lassa diagnóza MeSH
- infekce viry z čeledi Arenaviridae diagnóza MeSH
- lidé MeSH
- marburgská horečka diagnóza MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí * využití MeSH
- RNA analýza MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- zvířata MeSH
Streptococcus pyogenes, celosvětově rozšířený patogen, způsobuje celou řadu neinvazivních a invazivních onemocnění od akutní faryngitidy a impetiga po nekrotizující fascitidu a streptokokový syndrom toxického šoku. Cílem práce bylo stanovení toxigenních profilů metodou polymerázové řetězové reakce v reálném čase (RT-PCR) a emm typizace S. pyogenes pro epidemiologické účely a statistické vyhodnocení vztahu emm typu a genů toxigenního profilu k invazivitě onemocnění. V Národní referenční laboratoři pro streptokokové nákazy Státního zdravotního ústavu v Praze bylo v letech 2011–2012 vyšetřeno celkem 111 izolátů S. pyogenes pětadvaceti různých emm typů a 37 toxigenních profilů (streptokokové pyrogenní exotoxiny A-C, F-M, Z, streptokokový superantigen ssa a streptokokový mitogenní exotoxin Z smeZ). 55 izolátů bylo invazivních a 56 neinvazivních. V uvedeném období prevaloval typ emm1 (31,5 %) následovaný typem emm28 (11,7 %) a typem emm12 (9,9 %). U všech izolátů byl potvrzen streptokokový pyrogenní exotoxin B a F (speB a speF). SpeG a smeZ měla většina kmenů (97,3 % a 92,8 %), ssa byl zjištěn u 8,1 % kmenů a speL u 3,6 % kmenů. Nebyla potvrzena statisticky významná souvislost mezi emm typem a invazivitou izolátů ani mezi toxigenním profilem a invazivitou izolátů.
Streptococcus pyogenes, a globally spread pathogen, is the cause of a wide range of invasive and non-invasive diseases, from acute pharyngitis and impetigo to necrotizing fasciitis and streptococcal toxic shock syndrome. The study objectives were toxigenic profiling of S. pyogenes isolates by real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) and emm typing for epidemiological purposes and analysis of the relationships between emm types, toxigenesis, and disease invasiveness. In 2011-2012, the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections, National Institute of Public Health, analyzed 111 isolates of S. pyogenes assigned to 25 mm types and 37 toxigenic profiles (streptococcal pyrogenic exotoxins A-C, F-M, and Z, streptococcal superantigen ssa, and streptococcal mitogenic exotoxin Z smeZ). Fiftyfive isolates were invasive and 56 were non-invasive. The most prevalent emm type was emm1 (31.5%), followed by emm28 (11.7%) and emm12 (9.9%). All isolates carried genes for streptococcal pyrogenic exotoxin B and F (speB and speF), most isolates (97.3% and 92.8%) harboured speG and smeZ, respectively, 8.1% of isolates were ssa positive, and 3.6% encoded speL. No statistically significant association was found between emm type or toxigenic profile and invasiveness of isolates.
- MeSH
- antigeny bakteriální MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální genetika metody MeSH
- polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí * využití MeSH
- sérotypizace MeSH
- statistika jako téma MeSH
- Streptococcus pyogenes * izolace a purifikace klasifikace patogenita MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- tabulky MeSH