Case studies that focused on methods of genetic testing for breast cancer. Intended for professional public.

• MeSH
• genetické testování MeSH
• genomika MeSH
• nádory prsu genetika   MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika

Publikace se zaměřuje na evoluci, lidskou genetiku, na DNA a její použití. Určeno široké veřejnosti.; Kniha velmi přitažlivou formou představuje genetiku.Prezentuje základní principy dědičnosti, vztah genů a prostředí, vliv dědičnosti na nemoci a chování, také popisuje praktické využití poznatků genetiky v medicíně a farmacii nebo v archeologii a kriminalistice včetně identifikace osob. Snaží se odpovědět na otázku, co nám přinesou nové možnosti genetiky a výzkumu DNA a nastiňuje možnosti i hranice genetiky do budoucna.

• MeSH
• biologická evoluce MeSH
• DNA MeSH
• epigenomika MeSH
• genetické inženýrství MeSH
• genetický kód * MeSH
• genetika člověka MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH
• populární práce MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika

Brožura obsahuje kazuistiky, které se zaměřují na diagnostiku nádorů prsu pomocí technik Mammaprint a Blueprint. Určeno odborné veřejnosti.

• Klíčová slova
• MammaPrint,
• MeSH
• genetické testování MeSH
• genom lidský MeSH
• genomika MeSH
• nádory prsu genetika   MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH

• Konspekt
• Gynekologie. Porodnictví
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• brožury

Akutní lymfoblastická leukémie (ALL) je nejčastějším maligním onemocněním u dětí. Prognóza těchto pacientů se neustále zlepšuje i díky přesnější diagnostice a sledování minimální reziduální nemoci (MRN) pomocí průtokové cytometrie. V předkládaném projektu vyvineme automatické nástroje na analýzu velkého počtu multidimenzionálních cytometrických dat, které umožní kategorizaci leukémií dle jejich imunofenotypu s ohledem na přežití a další klinické charakteristiky pacientů. Popis vývoje imunofenotypu leukémií v průběhu léčby umožní optimalizaci detekce MRN. Imunofenotyp leukémií dále zkombinujeme s celogenomovými daty, abychom stanovili relevanci genetických aberací a jejich vliv na fenotyp. Tato integrální analýza povede ke zlepšení diagnostiky specifických maligních onemocnění, predikce prognózy dětských pacientů s ALL i k racionalizaci nákladů zahrnutých metod.; Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most frequent cancer in children. Its improving outcome depends on accurate diagnosis and minimal residual disease (MRD) monitoring as done by flow cytometry. In proposed project we will develop automatic tools usable in clinical setting to analyse large numbers of multidimensional flow cytometry datasets. This will allow for clinical relevant categorisation of leukemias based on their immunophenotypes (LAIPs) with respect to outcome and other clinical features. Likewise better description of LAIPs dynamics and changes under treatment will allow for optimisation of MRD detection. Moreover, we will use whole genome data to associate genetic traits to immunophenotypes. Such integrative analysis will provide insights into relevance of genetic aberrations and their propagation into phenotype. Thus ultimately the combined analysis will lead to improvement of diagnostic of specific cancer subtypes and to better prediction of treatment outcome as well as rationalisation of costs of involved methods.

• MeSH
• akutní lymfatická leukemie MeSH
• fenomika MeSH
• genomika MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• reziduální nádor MeSH
• sekvenování celého genomu MeSH
• sekvenování transkriptomu MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Onemocnění jater je obrovskou zdravotní zátěží po celém světě. Mezi hlavní rizikové faktory patří obezita, alkohol a virová hepatitida. Jejich patologickým vyústěním potom může být i ničivý hepatocelulární karcinom (HCC), v současné době rezistentní vůči chemoterapii. Chemoterapeutické léky indukují buněčnou senescenci, zatímco samotný epigenetický mechanismus zůstává nejasný. Histon makroH2A1.1, varianta histonu H2A, je marker senescence, ale účastní se také opravných procesů souvisejících s poškozením DNA. Podle našich nedávných zjištění existuje epigenetická vazba mezi makroH2A1.1 a karcinogenezí jater. Důvodem je skutečnost, že nadměrná exprese tohoto proteinu, typická pro rakovinu jater, způsobuje tzv. únik HCC buněk z DNA de-methylačního účinku léčiva decitabinu. Nové hypo-methylačního léčivo, guadecitabin, však vykazuje mimořádnou aktivitu při léčbě rakoviny jater. Proto je naším záměrem porozumět, jak toto léčivo překonává pro-tumorigenní, anti-senescentní a chemorezistentní účinky proteinu makroH2A1.1 a zabraňuje tak progresi onemocnění jater.; Liver diseases are a tremendous health burden worldwide. Obesity, in addition to alcohol and viral hepatitis, are major risks for liver disease, the pathological endpoint of which is the devastating hepatocellular carcinoma (HCC), which is currently refractory to chemotherapy. Chemotherapeutic drugs induce cellular senescence, but the epigenetic basis underlying these therapeutic effects remains unclear. The histone macroH2A1.1, a variant of histone H2A, is a marker of senescence and it is also implicated in DNA damage repair. Recently, we found an epigenetic link between macroH2A1.1 and liver carcinogenesis, whereby overexpression of this protein, which occurs in liver cancer, triggers an escape from the effect of the DNA demethylating anti-cancer agent decitabine. However, guadecitabine, a novel generation hypomethylating agent, demonstrated a superior activity against liver cancer. We propose to study here how this new hypomethylating agent can overcome the pro-tumorigenic, anti-senescence and chemoresistant effect of macroH2A1.1, preventing the progression of liver diseases.

• MeSH
• chemorezistence MeSH
• epigenomika MeSH
• hepatocelulární karcinom genetika   terapie   MeSH
• histony MeSH
• karcinogeneze MeSH
• protinádorové látky MeSH
• stárnutí buněk MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• hepatologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Zobrazovací metody jsou základem diagnostiky, stagingu i sledování efektu terapie plicního karcinomu. Trendem posledních let je využití tzv. funkčních zobrazovacích metod, které kombinují morfologii s určitým klinickým parametrem - např. metabolickou aktivitou (PET/CT), difuzivitou (MR) či vaskularizací (CT). Tato kombinace umožňuje jednak zpřesnění klinického obrazu onemocnění a současně poskytuje informaci o dynamice jeho průběhu. Vývoj metod v oblasti nádorové genomiky v posledních několika letech vedl k novým minimálně-invazivním postupům molekulárních vyšetření DNA uvolňované z nádorové masy do periferního oběhu (circulating tumor DNA, ctDNA) a jejich využití pro zpřesnění diagnostiky a racionální volbu cílené protinádorové terapie. V tomto projektu je předkládán zcela nový koncept funkčních zobrazovacích metod založených na kombinaci PET/CT vyšetření s kvantitativním stanovením ctDNA, který bude vyvinut na souboru celkem 200 pacientů podstupující systémovou terapii bronchogenního karcinomu, u kterých bude v čase sledován a hodnocen klinický průběh onemocnění a léčby.; Imaging methods are fundamental for diagnosis, staging and monitoring of therapy of lung cancer. Functional imaging combines morphology with clinical parameters - e.g. metabolic activity (PET/CT), diffusivity (MR) or vascularization (CT) is a new trend to improve accuracy of clinical description of the actual disease status and information on the dynamics of its progress. Development of methods in the field of cancer genomics in the last few years has led to a new minimally-invasive procedures for molecular profiling of DNA released from the tumor mass into the peripheral circulation (circulating tumor DNA, ctDNA) and its usage for more accurate diagnosis and rational choice of targeted anticancer therapies. The present project proposes an entirely new concept of functional imaging methods based on the combination of PET/CT examination with quantitative determination of ctDNA which will be developed on the set of 200 patients undergoing systemic therapy of lung cancer. The clinical course of the disease treatment will be followed over time using this new combination approach.

• MeSH
• cirkulující nádorová DNA analýza   MeSH
• fenomika metody   MeSH
• genomika metody   MeSH
• genotypizační techniky MeSH
• kombinovaná terapie metody   MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory plic diagnostické zobrazování   genetika   MeSH
• PET/CT metody   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Mnohočetný myelom (MM) vzniká jako důsledek vícestupňového transformačního procesu plazmatických buněk doprovázený častými genetickými změnami. Biochemické změny, jež jsou podstatou epigenetických procesů, zahrnují metylace DNA a posttranslační modifikace proteinů. Nejvíce studovanou epigenetickou modifikací je metylace DNA, ale v rámci komplexního přístupu v diagnostice a léčbě tohoto onemocnění se zdá být prospěšnější poznání vzájemných interakcí a návazností mezi metylacemi DNA a jinými epigenetickými změnami, jako jsou miRNA nebo metylace histonových proteinů. V našem návrhu bychom se chtěli zaměřit na přínos uvedených změn k hlubšímu pochopení patogeneze onemocnění a také na detekci metylace v důsledku vazby transkripčních faktorů na specifická místa DNA v promotorových oblastech prognosticky významných tumor-supresorových genů u mnohočetného myelomu.; Multiple myeloma (MM) is a still lethal plasma cell malignancy. Epigenetic mechanisms, such as DNA methylation are increasingly recognized as potent modulators of tumor cell survival and drug resistance. However, within the complex approach to the diagnostics, the contribution of DNA methylation has been discovered as important, druggable targets but have not been investigated in MM so far. Therefore, we aim to assess the impact of these modulations for MM pathogenesis and drug resistance. Specifically, we investigate the impact of DNA methylation pattern of prognostically important tumor-suppressor genes for MM. We will focus on the contribution of specific miRNA29 to methylation pattern and function of tumor suppressor genes. We will try to therapeutically modify (5 ́-Aza-2 ́-deoxycytidne) methylation patterns. Experiments will be performed also in a MM tumor-microenvironment model to mirror a possible in vivo relevance. Investigation of the usage of tumor-specific DNA methyltransferases and their possible therapeutic targeting are expected to open new avenues to combat MM.

• MeSH
• epigenomika MeSH
• metylace DNA MeSH
• mnohočetný myelom diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• transkripční faktory MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• hematologie a transfuzní lékařství
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Předkládaný projekt se zabývá studiem exprese biotransformačních enzymů a mechanismů její deregulace u primárních jaterních malignit, zejména hepatocelulárního karcinomu (HCC). Hepatocyty tvoří asi 80% jaterní tkáně a vytvářejí tak nejvýznamnější biotransformační orgán lidského těla. Biotransformace definuje značnou část účinku léčiv rychlostí jejich metabolické inaktivace/aktivace. HCC ohrožuje pacienta nejen nádorovým bujením - maligní hepatocyty ztrácí metabolickou kapacitu, což může mít dopad na účinnost a toxicitu farmakoterapie (vč. chemoterapie či cílené léčby). Je všeobecně známo, že exprese biotransformačních enzymů u kultivovaných primárních hepatocytů a nádorových hepatických linií mizí a obdobnou situaci lze předpokládat v jaterních tumorech. Exprese biotransformačních enzymů v HCC nebyla dosud studována v kontextu klinických dat a farmakoterapie, a v evropské populaci dosud ani popsána.; The project proposed aims at studying expression of biotransformation enzymes in primary liver cancer, namely hepatocellular carcinoma (HCC). Hepatocytes constitute approx. 80% of liver cell population and form a major biotransformation organ of the human body. Biotransformation affects drug levels by their metabolic inactivation/activation. HCC, i.e. primary hepatocyte malignancy, threatens the patient not only by tumour growth - malignant hepatocytes lose their metabolic capacity, which can affect the efficiency and toxicity of pharmacotherapy (incl.chemotherapy and targeted therapy). It is known that enzyme expression vanishes in cultivated primary hepatocytes and hepatic cancer cell lines. However, the expression of biotransformation enzymes in HCC has not been described in Caucasian population and has never been studied in the context of clinical data and pharmacotherapy.

• MeSH
• biotransformace MeSH
• epigenomika MeSH
• farmakogenetika MeSH
• hepatocelulární karcinom genetika   metabolismus   MeSH
• mikro RNA MeSH
• rodina 2 cytochromů P450 MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• hepatologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Publikace se zaměřuje na genomiku, epigenetiku, metabolismus, stravování a zdraví. Určeno široké veřejnosti.; Text vysvětluje, že se vyplatí znát svou genovou výbavu a přizpůsobit jí způsob stravování a cvičení. Rady a tipy vás nasměrují na cestu k lepšímu zdraví i v případě, že svůj genetický profil zatím neznáte.

• MeSH
• dieta MeSH
• epigenomika MeSH
• fyziologie výživy genetika   MeSH
• genomika MeSH
• geny MeSH
• metabolismus genetika   MeSH
• zdraví MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH
• populární práce MeSH

• Konspekt
• Obecná genetika. Obecná cytogenetika. Evoluce
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• nutriční terapie, dietoterapie a výživa
• vnitřní lékařství

Rezistence na leky, vznikající v důsledku evoluce a selekce klonu nádorových buněk, je limitujícím faktorem pro účinnost protinádorové terapie. Z cirkulující nádorové ctDNA vyskytující se v plasmě lze metodou sekvenace zjišťovat genomické změny u solidních nádorů. Takovýto přístup umožňuje neinvazivní vyšetření pacienta. V předkládaném projektu budeme pomoci exomové sekvenace ctDNA sledovat genomickou evoluci buněk nádorů tračníka ve vztahu k léčbě. Hlavním záměrem je identifikovat mutace spjaté s rezistencí vůči chemoterapeutikům v genech DNA opravy. Porovnáme výsledky získané z párových vzorků plasmy odebraných před a po léčbě u pacientu se špatnou nebo dobrou odpovědí na chemoterapii. Nalezené mutace budou následně ověřeny na větším souboru pacientu. Mutace asociované s odpovědi na léčbu budou dále komplexně zkoumány z hlediska jejich vztahu a účinku na migraci, apoptózu a proliferaci nádorových buněk. Nejvýznamnějším přínosem projektu je možnost zlepšení účinnosti terapie u pacientů s nádory tračníka.; Drug resistance, acquired as a result of clonal evolution and selection, is a limiting factor of the efficacy of chemotherapy. Genomic alterations in solid cancers can be characterized by deep sequencing of cell-free tumor DNA (ctDNA) released into plasma from cancer cells, representing a non-invasive approach to monitor patients reaction to therapy. In this project, we will track genomic evolution of cancer in relation to the specific therapy by a whole exome sequencing of cfDNA isolated from advanced colon cancer patients. The main aim is to identify mutations in all DNA repair genes associated with chemoresistance. We will compare obtained outcomes in pre- and post-treatment plasma samples in good and non-responders to chemotherapy. The presence of mutations will by independently validated on a larger set of patients. Identified mutations associated with treatment response will be comprehensively tested for their functionality and impact on migration, apoptosis, and proliferation. The significance of the project lays on improvement of the therapy efficacy in colon cancer patien...

• MeSH
• chemorezistence genetika   MeSH
• genomika metody   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory tračníku diagnóza   farmakoterapie   genetika   MeSH
• oprava DNA genetika   účinky léků   MeSH
• sekvenování exomu metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• gastroenterologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR