Defekty imunity se často vyznačují kombinací nedostatečné kontroly infekce a zároveň autoimunitními projevy způsobenými reakcí organismu proti vlastním antigenům. Patogenetickým podkladem mohu být poruchy ve funkci T a B lymfocytů a špatná regulace jejich vzájemné spolupráce. V navrhovaném projektu plánujeme pomocí nejmodernějších technik mnohobarevné průtokové cytometrie (MC-FACS) a molekulární genetiky podrobně charakterizovat složení, aberace a vzájemné systémové vztahy fyziologických i patologických subpopulací lymfocytů u všech primárních imunodeficitů (PID) diagnostikovaných na zúčastněných pracovištích v průběhu řešení projektu a u souboru pacientů s běžným variabilním imunodeficitem (CVID) a selektivním deficitem IgA. Na základě bioinformatické analýzy výsledků MC-FACS od přibližně 150 pacientů bude vypracováno v součinnosti s mezinárodní skupinou EuroFlow-PID diagnostické schéma pro jednotky s již známou genetickou příčinou a budou vytipovány skupiny pacientů s podobným laboratorním a klinickým obrazem k celogenomové analýze a validaci vytipovaných nových variací.; Immune defects are often a combination of inadequate infection control and autoimmune phenomena caused by overreaction to autologous antigens. Underlying cause may be found at impaired function of T and B cells and improper regulation of their cooperation. In the proposed project, we will characterize composition, abnormalities and systemic relationships of normal and abnormal subsets of lymphocytes using cutting edge techniques of multi-color flow cytometry (MC-FACS) and molecular genetics in all primary immunodeficiency (PID) patients in both centers and in patients with Common Variable Immunodeficiency (CVID) and selective IgA deficiency. Bioinformatic analysis of standardized MC-FACS data from 150 patients will serve us to develop a diagnostic scheme together with EuroFlow PID international group for PIDs with established molecular genetic lesion. Furthermore, cases with commonalities in MC-FACS and clinical presentation will be investigated by whole exome sequencing to elucidate new genetic variations leading to PID.

• MeSH
• Early Diagnosis MeSH
• Genetic Testing MeSH
• Immune System Phenomena MeSH
• Lymphocytes MeSH
• Molecular Biology MeSH
• Primary Immunodeficiency Diseases diagnosis   MeSH
• Flow Cytometry MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• alergologie a imunologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

U pacientů s imunodeficiencí vyšetřeným v regionálních centrech (Praha a Brno) zavedeme v mezinárodní spolupráci s EuroFlow-PID jednotnou a optimalizovanou metodiku vyšetření podrobného imunofenotypu lymfocytů metodou mnohobarevné průtokové cytometrie (8-12 parametrů). Projekt povede ke zlepšení diagnostiky a klasifikace imunodeficiencí, především u vzácných typů onemocnění. Povede také k objevení patofysiologických mechanismů a mechanismů jež modifikují klinický průběh onemocnění (u primárních i sekundárních imunodeficiencí). Projekt je koncipován jako multicentrický, což povede jednak k pokrytí většiny imunodeficientních pacientů v ČR, jednak k maximálnímu uplatnění výsledků v praxi. Spolupráce s ÚMG AV ČR umožní odhalení patofysiologických mechanismů na detailní molekulární úrovni.; In international cooperation with EuroFlow PID, we will introduce uniform and optimized methodology for a detailed immunophenotyping of lymphocytes using multicolor flow cytometry (8-12 parameters) in patients with immunodeficiency, which are examinated in regional centers in Prague and Brno. The project will lead to improved diagnostics and classification of immunodeficiencies, particularly the rare types of these diseases, as well as to revealing of patophysiological mechanisms and mechanisms that modify the clinical progress of the primary and secondary immunodeficiencies. The project is designed as multicentric to cover the majority of immunodeficient patients in the Czech Republic and to reach the maximal application of the results in practice. Cooperation with Institute of Molecular Genetics of Academy of Science of the Czech Republic will allow detection of patophysiological mechanisms on detailed molecular level.

• MeSH
• Algorithms MeSH
• B-Lymphocytes cytology   MeSH
• Common Variable Immunodeficiency diagnosis   classification   MeSH
• Immunophenotyping MeSH
• Flow Cytometry MeSH
• T-Lymphocytes cytology   MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• alergologie a imunologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt si klade za cíl zavést 8-mi barevnou standardizovanou cytometrickou diagnostiku hematologických malignit v návaznosti na evropský projekt Euroflow. Jednotně provedená diagnostika navíc umožní komputační zpracování dat a hledání prognostických vztahů v multicentrických souborech. Důležitou součástí projektu je vývoj jednotného postupu detekce odpovědi na léčbu (stanovení minimální reziduální nemoci), a zavedení metodiky externí kontroly kvality stanovení. Projekt je navržen jako projekt multicentrický se zastoupením 4 významných diagnostických center tak, aby bylo zajištěno dostatečné zastoupení všech klinických skupin hematologických malignit.; We expect end up with standardized 8-color flow cytometry for diagnosing and disease monitoring of various hematological malignancies as currently is within the Euroflow project under the development. Uniformly performed diagnostics across the centers inCzechia will enable searching new prognostic correlations and computer assisted diagnostic evaluation. Important part of the project is the development of minimal residual disease detection on common basis which will also enable inter-laboratory standardization and quality data control. Four centers focused on different patients group agreed in participation in the project and all disease categories are covered within these center.

• MeSH
• Hematologic Neoplasms diagnosis   prevention & control   MeSH
• Immunophenotyping MeSH
• Decision Support Techniques MeSH
• Mass Screening MeSH
• Flow Cytometry methods   standards   instrumentation   trends   MeSH
• Reference Standards MeSH
• Neoplasm, Residual MeSH
• Geographicals
• Czech Republic MeSH

• Conspectus
• Patologie. Klinická medicína
• NML Fields
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR