Alteration of the microRNA regulatory network is one of the key events in pathogenesis of wide range of malignancies including rectal cancer. MicroRNAs are abundant and could be determined not only in tumor tissue, but also in blood plasma, where they were proved to be highly stable. In our study, by use of genome-wide expression analysis of microRNAs we plan to identify microRNAs (i) enabling sensitive prediction of therapeutic response to neoadjuvant chemoradiotherapy, and consequently, in combination with results of MRI/TRUS, (ii) to improve diagnostic accuracy of restaging (mainly in regards to T and N stage, positivity of resection margins and CRM) after this treatment. Prediction of therapeutic response would enable more individualized indication of this therapy only to patients expected to have clinical benefit. Improvement of the restaging accuracy will enable more precise planning of the surgery treatment and as a consequence better therapeutic results.

Porucha regulační mikroRNA je jednou z klíčových událostí v patogenezi celé řady nádorových onemocnění včetně karcinomu rekta. MikroRNA jsou abundantní a identifikovatelné nejen v nádorové tkáni, ale také v krevní plazmě a vykazují zde vysokou míru stability. V rámci naší studie chceme pomocí vysokokapacitní analýzy mikroRNA v tkáni/krevní plazmě pacientů s karcinomem rekta identifikovat mikroRNA, které (i) umožní predikovat léčebnou odpověď na neodajuvantní chemoradioterapii a následně v kombinaci s nálezy zobrazovacích metod (TRUS, MRI), (ii) zpřesní hodnocení léčebné odpovědi = restaging (především změny na úrovni T a N stádia a postižení resekčních okrajů, CRM) po ukončení této léčby. Predikce léčebné odpovědi na neoadjuvantní chemoradioterapii by umožnila její individualizované podání pouze pacientům, u kterých je předpokládán klinický benefit. Zdokonalení restagingu umožní přesnější plánování chirurgické léčby a následně také lepší léčebné výsledky.

• MeSH
• cirkulující mikroRNA analýza   MeSH
• krevní plazma MeSH
• kvantitativní polymerázová řetězová reakce MeSH
• lidé MeSH
• nádorové biomarkery analýza   MeSH
• nádory rekta farmakoterapie   MeSH
• neoadjuvantní terapie MeSH
• staging nádorů MeSH
• výsledek terapie MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• koloproktologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Meningiomas represent one of the most common intracranial tumours. They are generally thought to progress from low to high-grade lesions. However, the molecular mechanisms underlying their pathogenesis remain still uncertain. Abnormalities of chromosome 14q32 where a novel Maternally Expressed Gene 3 (MEG3) is located have been recently reported in high-grade/recurrent tumours. As MEG3 is capable of interacting with GDF15, MDM2, p53, VEGF and cAMP in different tissues, the aim of the project is to answer the question how, if at all do the interactions play a role in tumour progression, survival, recurrence, and response to radiotherapy in meningiomas. We suppose the existence of a correlation between the parameters that will help to predict more precisely their biological behaviour and response to therapy. Identification of meningioma molecular subgroups may have significant potential to improve clinical management, through molecular disease-risk stratification strategies and the identification of patients who could benefit from silencing targeted molecular therapeutics.

Meningeomy představují jedny z nejčastějších intrakraniálních nádorů. V důsledku genetických abnormalit můžou progredovat od nízkostupňových k malignějším formám. V současnosti přesný mechanizmus jejích patogeneze zůstává nejasný. V poslední době byly u vysokostupňových/rekurentních nádoru pozorovaný abnormality chromozómu 14q32, kde je lokalizovaný také nově popsaný Maternálně exprimovaný gen 3 (MEG3). Vzhledem k tomu, že MEG3 interaguje s GDF15, MDM2, p53, VEGF a cAMP v rozličných typech tkání, cílem této studie je odpovědět na otázku jestli tyto interakce hraji roli také v meningeomové progresi, rekurenci, přežívání či odpovědi na radioterapii u těchto pacientů. Na základě těchto poznatků se domníváme, že identifikace takových korelací by mohla pomoci předpovědět vývoj onemocnění a odpověď na podanou léčbu. Navíc identifikace molekulárně odlišných podskupin meningeomů muže mít významný vliv na zlepšení léčebného procesu v důsledků stanovení molekulárního rizika onemocnění a identifikace pacientů, který by mněli užitek z potlačení abnormalit specifické signální transdukce.

• MeSH
• genetické testování MeSH
• meningeom MeSH
• mikro RNA MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• radioterapie MeSH
• sekvenční analýza hybridizací s uspořádaným souborem oligonukleotidů MeSH
• staging nádorů MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Multiple myeloma (MM) is the second most common hematooncological disease in the world characterized by multi-stage development. MM develops from monoclonal gammopathy of undetermined significance (MGUS) and may progress to aggressive form of MM - extramedullary relapse (EM). Circulating molecules of nucleic acids, such as long non-coding RNA (lncRNA) and cell-free DNA (cfDNA) have been described in peripheral blood. The project aims to monitor dynamics of these molecules with the presumption that their levels mirror MM progression. Specific cfDNA originate directly from tumor cells and may reflect the course of the disease. Long non-coding RNA may become easily accessible and minimally invasive markers of MGUS progression into MM as well as EM. We hypothesize that lncRNA may improve monitoring of these diseases.

Mnohočetný myelom (MM) je druhé nejčastější hematoonkologické onemocnění, jehož vývoj probíhá v několika fázích. Vyvíjí se ze stádia monoklonální gamapatie nejasného významu (MGUS) a může progradovat až do agresivní formy MM - extramedulárního relapsu (EM). V periferní krvi byly nalezeny cirkulující molekuly nukleových kyselin, jako jsou dlouhé nekódující molekuly RNA (lncRNA) a volně cirkulující molekuly DNA (cfDNA). Cílem projektu bude sledovat dynamiku těchto molekul s hypotézou, že jejich hladiny odráží progresi MM. Specifické cfDNA pocházejí přímo z nádorových buněk a mohou tedy odrážet průběh onemocnění. Dlouhé nekódující molekuly RNA se mohou stát snadno dostupnými a minimálně invazivními markery progrese MGUS do MM i EM a podle našich předpokladů mohou zlepšit monitorování těchto chorob.

• MeSH
• DNA nádorová MeSH
• mnohočetný myelom MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádorové cirkulující buňky MeSH
• RNA dlouhá nekódující MeSH
• staging nádorů MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Urothelial carcinoma of the urinary bladder (UCUB) is the most common cancer of the urinary tract. It is the 4th most common cancer in men and the 9th most common in women worldwide characterized by the high rates of recurrence. Current diagnostic methods (cystoscopy with cytology of urine, excretory urography) are discomfort, time-consuming and expensive and in the case of cystoscopy also invasive. In cases where the cancer lesion is too small, or in the case of carcinoma in situ (CIS) does cystoscopy not lead to achieve a definite diagnosis. Characteristic changes in the expression of miRNAs were found not only in tumor tissue but also in the urine of patients with UCUB. We hypothesize that by determining the miRNAs in tumor tissue, we will be able to predict risk of progression of superficial to muscle-invasive UCUB. We also hypothesize that the implementation of urinary miRNAs in the diagnostic algorithm of UCUB patients will increase the sensitivity of conventional cytology while maintaining specificity, enable early detection of recurrence and progression of superficial UCUB.

Uroteliální karcinom močového měchýře (UKMM) představuje nejčastější nádorové onemocnění močového traktu. Celosvětově zaujímá čtvrté místo mezi mužskými a deváté místo mezi ženskými malignitami a vyznačuje se vysokou frekvencí recidiv primárního tumoru pozorované až u 70 % pacientů. Současné diagnostické metody (cystoskopie s cytologií moče, vylučovací urografie) jsou diskomfortní, časově a finančně náročné a v případě cystoskopie invazivní. V případech, kdy je ložisko karcinomu příliš malé, nebo jedná-li se o carcinoma in situ (CIS) však cystoskopie neumožní dosažení definitivní diagnózy. Charakteristické změny v expresi miRNA již byly pozorovány v nádorové tkáni, ale také moči pacientů s UKMM. Domníváme se, že analýzou miRNA v nádorové tkáni budeme schopni predikovat riziko progrese povrchového UKMM do invazivní formy. Domníváme se rovněž, že implementace močových miRNA do diagnostického algoritmu pacientů s UKMM navýší citlivost konvenční cytologie při zachování její specificity, a umožní časnou detekci rekurence či progrese povrchového UKMM.

• MeSH
• časná detekce nádoru MeSH
• diagnostické techniky urologické MeSH
• karcinom z přechodných buněk diagnóza   MeSH
• mikro RNA MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory močového měchýře diagnóza   MeSH
• staging nádorů MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• urologie
• biochemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

In chronic lymphocytic leukemia (CLL), the absence of primary genomic defect implies that various circumstances, represented by both intrinsic and extrinsic factors, have to be met to support leukemic clone selection, growth and evolution. The variety of structural chromosome variants suggests that several mechanisms are involved in induction of chromosomal breaks and their repair. From a clinical point of view, it is crucial to recognize patients highly susceptible to evolution of complex genomic changes since they typically represent cases with more aggressive disease. Within this project we aim to identify factors predisposing to unfavorable clonal evolution. To achieve this, we will employ next generation sequencing to uncover genetic defects contributing to the development of genomic defects. We will perform a detailed study of complex chromosomal rearrangements. Furthermore, we will investigate B-cell receptor and Toll-like receptor signaling, important mediators of cellular responses to external stimuli, and their relation to the CLL clonal evolution.

Nepřítomnost společného genomického defektu u pacientů s chronickou lymfocytární leukémií (CLL) naznačuje, že řada faktorů vnitřního i vnějšího prostředí ovlivňuje vznik, selekci a proliferaci leukemického klonu. Široká škála chromosomálních poškození identifikovaných u CLL vypovídá o tom, že při jejich vzniku a opravě hraje úlohu množství molekulárních mechanismů. Z pohledu každodenní klinické praxe je velmi důležité rozpoznat ty CLL pacienty, u nichž hrozí riziko vzniku chromosomálních aberací, zvláště s komplexním charakterem, neboť se obvykle vyskytují u pacientů s nepříznivým průběhem onemocnění. V rámci projektu proto chceme použít sekvenování nové generace k identifikaci genetických poškození přispívajících ke klonální evoluci CLL; podrobně budeme studovat komplexní chromozomální přestavby. Dále chceme studovat buněčnou signalizaci zprostředkovanou B buněčnými a Toll-like receptory, které hrají významnou úlohu v buněčné odpovědi na podněty vnějšího prostředí, zjistit, zda a jak významně přispívají ke klonální evoluci CLL.

• MeSH
• chromothripsis MeSH
• chronická lymfatická leukemie genetika   MeSH
• genom MeSH
• klonální evoluce MeSH
• receptory antigenů B-buněk MeSH
• signální transdukce MeSH
• staging nádorů MeSH
• toll-like receptory MeSH
• výsledek terapie MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• klasifikace MeSH
• nádory klasifikace   MeSH
• staging nádorů MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH
• příručky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie

• MeSH
• staging nádorů MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

• MeSH
• mezinárodní klasifikace funkčních schopností, disability a zdraví MeSH
• mezinárodní klasifikace nemocí MeSH
• staging nádorů klasifikace   MeSH
• Publikační typ
• plakáty MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• lékařská informatika
• lingvistika, lékařská terminologie

With repeated FDG-PET/CT examinations carried out before, 14 days after the beginning and 4 weeks after the completion of neoadjuvant chemotherapy for adenocarcinoma of the esophagus or esophago-gastric junction, we will examine how correlates the decrease of tumor metabolic activity, expressed as a decrease of consumption of 18-FDG in tumor tissue (rated according to criteria PERCIST 1.0) early (14 days) after the start of neoadjuvant therapy with the degree of histopathologic tumor regression on the definitive histopathologic examination after operation that will follow the completion of neoadjuvant therapy. In the case of confirmation of the correlation, we set the threshold of decline of the tumor metabolic activity, through which we can distinguish with reasonable accuracy patients who will respond well to preoperative chemotherapy from patients resistant to these therapy early in the course of the treatment.

Pomocí opakovaného FDG-PET/CT vyšetření, provedeného před, 14 dnů po začátku a 4 týdny po ukončení neoadjuvantní chemoterapie u adenokarcinomu jícnu nebo EGJ budeme zjišťovat, jak koreluje pokles metabolické aktivity tumoru vyjádřený poklesem konzupce 18-FDG v nádorové tkáni (hodnoceným podle PERCIST 1.0 kriterií) včasně (14 dnů) po začátku neoadjuvantní léčby s mírou histopatologické regrese tumoru v definitivním histologickém resekčním preparátu po operaci, která bude následovat po ukončení neoadjuvantní léčby. V případě potvrzení předpokládané korelace stanovíme prahovou hodnotu poklesu metabolické aktivity tumoru, pomocí které s dostatečnou spolehlivostí můžeme včasně odlišit pacienty, kteří budou dobře reagovat na předoperační CHT od pacientů rezistentních na tuto léčbu.

• MeSH
• adenokarcinom farmakoterapie   MeSH
• fluorodeoxyglukosa F18 MeSH
• gastroezofageální junkce MeSH
• imunohistochemie MeSH
• nádory jícnu farmakoterapie   MeSH
• neoadjuvantní terapie MeSH
• počítačová rentgenová tomografie MeSH
• pozitronová emisní tomografie MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• prognóza MeSH
• staging nádorů MeSH
• výsledek terapie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• gastroenterologie
• farmakoterapie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Accurate clinical staging is crucial for the management of patients in early stages of cervical cancer. Ultrasound examination has certain advantages compared to a golden standard of magnetic resonance imaging: dynamic tests combined with functional Doppler display. Ultrasound allows for very accurate local staging and subsequent individualization of treatment. Accuracy of ultrasound is comparable to magnetic resonance imaging, ultrasound, however, requires considerable level of erudition. The proposed project is exploring whether the erudition is transferable, in which parameters and under what conditions, and it sets rules and conditions for obtaining and maintaining erudition in ultrasound of the cervix. This issue is currently widely discussed and is crucial for the introduction of ultrasound into clinical practice in oncogynecology.

Přesný klinický staging je klíčový pro management pacientek v časných stádiích karcinomu děložního hrdla. Ultrazvukové vyšetření má oproti dosud standardně využívané magnetické rezonanci výhodu dynamického vyšetření kombinovaného s funkčním dopplerovským zobrazením, umožňuje velmi přesný lokální staging s následnou individualizací léčby. Přesnost ultrazvuku je srovnatelná s magnetickou rezonancí, ultrazvukové vyšetření však vyžaduje značnou erudici vyšetřujícího. Navrhovaný projekt zkoumá, zda je tato erudice přenositelná, v jakých parametrech a za jakých podmínek, a stanovuje pravidla a podmínky pro získání a udržení erudice v ultrazvukovém vyšetření děložního hrdla. Tato problematika je v současnosti široce diskutována a je klíčová pro zavedení ultrazvuku do běžné klinické praxe v onkogynekologii.

• MeSH
• individualizovaná medicína MeSH
• karcinom diagnóza   MeSH
• nádory děložního čípku diagnóza   MeSH
• staging nádorů MeSH
• transrektální ultrazvuk o vysoké intenzitě MeSH
• ultrasonografie MeSH
• ženy MeSH

• Konspekt
• Gynekologie. Porodnictví
• NLK Obory
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR