The essence and main focus of the project is the preparation and validation of the methodology for monitoring the cost of pressure ulcers (cost analyses) in hospitalized patients. The standard data on the occurrence and treatment of pressure ulcers during hospitalization will be collected and evaluated, followed by the creation of a special dataset to assess the cost of care for pressure ulcers (both curative/treatment and nursing interventions). The basis for data analysis will be existing registers, the hospital information system and the identification of benefits and limitations of data obtained from hospitalization records. The main applied output of the project will be a detailed methodology for monitoring the cost of pressure ulcers (comprehensive economical model) in hospitalized patients that can be used in clinical practice for inpatient providers of healthcare services.

Podstatou řešení projektu je příprava a ověření metodiky pro sledování nákladovosti dekubitů u hospitalizovaných pacientů. V projektu budou sbírána a vyhodnocována standardní data o výskytu a léčbě dekubitů, následně bude vytvořen speciální dataset umožňující posouzení nákladovosti péče o dekubity (léčebné i ošetřovatelské intervence). Východiskem pro analýzu dat budou stávající registry, nemocniční informační systém a identifikace benefitů a limitů údajů získaných z hospitalizačních záznamů. Hlavním aplikovaným výstupem projektu bude detailní metodika (ekonomický model) pro komplexní sledování nákladovosti dekubitů u hospitalizovaných pacientů využitelný v klinické praxi pro lůžkové poskytovatele zdravotních služeb.

• Keywords
• analýza, dekubitus, nákladovost, nákladnost, pressure ulcer, cost, expensiveness, hospitalizační záznam, medical record, analyses,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The epidemiological situation of tuberculosis is favourable in the Czech Republic thanks to a functional control and diagnosis system. However, we are facing serious shortcomings in today's clinical practice at all levels of the emerging issue of mycobacterioses. Incidence of current cases of disease is strongly underestimated in the Czech R. A comprehensive concept of prevention and evaluation of mycobacterial findings in variously predisposed persons, especially children, is missing. At the same time, due to the increasing antituberculotic drug resistance, dilemmas arise associated with the long-term medical follow-up care and suitability of therapy. The main focus of the project is to evaluate all the findings obtained by detailed examinations of patients on clinical, laboratory and the demographic level, and at the same time to clarify the epidemiological context by researching the presence of non-tuberculous mycobacteria and their properties in the environment and the immediate vicinity of humans.

Epidemiologická situace tuberkulózy je díky funkčnímu systému kontroly a diagnostiky v České republice příznivá. S vážnými nedostatky se však v současné klinické praxi potýkáme na všech úrovních řešení stále aktuálnějších mykobakterióz. Incidence skutečných případů onemocnění je jednoznačně v České R. podhlášená. Současně chybí ucelená koncepce prevence a hodnocení nálezů mykobakterií u různě predisponovaných osob, zejm. dětí. Zároveň se vzrůstem rezistence k antituberkulotikům vyvstávají rozpaky související s případnou dispenzarizací či vhodností terapie. Hlavní náplní projektu je zhodnotit veškeré poznatky získané podrobným vyšetřováním pacientů na klinické, laboratorní a socio-demografické úrovni a zároveň objasnit epidemiologické souvislosti výzkumem přítomnosti netuberkulózních mykobakterií a jejich vlastností ve vnějším prostředí a v bezprostředním okolí člověka.

• Keywords
• cystická fibróza, cystic fibrosis, mykobakteriózy, mycobacterioses, molekulární epidemiologie, molecular epidemiology, COPD, CHOPN, Mycobacterium avium, MDR, mykobakteriální lymfadenitida, kvantitativní PCR, BCG, ekologie NTM, Mycobacterium avium, mycobacterial lymphadenitis, MDR, quantitative PCR, BCG, NTM ecology,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Atherosclerosis and dementia or mild cognitive impairment may have similar risk factors. Atherosclerosis is believed to be involved in development of dementia and its major subtypes, vascular dementia and Alzheimer’s disease. The current hypothesis is that neurodegenerative and vascular lesions coexist and have a synergistic role in the development of cognitive impairment and dementia. Relationship between atherosclerosis and cognitive functions, including dementia development, is multilevel and not enough explained. From collaborated institutions will be examined 920 patients with dementia or atherosclerosis or both disabilities. The comparison of clinical, epidemiological, genetic and other data will be done in this three groups of patients. Results will contribute to identification of risk factors, explaining the relationship between atherosclerosis and dementia and better prevention.

Ateroskleróza a demence nebo mírná kognitivní porucha mohou mít podobné rizikové faktory. Je akceptováno, že ateroskleróza je spojena s rozvojem demence a s jejími hlavními subtypy, vaskulární demencí a Alzheimerovou chorobou. Současná hypotéza předpokládá, že neurodegenerativní a vaskulární léze koexistují a mají synergickou úlohu při rozvoji kognitivního poškození a demence. Tento vztah je víceúrovňový a není dosud dostatečně vysvětlen. Ze spolupracujících pracovišť bude podrobně vyšetřeno 920 osob s demencí nebo aterosklerózou nebo oběma postiženími. Bude provedeno srovnání klinických, epidemiologických, genetických a ostatních údajů u pacientů ve všech třech souborech. Výsledky přispějí ke zlepšení identifikace rizikových faktorů, vysvětlení vztahu aterosklerózy a demence a tím k lepším možnostem prevence.

• Keywords
• prevence, prevention, demence, epidemiologie, epidemiology, ateroskleróza, atherosclerosis, rizikové faktory, risk factors, dementia, kognitivní funkce, Cognitive Functions,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Myeloid maturation in bone marrow (BM) is a complex process currently evaluated mainly by morphological examination. Although there are published data showing advantages of using flow cytometry (FC) in diagnostics of myelodysplastic syndrome in adults, age-specific reference values are missing and broader studies so far used only 4-5 fluorochromes simultaneously. Recent developments in FC bring great potential for discrimination of impaired hematopoiesis, such as BM failure or immunodeficiency, which has not been fully exploited. Our aim is to introduce a standardized analysis of myeloid maturation in pediatric BM samples. Important part is a description of specifics in patients on antileukemic therapy or after hematopoietic stem cell transplantation (HSCT). This knowledge will improve identification of malignant cells in a terrain of reactive changes. Character of myeloid maturation recovery after HSCT might reflect acute complications and graft function. Hence, establishment of FC examination could provide a basis for earlier clinical decisions and proper therapy.

Vyzrávání myeloidní řady v kostní dřeni (KD) je komplexní proces v současné době hodnocený především pomocí morfologie. Ačkoli existují přístupy pro využití průtokové cytometrie především v odlišení myelodysplastického syndromu, chybí věkově specifické normy pro zastoupení jednotlivých vývojových forem a rozsáhlejší studie využívající více než 4-5 fluorochromů současně. Rozvoj průtokové cytometrie přináší velký potenciál pro odlišení poruch krvetvorby, např. selhání kostní dřeně či imunodeficitu, který doposud nebyl plně využit. Naším cílem je zavést standardizovanou analýzu vývoje myeloidní řady v KD u dětí. Důležitou součástí je i identifikace změn při antileukemické terapii a po transplantaci kostní dřeně. Tato znalost umožní lépe odlišit maligní buňky v terénu reaktivních změn a zlepšit tak stanovení minimální reziduální nemoci pomocí průtokové cytometrie. Charakter obnovy krvetvorby po transplantaci kmenových buněk může odrážet akutní komplikace i následnou funkci štěpu a zavedení cytometrického hodnocení tak může přispět k časnějšímu klinickému rozhodování a optimální léčbě.

• Keywords
• transplantace kmenových buněk, akutní myeloidní leukémie, acute myeloid leukemia, Hematopoietic stem cell transplantation, průtoková cytometrie, minimální reziduální nemoc, minimal residual disease, flow cytometry, vyzrávání myeloidní řady, myeloid maturation,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Anastomotic leakage and gastrointestinal obstruction due to formation of peritoneal adhesions are major postoperative complications in colorectal surgery. There are no available materials on the market capable of preventing such complications. The aim of the project is to develop a unique double-layered nanofibrous material to cover the intestinal anastomoses. The material will be composed of synthetic biocompatible and biodegradable polymers and prepared by combining the electrospinning and the electrospraying via NanospiderTM. The inner polymeric fibers will adhere to anastomosis and support healing. The outer anti-adhesive side will be inspired by the natural superhydrophobic lotus leaf structure and thus prevent the adhesions. The materials will be assessed in vitro using NIH/3T3 fibroblasts. The adhesion to tissue will be tested mechanically. The functionality of the material will be described in experimental model of complicated healing of colonic anastomosis on pig with three weeks observation period concluded with evaluation of peritoneal adhesions and anastomotic healing.

Anastomotický leak a poruchy pasáže zažívacím traktem způsobené tvorbou peritoneálních adhezí patří mezi zásadní pooperační komplikace v kolorektální chirurgii. Na trhu nejsou k dispozici materiály, které by tyto komplikace spolehlivě eliminovaly. Cílem projektu je vyvinout unikátní dvouvrstvý nanovlákenný materiál s odlišnými vlastnostmi jednotlivých stran pro krytí chirurgických anastomóz. Materiál se bude skládat ze syntetických biokompatibilních a biodegradabilních polymerů a bude připraven kombinací electrospinningu a electrosprayingu na NanospiderTM. Vnitřní polymerní vlákna přilnou k anastomóze a podpoří hojení. Morfologie vnější antiadhezivní strany bude inspirována nativním superhydrofobním lotosovým povrchem a bude sloužit jako prevence adhezí. Materiály budou analyzovány in vitro testy za použití NIH/3T3 fibroblastů. Přilnavost k tkáni bude testována mechanicky. Funkce materiálu bude popsána na prasečím modelu komplikovaného hojení anastomózy na tračníku s třítýdenní observací zvířat zakončenou systematickým hodnocením peritoneálních adhezí a kvality anastomózy.

• Keywords
• biokompatibilita, biocompatibility, nanovlákna, nanofibers, biodegradabilita, biodegradability, gastrointestinální anastomóza, anastomotický leak, pooperační adheze, abdominální chirurgie, superhydrofobicita, gastrointestinal anastomosis, anastomotic leakage, postoperative adhesion, abdominal surgery, superhydrophobic surface,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) are the fifth most common solid cancer. Unfortunately, no significant improvement has been achieved in HNSCC patient survival due to unpredictable therapy response and therapy resistance which may be significantly supported by cancer-associated fibroblasts (CAFs). CAFs can promote HNSCC by secreting factors with pro-survival effect. Many of these factors may be contained in exosomes. Exosomes released from CAFs in the tumour microenvironment may increase the invasive behaviour of cancer cells and therapy resistance. The presence of many types of RNA within exosomes has been proven. We want to investigate the RNA cargo within CAFs-derived exosomes by using Next-Gen Sequencing. We will test exosomal RNA as biomarkers for clinically relevant characteristics of HNSCC patients indicated for curative surgery and adjuvant chemotherapy. We will compile a panel of exosomal RNAs which can be detected in the venous blood of HNSCC patients and reflect the presence of a malignant tumour and treatment-resistant phenotype.

Spinocelulární karcinomy hlavy a krku (HNSCC) jsou pátým nejčastějším solidním nádorem. Prozatím bohužel nebylo dosaženo zlepšení v přežívání pacientů s HNSCC, což je důsledek nedostatku markerů terapeutické odpovědi a vzniku rezistence k léčbě. Rezistence může být významně podpořena fibroblasty asociovanými s nádorem (CAF), které vylučují faktory umožňující přežívání nádorových buněk. Mnohé jsou obsaženy v exosomech. Exosomy uvolňované z CAFs v nádorovém mikroprostředí mohou zvyšovat invazivní chování nádorových buněk a jejich rezistenci. Uvnitř exosomů byla prokázána přítomnost mnoha typů RNA. V tomto projektu chceme prozkoumat obsah RNA v exosomech produkovaných CAF pomocí sekvenování nové generace. Chceme testovat význam exosomálních RNA jako biomarkerů pro klinicky relevantní charakteristiky pacientů s HNSCC indikovaných pro chirurgický zákrok a adjuvantní chemoterapii. Dále bychom chtěli sestavit panel exozomálních RNA, které lze detekovat v žilní krvi pacientů, které reflektují přítomnost maligního tumoru a fenotypu rezistentního k terapii.

• Keywords
• sekvenování nové generace, Spinocelulární karcinomy v oblasti hlavy a krku, exosomes, Exosomy, head and neck cancer, fibroblasty asociované s nádorem, kódující a nekódující RNA, cancer-associated fibroblasts, coding and non-coding RNA, Next-Gen Sequencing,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Dissemination of antibiotic resistant bacteria represents a top clinical challenge. Enterobacterales order, especially Escherichia coli and Klebsiella spp., is among the most common agents of urinary tract and other severe infections and is commonly resistant to multiple antibiotics. Resistant bacteria can spread from hospitals via raw sewage to urban wastewater treatment plants and into surface waters. This project is focused on revealing complex transmission routes of antibiotic resistance from hospitals to the environment using culture-dependent and -independent sequencing approaches. Whole genome sequencing will provide genetic context of clinically important bacterial clones. Metagenomics will enable characterization of complex bacterial populations, detection of genetic markers of interest (resistance and virulence genes, mobile genetic elements) and the investigation of silent sources of antibiotic resistance. Such a combined approach will reveal the spread of resistant bacteria and clinically and epidemiologically relevant elements from hospitals into the environment.

Šíření bakterií rezistentních k antibiotikům představuje závažný medicínský problém. Zástupci řádu Enterobacterales, zejména Escherichia coli a Klebsiella spp., patří mezi původce močových a jiných závažných infekcí člověka a zároveň často vykazují mnohočetnou rezistenci k antibiotikům. Rezistentní bakterie se mohou šířit z nemocnic do odpadních vod a následně přes městské čistírny odpadních vod do vod povrchových. Tento projekt je zaměřen na celkové sledování cest šíření antibiotické rezistence z nemocnic do prostředí s využitím sekvenačních technik závislých i nezávislých na předchozí kultivaci. Celogenomové sekvenování bude použito k mapování genetického pozadí klinicky závažných bakteriálních klonů. Metagenomika umožní detailní charakterizaci komplexních bakteriálních populací, detekci zájmových genetických markerů (genů rezistence, virulence, mobilních genetických elementů) a zhodnocení skrytých zdrojů antibiotické rezistence. Kombinací použitých přístupů bude zhodnoceno šíření rezistentních bakterií a klinicky a epidemiologicky důležitých elementů z nemocnic do prostředí.

• Keywords
• Celogenomové sekvenování, antibiotic resistance, Escherichia coli, Escherichia coli, antibiotická rezistence, metagenomika, metagenomics, Whole Genome Sequencing, Klebsiella spp., odpadní vody, Klebsiella spp., waste waters, klinické izoláty, clinical isolates,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Bariatric surgery is the most efficacious treatment of obesity and type 2 diabetes mellitus. Novel endoscopic methods based on the principles of bariatric surgery are also highly effective. No direct randomized comparison of both types of treatment has been performed to date and the mechanisms of action of both procedures are still only partially clarified. The aim of the project is to perform a randomized trial comparing efficacy and safety of three treatment options in patients with obesity: laparoscopic sleeve gastrectomy, endoscopic gastric plication and conservative treatment. We further aim to characterize the influence of the three treatments on subclinical inflammation, gut microbiota composition and changes of gastrointestinal hormones. The results of the project will describe the efficacy and safety of these procedures as compared to conservative therapy and clarify the mechanisms of action of these treatments. The project will also contribute to more precise indications of bariatric or endoscopic methods in clinical practice and enable personalized choice of therapy for particular patient.

Bariatrická chirurgie je nejefektivnější metodou léčby obezity a diabetes mellitus 2. typu. Velmi efektivní jsou také nové endoskopické metody založené na principech bariatrické chirurgie. Dosud nebylo provedeno přímé randomizované porovnání obou těchto typů léčby a jejich mechanizmy působení jsou stále objasněny pouze částečně. Cílem projektu je provést randomizovanou studii srovnávající účinnost a bezpečnost tří léčebných možností obezity: lapaskopické rukávovité resekce žaludku, endoskopické gastroplikace a konzervativní léčby a objasnit mechanizmy jejich působení. Dalším cílem je charakterizovat vliv těchto tří typů léčby na subklinický zánět, složení střevní mikroflory a změny gastrointestinálních hormonů. Výsledky projektu umožní přesně charakterizovat účinnost a bezpečnost těchto léčebných metod ve srovnání s konzervativní léčbou a popsat detailní mechanizmus jejich působení. Projekt tak přispěje k přesnější indikaci bariatrických nebo endoskopických metod a umožní léčbu pacientů na založenou na principech personalizované medicíny.

• Keywords
• diabetes, diabetes, gut microbiota, střevní mikrobiom, obezita, obesity, subklinický zánět, subclinical inflammation, laparoskopická rukávovitá resekce žaludku, endoskopická gastrická plikace, lapariscopic sleeve gastrectomy, endoscopic gastric plication,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

The project will focus on metabolic processes in patients with Alzheimer’s disease (AD) compared to healthy seniors. Repeated examination of the subjects at 5-year interval should reveal which changes of the examined neuroactive biomarkers accompany natural aging, and which are associated with pathological aging. The aim of the study is to make a prediction model able to identify persons at risk of AD more precisely, to simplify the prediction model and make it applicable to clinical practice, thanks to detection of neuroactive biomarkers in peripheral blood. This approach opens the opportunity of early pharmacologic or preventive intervention focused on certain metabolic pathway. The project is proposed as continuation and completion of previous project “Study of Common Pathogenetic Factors in Alzheimer’s Disease and Type 2 Diabetes Mellitus” (IGA MZ ČR NT13543-4). It will build on the current results proving differences in glucose tolerance, concentrations of circulating neuroactive steroids, some cytokines, adipokines and incretins in AD compared to healthy subjects.

Projekt bude zaměřen na studium metabolických pochodů u pacientů s Alzheimerovou nemocí (AD) ve srovnání se změnami u zdravých seniorů. Z opakovaného vyšetření seniorů v 5-ti letém intervalu určíme, které změny námi sledovaných neuroaktivních biomarkerů doprovází přirozené stárnutí a které charakterizují patologické stárnutí. Cílem projektu bude zpřesnit prediktivní model pro identifikaci osob v riziku AD, zjednodušit a klinické praxi přiblížit dostupnost tohoto modelu. Náš přístup otevírá možnosti včasné farmakologické nebo preventivní intervence zacílené na konkrétní metabolickou dráhu. Význam plánovaného modelu spočívá v možnosti využít pro predikci onemocnění dostupnou tkáň - periferní krev. Projekt je naplánován jako pokračování předešlého projektu "Studium společných patogenetických faktorů Alzheimerovy choroby a diabetes mellitus 2. typu" (IGA MZČR NT13543-4). Projekt naváže na průběžné výsledky prokazující rozdíly v glukózové toleranci, v hladinách cirkulujících neuroaktivních steroidů a v hladinách některých cytokinů, adipokinů a inkretinů u AD oproti zdravým kontrolám.

• Keywords
• cytokiny, cytokines, inkretiny, adipokiny, incretins, adipokines, Alzheimerova nemoc, neurosteroidy, vícerozměrná regrese, Alzheimer ́s disease, neurosteroids, multidimensional regression,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Quality of life (QoL) is currently emphasized during the treatment of bran metastases (BM). Stereotactic radiotherapy and radiosurgery (SRT/SRS) is an advanced technique that – apart from excellent local control – also induces less adverse effects including cognitive impairment. Our unique research using MR spectroscopic imaging proved bad impact of conventional whole brain irradiation on hippocampal N-acetylaspartate concentrations and parallel decline in verbal memory. Decrease in hippocampal stem-cells is often asserted to be a pathophysiological basis for postradiation cognitive impairment. To fully understand the issue, a follow-up study is necessary focusing on hippocampal changes and neurocognitive impairment after SRT/SRS with reduced hippocampal radiation dose. In the present project, we are going to measure the spectroscopy profile of hippocampus after SRT/SRS of BM. We aim to add to clarify the pathophysiology of radiation-induced cognitive decline and QoL impairments, thus contributing to the development of new radiation techniques for more personal approach to patients.

V léčbě mozkových metastáz (mMTS) je kladen čím dál větší důraz na kvalitu života. Stereotaktická radioterapie a radiochirurgie (SRT/SRS) mMTS je moderní technika, která kromě excelentní lokální kontroly nabízí méně nežádoucích účinků včetně zhoršení neurokognice. Náš unikátní výzkum využívající MR spektroskopii prokázal negativní vliv klasické celomozkové radioterapie na hipokampální koncentraci neuronálního markeru N-acetylaspartátu a současné snížení verbální paměti. Úbytek hipokampálních neuronálních kmenových buněk je nejčastěji uváděn jako patofyziologický podklad poradiační poruchy neurokognice. K plnému pochopení problematiky je nutné navázat studiem hipokampálních změn a poruch kognitivních funkcí po užití speciálních technik SRT/SRS s redukcí radiační zátěže hipokampů. V předkládaném projektu plánujeme měřit spektroskopický profil hippokampu po SRT/SRS mozkových metastáz. Projekt pomůže objasnit patofyziologii radiačního poškození kognice a snížení kvality života a přispěje tím k vývoji nových ozařovacích technik pro personalizovaný přístup k onkologickým pacientům.

• Keywords
• MR spektroskopie, MR spectroscopy, radioterapie, mozkové metastázy, hippokampus, neurokognice, radiotherapy, brain metastases, hippocampus, neurocognition,

• NML Publication type
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR