Renal cell carcinoma (RCC) represents a serious oncological disease with the highest incidence in the Czech Republic across the world, for which reliable molecular prognostic and predictive biomarkers are still unavailable. We will implement a novel digital biobanking technology based on protein fingerprints (proteotypes) using mass spectrometry in data independent acquisition mode. With the use of a new technique, we will analyze two well-characterized sets of tumors, the resulting data will be statistically evaluated in order to find: (i) protein biomarkers identifying patients with localized RCC, but with higher risk, who should be monitored more intensively, and (ii) protein biomarkers associated with poor prognosis of metastatic RCC treated by tyrosine kinase inhibitors in the first line. We expect that the identified patterns, potential biomarkers, and potential therapy targets can contribute to more efficient treatment of RCC patients.

Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.

• Klíčová slova
• renal cell carcinoma, Hmotnostní spektrometrie, Mass Spectrometry, karcinom ledviny, datově nezávislý sběr dat, data independent acquisition,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Renal cell carcinoma (RCC) is the most common cancer of adult kidney. Despite advances in diagnosis, about 20–30% of all patients are diagnosed with metastatic disease. In addition, another 20% of patients undergoing nephrectomy will have a relapse and develop metastatic disease during follow-up. Except for prognostic normograms based on clinic-pathological features of RCC with limited predictive power, there are no sensitive molecular biomarkers enabling prediction of relapse after nephrectomy. Long non-coding RNAs (lncRNAs) play key roles in transcriptional and post-transcriptional regulation. Deregulated levels of lncRNA were observed in tumor tissue of wide range of cancers, where can these expression profiles be correlated with clinical and pathological features of RCC. Development of lncRNA expression-based taxonomy will lead to better understanding of molecular basis of RCC and could be introduced in diagnosis and prognosis prediction.

Renální buněčný karcinom (RCC) je nejčastějším nádorovým onemocněním ledvin. Přes značný pokrok v diagnostice je přibližně 20-30 % pacientů diagnostikováno ve stádiu metastatického onemocnění. Kromě toho u dalších 20 % pacientů dochází po nefrektomii k relapsu onemocnění. Mimo prognostické nomogramy založené na klinicko-patologických znacích nádorů není v současnosti žádná senzitivní molekulární biomarker schopný predikovat progresi onemocnění po nefrektomii. Dlouhé nekódující RNA (lncRNA) hrají klíčové role jak v transkripčních, tak v post-transkripčních regulačních drahách. U mnoha nádorových onemocnění dochází k deregulaci lncRNA, kde mohou být tyto charakteristické expresní profily korelovány s klinicko-patologickými znaky. Zavedení molekulární taxonomie založené na expresi lncRNA by mohlo napomoci lepšímu poznání molekulárního pozadí RCC, včetně implikace v diagnostice a predikci prognózy RCC.

• Klíčová slova
• renální karcinom, diagnostika, dlouhé nekódující RNA, molekulární klasifikace, předpověď prognózy, renal carcinoma, long non-coding RNAs, molecular classification, diagnostics, prognosis prediction,

• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Kniha kolektivu autorů pod vedením onkourologa docenta Alexandra Popracha přináší souhrn informací o diagnostických i léčebných možnostech zhoubných nádorů močového měchýře. Snahou autorů je, aby čtenář nebyl zahlcen množstvím informací, ale aby se rychle orientoval v dané problematice.

• Klíčová slova
• Zdravotnická a lékařská literatura,
• MeSH
• nádory močového měchýře MeSH

• NLK Obory
• onkologie
• urologie

Publikace se zaměřuje na zhoubné nádory močového měchýře. Určeno odborné veřejnosti.

• MeSH
• nádory močového měchýře MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• urologie
• NLK Publikační typ
• kolektivní monografie

The main cause of morbidity and mortality of patients with renal cell carcinoma is the progression to metastatic disease (mRCC). Identification and validation of biomarkers has the potential to improve the therapeutic results in mRCC treated with tyrosine kinase inhibitors (TKI) sunitinib and pazopanib. Primary or secondary resistance to the TKIs occur frequently and no clinically useful biomarkers are available that would discriminate between patients with potential benefit from the therapy and those with high likelihood of early progression. The proposed project includes a comprehensive series of experiments that could identify, validate, and analytically characterise specific panels of miRNAs as novel molecular biomarkers enabling the prediction of response and time to progression in patients with mRCC treated with sunitinib and pazopanib. In addition to tumor samples, serum samples will be investigated aiming to develop a minimally invasive “liquid biopsy” approach for the characterisation of the disease in individual patients.

Většina pacientů s renálním karcinomem umírá na komplikace spojené s progresí a metastazováním onemocnění. Zaměřili jsme se proto na hledání nových biomarkerů s potenciálem zlepšení léčebných výsledků tyrozinkinázových inhibitorů sunitinibu a pazopanibu u metastatického onemocnění. Léčbu komplikuje primární a sekundární rezistence k TKI, avšak onkologové nemají v současnosti k dispozici žádný prediktivní biomarker, který by dovedl rozlišit skupinu pacientů, kteří mají benefit z léčby, od skupiny, která progreduje navzdory léčbě TKI. Předkládaný projekt navrhuje ucelený soubor experimentů, jejichž cílem je identifikovat, validovat a analyticky zhodnotit nové molekulární biomarkery – specifické panely miRNA – umožňující predikovat léčebnou odpověď a čas do progrese u pacientů léčených sunitinibem a pazopanibem. Kromě tkání budou vyšetřeny také vzorky krevního séra ve snaze vyvinout vyšetření v rámci konceptu tzv. tekuté biopsie, minimálně invazivního přístupu k získání informací o pacientově metastatickém onemocnění.

• Klíčová slova
• pazopanib,
• MeSH
• inhibitory proteinkinas terapeutické užití   MeSH
• karcinom z renálních buněk MeSH
• metastázy nádorů MeSH
• mikro RNA MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• prognóza MeSH
• sérum MeSH
• sunitinib MeSH
• tekutá biopsie MeSH
• tkáně MeSH
• tyrosinkinasy MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• nefrologie
• molekulární biologie, molekulární medicína
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR