Bordetella pertussis is the causative agent of human whooping cough (pertussis), a highly contagious respiratory disease that remains to be the least controlled vaccine-preventable infectious disease. Despite generalized vaccination, pertussis is again on the rise in highly vaccinated populations including Czech Republic. The increase in pertussis cases has been mostly attributed to short-lived immunity induced by the acellular vaccine and escape from immunity due to pathogen adaptation and antigen variation. Therefore, using comparative genomics we will analyze Czech clinical isolates of B. pertussis collected during the recent period 2008 - 2015. Importantly, genomic sequences, expression and production of virulence factors will be compared with those of B. pertussis vaccine strains. In addition, using proteomics and immunoprecipitation we will apply recent human sera of infected patients for identification of novel immunogenic antigens of B. pertussis.

Bordetella pertussis je lidský patogen, který je původcem černého kašle, vysoce nakažlivé respirační choroby, jejíž výskyt je v současné době na vzestupu a to i v ekonomicky vyspělých zemích s vysokou proočkovaností jako je Česká republika. Tento vzestup je přičítán zejména přechodu z celobuněčných vakcín na vakcíny acelulární. Acelulární vakcíny jsou sice ve srovnání s celobuněčnými méně reaktogenní, nicméně poskytují sníženou a kratší ochranu před nákazou. Navíc došlo u cirkulujících kmenů B. pertussis v reakci na antigeny obsažené ve vakcínách ke genotypovým změnám. Naším cílem je analyzovat celogenomové sekvence a produkci faktorů virulence v klinických izolátech získaných na území České republiky v letech 2008 – 2015. Pro srovnávací analýzu budou využity i původní vakcinační kmeny používané k výrobě celobuněčné vakcíny. Dále pomocí proteomiky a imunoprecipitace použijeme séra pacientů nakažených černým kašlem k identifikaci nových imunogenních antigenů produkovaných současnými kmeny B. pertussis.

• MeSH
• Bordetella pertussis genetika   patogenita   MeSH
• faktory virulence rodu Bordetella analýza   MeSH
• lidé MeSH
• pertuse genetika   prevence a kontrola   MeSH
• sekvenování celého genomu metody   MeSH
• virulence MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• genetika, lékařská genetika
• pneumologie a ftizeologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

• MeSH
• mikrobiologické jevy MeSH
• molekulární biologie MeSH
• virulence * MeSH
• Publikační typ
• periodika MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• virologie
• molekulární biologie, molekulární medicína

Structural and evolutional features of recently detected, closely still undefined dominant hypervirulent clonal complex of N. meningitidis, showing increased clinical and epidemiological significance for population of Central Europe, will be assessed. Scientifically original description of the novel hypervirulent complex will be affored by a precise gene sequencing classification, offering internationally standardized definition of isolate features by the means of informational network.

Genetická analýza určí celkovou strukturu a vývojové směry nově detegovaného dosud blíže nepopsaného dominantního hypervirulentního klonálního komplexu N.meningitidis o mimořádném klinickém i epidemiologickém významu pro populaci střední Evropy. Vědeckypůvodní popis povahy nového hypervirulentního komplexu provedeme vysoce přesnou metodou genové sekvenční klasifikace, umožňující celosvětově standardizovaný popis izolátů a sdílení výsledků prostřednictvím informační sítě. Výsledky projektu bezprostředněumožní účinný monitoring pokarčujícího šíření hypervirulentního komplexu v republikovém i širším rámci jako předpoklad přijetí preventivních klinicko-epidemiologických opatření. Identifikace ústředního hypervirulentního komplexu, charakteristického proúpočetnou populaci států bývalého Východního bloku, poskytne klíčové poznatky pro volbu optimálního složení vyvíjené univerzální vakciny pro eradikaci meningokokového onemocnění.

• MeSH
• genetické testování MeSH
• meningitida epidemiologie   MeSH
• meningokokové infekce klasifikace   epidemiologie   MeSH
• meningokokové vakcíny terapeutické užití   MeSH
• Neisseria meningitidis klasifikace   patogenita   MeSH
• vakcinace MeSH
• virulence MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• virologie
• epidemiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• imunita MeSH
• interakce hostitele a parazita MeSH
• virulence MeSH

• Konspekt
• Mikrobiologie
• NLK Obory
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• virologie
• NLK Publikační typ
• elektronické časopisy

• MeSH
• cytokiny MeSH
• Rickettsia typhi patogenita   imunologie   MeSH
• rickettsiové infekce imunologie   MeSH
• virulence MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• infekční lékařství
• alergologie a imunologie

• MeSH
• virulence MeSH

• Konspekt
• Mikrobiologie
• NLK Obory
• bakteriologie

Předmětem projektu je konstrukce takové molekuly DNA, která by sloužila jako vnitřní kontrola úspěšné polymerázové řetězové reakce při detekci cytomegaloviru, neinterferovala by s potenciálně přítomným genetickým materiálem viru a zvýšila validitu CMV.

• MeSH
• cytomegalovirové infekce diagnóza   MeSH
• Cytomegalovirus patogenita   MeSH
• DNA primery diagnostické užití   MeSH
• ELISA využití   metody   MeSH
• polymerázová řetězová reakce využití   metody   MeSH
• rekombinantní DNA diagnostické užití   analýza   MeSH
• virulence MeSH

• Konspekt
• Biologické vědy
• NLK Obory
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• biologie
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• chemie, klinická chemie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

K doporučení aplikace pneumokokové vakciny je nutné znát distribuci serotypů a incidenci závažných pneumokokových infekcí.Zavedení ELISA testu k průkazu vzestupu titru specifických protilátek v séru pacientů zpřesní určení etiologické diagnozy. Genetickémarkery budou použity k průkazu rezistentních klonů serotypů 6B a 23F u kmenů S.pneumoniae izolovaných od pacientů a z nasofarynxu zdravých osob.Bude zjištěno procento nosičství a distribuce typů v nasofarynxu zdravých osob.

• MeSH
• ELISA využití   trendy   metody   MeSH
• pneumokokové infekce patofyziologie   diagnóza   komplikace   MeSH
• sérotypizace využití   metody   MeSH
• Streptococcus pneumoniae genetika   MeSH
• vakcíny konjugované terapeutické užití   MeSH
• virulence MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• mikrobiologie, lékařská mikrobiologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Odpověď hostitele na infekci Toxoplasma gondii bývá odlišná podle virulence kmene.Tyto rozdíy,jako např.zvýšená stimulace syntézy některých cytokinů či suprese buněčné odpovědi při infekci virulentnějším kmenem se projeví na patogenezi. Srovnání dynamikytvorby protilátek a cytokinů,blastické transformace lymfocytů,zastoupení typů leukocytů a histopatologických změn při infekci různě virulentními kmeny T.gondii poskytne komplexní pohled na význam virulence pro hostitelskou odpověď.

• MeSH
• imunologická odpověď na dávku MeSH
• interferon gama diagnostické užití   MeSH
• modely nemocí na zvířatech MeSH
• Toxoplasma patogenita   parazitologie   MeSH
• toxoplazmóza imunologie   MeSH
• virulence imunologie   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• parazitologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• Bacteria MeSH
• plazmidy MeSH
• rozptýlené repetitivní sekvence MeSH
• virulence MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• bakteriologie
• biologie