-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
A combined immunoprecipitation and mass spectrometric approach to determine ΔNp63-interacting partners [Kombinace přístupů imunoprecipitace a hmotnostní spektrometrie v analýze interakčních partnerů ΔNp63]
Hernychova L., Nekulová M., Potěšil D., Michalova E., Zdráhal Z., Vojtěšek B., Holcakova J.
Jazyk angličtina Země Česko
Typ dokumentu práce podpořená grantem
- Klíčová slova
- protein-proteinové interakce, p63,
- MeSH
- DNA vazebné proteiny MeSH
- hmotnostní spektrometrie * metody statistika a číselné údaje MeSH
- imunoprecipitace * metody MeSH
- lidé MeSH
- mapování interakce mezi proteiny metody MeSH
- nádorové buněčné linie MeSH
- nádorové supresorové proteiny analýza chemie MeSH
- protein - isoformy MeSH
- proteomika metody MeSH
- protilátky analýza chemie MeSH
- techniky in vitro MeSH
- trans-aktivátory chemie MeSH
- transkripční faktory * analýza chemie MeSH
- výzkum MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
Exprese p63 je nezbytná pro tvorbu epidermis a dalších vrstev epitelu. Je přítomen ve vysokých koncentracích v různých kožních nádorech, podílí se na rakovinném bujení a kontroluje chemosenzitivitu. Identifikace interakčních partnerů p63 je nezbytná pro pochopení celého systému genové regulace řídící vývoj epitelu. Tyto znalosti mohou také pomoci objasnit signální dráhy podílející se na odpovědi lidské kůže poškozené UV zářením. K identifikaci proteinů tvořících komplexy s ∆Np63 byly použity proteomické přístupy. Proteiny byly izolovány imunoprecipitací ∆Np63-specifickou protilátkou a následně analyzovány hmotnostní spektrometrií. Identifikovali jsme 23 proteinů, potenciálních interakčních partnerů ∆Np63, které nebyly nalezeny v kontrolních vzorcích. Získané výsledky budou ověřeny dalšími metodami.
Expression of p63 is essential for the formation of epidermis and other stratifying epithelia. Moreover p63 is highly expressed in several epithelial cancers and is involved in tumourigenesis and controlling chemo-sensitivity. The identification of p63 interacting partners is essential for understanding the complex network of gene regulation managing epithelial development and could also help to reveal signalling pathways participating in UV-damage response in human skin. We used a proteomic approach to identify proteins that interact with ∆Np63. Proteins were isolated by immunoprecipitation with ∆Np63 specific antibody and analysed by mass spectrometry. We identified 23 proteins as potential ∆Np63 binding partners that were not present in negative control samples. These results will be evaluated using other methods.
Core Facility Proteomics CEITEC Masaryk University Brno
Regional Centre for Applied Molecular Oncology Masaryk Memorial Cancer Institute Brno
Kombinace přístupů imunoprecipitace a hmotnostní spektrometrie v analýze interakčních partnerů ΔNp63
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc13019104
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20221124125615.0
- 007
- ta
- 008
- 130520s2012 xr d f 000 0|eng||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a eng $b cze
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Hernychová, Lenka, $d 1965- $7 xx0073983 $u Regional Centre for Applied Molecular Oncology, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno
- 245 12
- $a A combined immunoprecipitation and mass spectrometric approach to determine ΔNp63-interacting partners / $c Hernychova L., Nekulová M., Potěšil D., Michalova E., Zdráhal Z., Vojtěšek B., Holcakova J.
- 246 31
- $a Kombinace přístupů imunoprecipitace a hmotnostní spektrometrie v analýze interakčních partnerů ΔNp63
- 520 3_
- $a Exprese p63 je nezbytná pro tvorbu epidermis a dalších vrstev epitelu. Je přítomen ve vysokých koncentracích v různých kožních nádorech, podílí se na rakovinném bujení a kontroluje chemosenzitivitu. Identifikace interakčních partnerů p63 je nezbytná pro pochopení celého systému genové regulace řídící vývoj epitelu. Tyto znalosti mohou také pomoci objasnit signální dráhy podílející se na odpovědi lidské kůže poškozené UV zářením. K identifikaci proteinů tvořících komplexy s ∆Np63 byly použity proteomické přístupy. Proteiny byly izolovány imunoprecipitací ∆Np63-specifickou protilátkou a následně analyzovány hmotnostní spektrometrií. Identifikovali jsme 23 proteinů, potenciálních interakčních partnerů ∆Np63, které nebyly nalezeny v kontrolních vzorcích. Získané výsledky budou ověřeny dalšími metodami.
- 520 9_
- $a Expression of p63 is essential for the formation of epidermis and other stratifying epithelia. Moreover p63 is highly expressed in several epithelial cancers and is involved in tumourigenesis and controlling chemo-sensitivity. The identification of p63 interacting partners is essential for understanding the complex network of gene regulation managing epithelial development and could also help to reveal signalling pathways participating in UV-damage response in human skin. We used a proteomic approach to identify proteins that interact with ∆Np63. Proteins were isolated by immunoprecipitation with ∆Np63 specific antibody and analysed by mass spectrometry. We identified 23 proteins as potential ∆Np63 binding partners that were not present in negative control samples. These results will be evaluated using other methods.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a výzkum $7 D012106
- 650 12
- $a hmotnostní spektrometrie $x metody $x statistika a číselné údaje $7 D013058
- 650 12
- $a imunoprecipitace $x metody $7 D047468
- 650 _2
- $a protilátky $x analýza $x chemie $7 D000906
- 650 _2
- $a proteomika $x metody $7 D040901
- 650 _2
- $a mapování interakce mezi proteiny $x metody $7 D025941
- 650 _2
- $a nádorové supresorové proteiny $x analýza $x chemie $7 D025521
- 650 12
- $a transkripční faktory $x analýza $x chemie $7 D014157
- 650 _2
- $a nádorové buněčné linie $7 D045744
- 650 _2
- $a protein - isoformy $7 D020033
- 650 _2
- $a trans-aktivátory $x chemie $7 D015534
- 650 _2
- $a DNA vazebné proteiny $7 D004268
- 650 _2
- $a techniky in vitro $7 D066298
- 653 00
- $a protein-proteinové interakce
- 653 00
- $a p63
- 655 _2
- $a práce podpořená grantem $7 D013485
- 700 1_
- $a Nekulová, Miroslava, $d 1946- $7 jn20000401848 $u Regional Centre for Applied Molecular Oncology, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno
- 700 1_
- $a Vojtěšek, Bořivoj, $d 1960- $7 xx0001694 $u Core Facility – Proteomics CEITEC, Masaryk University, Brno
- 700 1_
- $a Michalová, Eva. $7 xx0190116 $u Regional Centre for Applied Molecular Oncology, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno
- 700 1_
- $a Zdráhal, Zbyněk $7 xx0074482 $u Core Facility – Proteomics CEITEC, Masaryk University, Brno
- 700 1_
- $a B. Vojtěšek $u Regional Centre for Applied Molecular Oncology, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno
- 700 1_
- $a Holčáková, Jitka $7 xx0125776 $u Regional Centre for Applied Molecular Oncology, Masaryk Memorial Cancer Institute, Brno
- 773 0_
- $w MED00011030 $t Klinická onkologie $x 0862-495X $g Roč. 25, Supplementum 2 (2012), s. 64-69
- 773 0_
- $t RECAMO2020...prostřednictvím výzkumu rakoviny k aplikované molekulární onkologii... $x 0862-495X $g Roč. 25, Supplementum 2 (2012), s. 64-69 $w MED00196436
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/klinicka-onkologie/2012-supplementum-2/a-combined-immunoprecipitation-and-mass-spectrometric-approach-to-determine-dnp63-interacting-partners-40337 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b B 1665 $c 656 $y 3 $z 0
- 990 __
- $a 20130520 $b ABA008
- 991 __
- $a 20221124125608 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 983687 $s 817445
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2012 $b 25 $c Supplementum 2 $d 64-69 $i 0862-495X $m Klinická onkologie $x MED00011030 $y 69324
- BMC __
- $a 2012 $b 25 $c Supplementum 2 $d 64-69 $i 0862-495X $m RECAMO2020...prostřednictvím výzkumu rakoviny k aplikované molekulární onkologii... $x MED00196436 $y 40337
- LZP __
- $c NLK188 $d 20130606 $b NLK111 $a Meditorial-20130520