motiv rozpoznávající RNA [RNA Recognition Motif]

tematický
6
Termíny

motiv rozeznávající RNA
motiv RRM
RBD doména
ribonukleoproteinová doména
RNA rozeznávající motiv
RNA rozpoznávající motiv
RNP doména
RRM doména
RRM motiv

 

Ribonucleoprotein Domain
RRM Motif

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/D000071377
Definice

RNA-vazebný motiv tvořený asi osmdesáti aminokyselinami. Skládá se ze čtyř antiparalelních beta-skládaných listů a dvou alfa-helixů uspořádaných v pořadí beta-alfa-beta-beta-alfa-beta. Jeden z beta-listů interaguje s dvěma nebo třemi specifickými bázemi RNA. Interakce mezi dalšími sekvencemi a RNA a také v rámci RNA rozpoznávacího motivu zvyšují afinitu a specifitu interakce protein-RNA.

An approximately 80 amino acid RNA binding motif that consists of four anti-parallel surface beta sheets and two alpha helices arranged in a beta-alpha-beta-beta-alpha-beta configuration. One of the surface beta sheets interacts with two or three specific RNA bases. Interactions between additional sequences and the RNA, as well as within the RNA recognition motif increase the affinity and specificity of the protein-RNA interaction.

DUI
D000071377 MeSH Prohlížeč
CUI
M000613902
Předchozí užití
Amino Acid Sequence (1989-2016); RNA-Binding Proteins (1991-2016)
Historická pozn.
2017
Veřejná pozn.
2017

Povolená podhesla

PH
fyziologie
GE
genetika 6
IM
imunologie
DE
účinky léků
RE
účinky záření

G Jevy a procesy
G01 fyzikální jevy 79
G02 chemické jevy 308
G02.111 biochemické jevy 370
G02.111.570 molekulární struktura 1 332
G02.111.570.820 molekulární konformace 228
G02.111.570.820.709 konformace proteinů 558
G02.111.570.820.709.275 strukturní prvky proteinů 1
G02.111.570.820.709.275.500 aminokyselinové motivy 101
G02.111.570.820.709.275.500.869 RNA vazebné motivy
G02.111.570.820.709.275.500.869.250 vazebný motiv pro dvoušroubovici RNA 1
G02.111.570.820.709.275.500.869.500 motiv rozpoznávající RNA 6
G03 metabolismus 1 199
G03 metabolické jevy zastaralé
G04 fyziologie buňky 515
G05 genetické jevy 135
G06 mikrobiologické jevy 96
G07 fyziologické jevy 176
G08 reprodukční a urogenitální systém - fyziologické jevy 18
G09 fyziologie krevního oběhu a dýchání 94
G10 trávicí systém a ústa - fyziologické jevy 4
G11 muskuloskeletální a nervový systém - fyziologické jevy 17
G12 imunitní systém - jevy 249
G13 fyziologie kožního systému 14
G14 oči - fyziologické jevy 148
G15 fyziologie rostlin 158
G16 biologické jevy 130
G17 matematické pojmy 66

Přidat