• MeSH
• lidé MeSH
• mamografie statistika a číselné údaje   MeSH
• nádory děložního čípku diagnóza   MeSH
• nádory tračníku diagnóza   MeSH
• plošný screening statistika a číselné údaje   MeSH
• primární prevence * statistika a číselné údaje   MeSH
• služby preventivní péče statistika a číselné údaje   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Vývoj nádorů kolonu je doprovázen komplexními změnami buněčných lipidů a jejich metabolismu a je spojen s dalšími modulacemi chování buněk působením dietetických i endogenních lipidových složek. Zcela však chybí komplexní studie analyzující buněčný lipidom a identifikující vztahy lipidových molekul a běžně užívaných markerů nádorů kolonu. Kombinace analýz vzorků z nádorových pacientů a experimentální práce in vitro, plánovaná v projektu, směřuje k identifikaci a další charakterizaci prediktivního, diagnostického a terapeutického významu lipidových biomarkerů u nádorů kolonu. Využity budou pokročilé lipidomické a biomatematické přístupy. Identifikace změn ve složení lipidů, nebo v proteinech regulujících transport a metabolismus lipidů, poskytnou unikátní informace o lipidových nádorových markerech spojených s nádory kolonu i potenciálních terapeutických cílech. To pomůže zlepšit diagnostiku i terapeutické přístupy v klinické praxi.; The development of colon cancer (CC) is accompanied with complex changes of cellular lipids and/or their metabolism, and it is associated with further modulations of cell behaviour by both dietary and endogenous lipid compounds. However, complex studies analysing the CC cellular lipidome, and identifying relationships of these lipid molecules and currently used tumour biomarkers in CC, are largely missing. The proposed project intends to employ a combination of tumour patient sample screening and experimental work in vitro, in order to identify and further characterize predictive, diagnostic and/or therapeutic power of lipid biomarkers in CC, using the currently available advanced lipidomic and biomathematical techniques. Based on the identified changes in lipid composition, and/or proteins involved in regulation of lipid transport/metabolism, the project will provide unique information about lipid-related CC tumour markers and potential therapeutic targets. This may help to improve CC diagnostics or therapeutic tools in clinical practice.

• MeSH
• epitelové buňky chemie   MeSH
• lidé MeSH
• lipidomika MeSH
• lipidy chemie   MeSH
• mastné kyseliny chemie   MeSH
• metabolismus lipidů MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory tračníku diagnóza   MeSH
• výpočetní biologie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• biochemie
• gastroenterologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Rezistence na leky, vznikající v důsledku evoluce a selekce klonu nádorových buněk, je limitujícím faktorem pro účinnost protinádorové terapie. Z cirkulující nádorové ctDNA vyskytující se v plasmě lze metodou sekvenace zjišťovat genomické změny u solidních nádorů. Takovýto přístup umožňuje neinvazivní vyšetření pacienta. V předkládaném projektu budeme pomoci exomové sekvenace ctDNA sledovat genomickou evoluci buněk nádorů tračníka ve vztahu k léčbě. Hlavním záměrem je identifikovat mutace spjaté s rezistencí vůči chemoterapeutikům v genech DNA opravy. Porovnáme výsledky získané z párových vzorků plasmy odebraných před a po léčbě u pacientu se špatnou nebo dobrou odpovědí na chemoterapii. Nalezené mutace budou následně ověřeny na větším souboru pacientu. Mutace asociované s odpovědi na léčbu budou dále komplexně zkoumány z hlediska jejich vztahu a účinku na migraci, apoptózu a proliferaci nádorových buněk. Nejvýznamnějším přínosem projektu je možnost zlepšení účinnosti terapie u pacientů s nádory tračníka.; Drug resistance, acquired as a result of clonal evolution and selection, is a limiting factor of the efficacy of chemotherapy. Genomic alterations in solid cancers can be characterized by deep sequencing of cell-free tumor DNA (ctDNA) released into plasma from cancer cells, representing a non-invasive approach to monitor patients reaction to therapy. In this project, we will track genomic evolution of cancer in relation to the specific therapy by a whole exome sequencing of cfDNA isolated from advanced colon cancer patients. The main aim is to identify mutations in all DNA repair genes associated with chemoresistance. We will compare obtained outcomes in pre- and post-treatment plasma samples in good and non-responders to chemotherapy. The presence of mutations will by independently validated on a larger set of patients. Identified mutations associated with treatment response will be comprehensively tested for their functionality and impact on migration, apoptosis, and proliferation. The significance of the project lays on improvement of the therapy efficacy in colon cancer patien...

• MeSH
• chemorezistence genetika   MeSH
• genomika metody   MeSH
• lidé MeSH
• mutace MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory tračníku diagnóza   farmakoterapie   genetika   MeSH
• oprava DNA genetika   účinky léků   MeSH
• sekvenování exomu metody   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• genetika, lékařská genetika
• gastroenterologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Cell-free DNA (cfDNA) has recently been used as a non-invasive diagnostic tool for detecting tumour-specific mutations. cfDNA may also be used for monitoring disease progression and treatment response, but so far researchers focused on one or few genes only. A genomic profile may provide better information on patient prognosis compared to single specific mutations. In this hypothesis-generating study, we profiled by whole exome sequencing serial plasma samples from 10 colon cancer (CC) patients collected before and after 5-fluorouracil-based therapy, and one year after diagnosis to determine alterations associated with treatment response. In parallel, genome profiling was also performed in patients' corresponding tumour tissue to ascertain the molecular landscape of resistant tumours. The mutation concordance between cfDNA and tumour tissue DNA was higher in more advanced tumour stages than in the early stages of the disease. In non-responders, a specific mutation profile was observed in tumour tissues (TPSD1 p.Ala92Thr, CPAMD8 p.Arg341Gln, OBP2A p.ArgTyr123CysHis). A pathogenic APC mutation (p.Ser1315Ter) was detected only in cfDNA of one poor responder one year after the diagnosis and after therapy termination. Another poor responder presented a likely pathogenic TP53 mutation (p.Arg110Pro) in cfDNA of all plasma samplings and in tumour tissue. In conclusion, cfDNA could be used for genetic characterisation of CC patients and might be clinically useful for non-invasive therapy response monitoring.

• MeSH
• DNA nádorová * MeSH
• fluoruracil farmakologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutace * MeSH
• nádorové biomarkery * MeSH
• nádory tračníku krev   diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• prognóza MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• senioři MeSH
• staging nádorů MeSH
• stupeň nádoru MeSH
• volné cirkulující nukleové kyseliny * MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Cell-free DNA (cfDNA) has recently been used as a non-invasive diagnostic tool for detecting tumour-specific mutations. cfDNA may also be used for monitoring disease progression and treatment response, but so far researchers focused on one or few genes only. A genomic profile may provide better information on patient prognosis compared to single specific mutations. In this hypothesis-generating study, we profiled by whole exome sequencing serial plasma samples from 10 colon cancer (CC) patients collected before and after 5-fluorouracil-based therapy, and one year after diagnosis to determine alterations associated with treatment response. In parallel, genome profiling was also performed in patients' corresponding tumour tissue to ascertain the molecular landscape of resistant tumours. The mutation concordance between cfDNA and tumour tissue DNA was higher in more advanced tumour stages than in the early stages of the disease. In non-responders, a specific mutation profile was observed in tumour tissues (TPSD1 p.Ala92Thr, CPAMD8 p.Arg341Gln, OBP2A p.ArgTyr123CysHis). A pathogenic APC mutation (p.Ser1315Ter) was detected only in cfDNA of one poor responder one year after the diagnosis and after therapy termination. Another poor responder presented a likely pathogenic TP53 mutation (p.Arg110Pro) in cfDNA of all plasma samplings and in tumour tissue. In conclusion, cfDNA could be used for genetic characterisation of CC patients and might be clinically useful for non-invasive therapy response monitoring.

• MeSH
• DNA nádorová * MeSH
• fluoruracil farmakologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mutace * MeSH
• nádorové biomarkery * MeSH
• nádory tračníku krev   diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• prognóza MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• senioři MeSH
• staging nádorů MeSH
• stupeň nádoru MeSH
• volné cirkulující nukleové kyseliny * MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

OBJECTIVE: An understanding of the etiologic heterogeneity of colorectal cancer (CRC) is critical for improving precision prevention, including individualized screening recommendations and the discovery of novel drug targets and repurposable drug candidates for chemoprevention. Known differences in molecular characteristics and environmental risk factors among tumors arising in different locations of the colorectum suggest partly distinct mechanisms of carcinogenesis. The extent to which the contribution of inherited genetic risk factors for CRC differs by anatomical subsite of the primary tumor has not been examined. DESIGN: To identify new anatomical subsite-specific risk loci, we performed genome-wide association study (GWAS) meta-analyses including data of 48 214 CRC cases and 64 159 controls of European ancestry. We characterised effect heterogeneity at CRC risk loci using multinomial modelling. RESULTS: We identified 13 loci that reached genome-wide significance (p<5×10-8) and that were not reported by previous GWASs for overall CRC risk. Multiple lines of evidence support candidate genes at several of these loci. We detected substantial heterogeneity between anatomical subsites. Just over half (61) of 109 known and new risk variants showed no evidence for heterogeneity. In contrast, 22 variants showed association with distal CRC (including rectal cancer), but no evidence for association or an attenuated association with proximal CRC. For two loci, there was strong evidence for effects confined to proximal colon cancer. CONCLUSION: Genetic architectures of proximal and distal CRC are partly distinct. Studies of risk factors and mechanisms of carcinogenesis, and precision prevention strategies should take into consideration the anatomical subsite of the tumour.

• MeSH
• alely MeSH
• běloši genetika   MeSH
• cékum MeSH
• celogenomová asociační studie MeSH
• colon ascendens MeSH
• colon descendens MeSH
• colon sigmoideum MeSH
• colon transversum MeSH
• dospělí MeSH
• genetická heterogenita * MeSH
• genotyp MeSH
• jednonukleotidový polymorfismus MeSH
• kolon * MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• nádory rekta diagnóza   genetika   MeSH
• nádory tračníku diagnóza   genetika   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• studie případů a kontrol MeSH
• věk při počátku nemoci MeSH
• věkové rozložení MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• metaanalýza MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Research Support, N.I.H., Extramural MeSH

This study was undertaken to determine the frequency, and the clinicopathologic and genetic features, of colon cancers driven by neurotrophic receptor tyrosine kinase (NTRK) gene fusions. Of the 7008 tumors screened for NTRK expression using a pan-Trk antibody, 16 (0.23%) had Trk immunoreactivity. ArcherDx assay detected TPM3-NTRK1 (n=9), LMNA-NTRK1 (n=3), TPR-NTRK1 (n=2) and EML4-NTRK3 (n=1) fusion transcripts in 15 cases with sufficient RNA quality. Patients were predominantly women (median age: 63 y). The tumors involved the right (n=12) and left colon unequally and were either stage T3 (n=12) or T4. Local lymph node and distant metastases were seen at presentation in 6 and 1 patients, respectively. Lymphovascular invasion was present in all cases. Histologically, tumors showed moderate to poor (n=11) differentiation with a partly or entirely solid pattern (n=5) and mucinous component (n=10), including 1 case with sheets of signet ring cells. DNA mismatch repair-deficient phenotype was seen in 13 cases. Tumor-infiltrating CD4/CD8 lymphocytes were prominent in 9 cases. Programmed death-ligand 1 positive tumor-infiltrating immune cells and focal tumor cell positivity were seen in the majority of cases. CDX2 expression and loss of CK20 and MUC2 expression were frequent. CK7 was expressed in 5 cases. No mutations in BRAF, RAS, and PIK3CA were identified. However, other genes of the PI3K-AKT/MTOR pathway were mutated. In several cases, components of Wnt/β-catenin (APC, AMER1, CTNNB1), p53, and TGFβ (ACVR2A, TGFBR2) pathways were mutated. However, no SMAD4 mutations were found. Two tumors harbored FBXW7 tumor suppressor gene mutations. NTRK fusion tumors constitute a distinct but rare subgroup of colorectal carcinomas.

• MeSH
• adenokarcinom diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• fúzní onkogenní proteiny genetika   metabolismus   MeSH
• imunohistochemie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• membránové glykoproteiny genetika   metabolismus   MeSH
• nádorové biomarkery genetika   metabolismus   MeSH
• nádory tračníku diagnóza   genetika   patologie   MeSH
• následné studie MeSH
• onkogenní fúze MeSH
• receptor trkA genetika   metabolismus   MeSH
• receptor trkB genetika   metabolismus   MeSH
• receptor trkC genetika   metabolismus   MeSH
• regulace genové exprese u nádorů MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• staging nádorů MeSH
• tyrosinkinasové receptory genetika   metabolismus   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH

Endoskopické resekční techniky, jakými jsou endoskopická mukózní resekce a endoskopická submukózní disekce, představují efektivní metody léčby povrchových gastrointestinálních neoplazií. Endoskopická transmurální resekce (endoscopic full-thickness resection, EFTR) je nová endoskopická technika resekce celé stěny tlustého střeva, která umožňuje resekci neoplazie zasahující do hlubších vrstev stěny gastrointestinální trubice. Tato metoda kombinuje aplikaci „over-the-scope" klipu s následnou endoskopickou resekcí pomocí průhledného nástavce („capu") a diatermické kličky. Dochází tak k cílené perforaci, která je uzavřena ještě před resekcí. V této kazuistice prezentujeme případ 70leté pacientky s negranulární horizontálně se šířící lézí sigmoidea s negativním liftingem, která byla odstraněna endoskopicky technikou EFTR. Histologicky byla potvrzena kompletní resekce intramukózního karcinomu. Po výkonu nebyly dokumentovány žádné známky komplikací a pacientka byla po pěti dnech propuštěna do domácí péče. Tato kazuistika dokumentuje, že EFTR představuje bezpečnou a efektivní metodu léčby časného kolorektálního karcinomu.

Endoscopic resection techniques such as endoscopic mucosal resection or endoscopic submucosal dissection are effective tools for the treatment of superficial gastrointestinal neoplasia. Endoscopic full-thickness resection (EFTR) is a new endoscopic method with resection of the entire wall of colon. This method combines the application of an over-the-scope clip followed by endoscopic resection using a transparent cap and diathermic loop to produce a targeted perforation that is closed prior to resection. In this case report, we present a case of a 70-year-old female patient with laterally spreading tumor of sigmoideum, non-granular type with negative lifting sign, which was removed endoscopically by EFTR technique. Histologically was confirmed complete resection of intramucosal carcinoma. After the procedure there were no signs of complications and after five days was patient released home from the hospital. This case study documents that EFTR is a safe and effective therapeutic method of early colorectal cancer.

• MeSH
• gastrointestinální endoskopie metody   MeSH
• kolonoskopie metody   MeSH
• lidé MeSH
• nádory tračníku * chirurgie   diagnóza   MeSH
• senioři MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

BACKGROUND: A number of reports have evaluated the relationship between deficient DNA mismatch repair (dMMR) and colorectal cancer prognosis. Unfortunately, the exact prognostic role of dMMR has not been clearly established due to contradictory results. This study aims to determine the prognostic impact of dMRR in stage II colon cancer patients only. The appropriate identification of high-risk stage II colon cancers is of paramount importance in the selection of patients who may benefit from adjuvant treatment after surgery. METHODS: Four hundred and fifty-two patients with curative resection of stage II colon cancer were included. Hospital records were used as data source, providing clinical, surgical, pathology, oncology and follow-up information for statistical analysis focusing on overall survival (OS) and time to progression (TTP). Mismatch repair status was determined by immunohistochemistry. Patient survival was followed-up for a mean of 77·35 months. RESULTS: dMMR was detected in 93 of 452 patients (20·6%). No impact on overall survival (Log-Rank, p = 0·583, 95% CI 0·76-1·67). However, the hazard ratio 0·50 for TTP was highly significant (Log-Rank, p = 0·012, 95% CI 0·28-0·87) in patients with dMMR compared with those with mismatch repair proficient tumours (pMMR). CONCLUSIONS: Patients with dMMR tumours have a lower risk for recurrence compared to those with pMMR tumours, but this finding did not correlate to better overall survival.

• MeSH
• adenokarcinom diagnóza   genetika   metabolismus   MeSH
• DNA nádorová genetika   MeSH
• dospělí MeSH
• imunohistochemie MeSH
• kombinovaná terapie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• nádory tračníku diagnóza   genetika   terapie   MeSH
• následné studie MeSH
• oprava chybného párování bází DNA * MeSH
• prognóza MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• staging nádorů * MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři nad 80 let MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• multicentrická studie MeSH

BACKGROUND: Intestinal-type adenocarcinoma (ITAC) of the nasal cavity and paranasal sinuses is an uncommon tumor associated with exposure to wood and leather dust, nickel, and possibly smoking. ITAC shares phenotypical features with colorectal carcinoma. In contrast to most non-intestinal-type sinonasal adenocarcinomas, ITAC is an aggressive adenocarcinoma with poor clinical outcome; therefore, its reliable separation from non-ITAC is very important. AIM: The use of a combination of immunohistochemical markers of intestinal differentiation was tested in a cohort of sinonasal carcinomas of different types. The aim of this study was to explore a new intestinal marker, SATB2, in conjunction with CDX2 and CK20 in differential diagnosis of sinonasal adenocarcinomas. MATERIALS AND METHODS: Seven ITACs, 66 non-ITACs, and 1 case of extensive intestinal metaplasia (IM) of the nasal mucosa were included in the study and stained with SATB2, CK20, CDX2, and CK7 antibodies. Detection of mismatch repair proteins was performed in all cases of ITAC. All 7 sinonasal ITACs have been tested for KRAS, NRAS, and BRAF gene mutations. RESULTS: All ITACs showed positive expression for SATB2, whereas all non-ITAC cases were negative. The only 1 case of IM was found to be positive for SATB2, whereas the same case showed negative expression of CK20 and only focal immunostaining for CDX2. The genetic analysis showed that only 1 sinonasal ITAC (1/7) showed KRAS c.35G>C, p.(Gly12Ala) mutation, whereas BRAF and NRAS genes were wild type. Four ITACs revealed wild-type KRAS, NRAS, and BRAF, and 2 remaining cases were not analyzable. All ITACs showed preserved nuclear expression of mismatch repair proteins. CONCLUSIONS: SATB2 in combination with CDX2 and CK20 differentiates sinonasal ITAC from non-ITAC with increased diagnostic sensitivity and specificity and detects IM in the sinonasal tract more easily.

• MeSH
• adenokarcinom diagnóza   metabolismus   patologie   MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• dřevo MeSH
• imunohistochemie MeSH
• keratin-20 metabolismus   MeSH
• kolorektální nádory diagnóza   metabolismus   patologie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• metaplazie MeSH
• nádorové biomarkery metabolismus   MeSH
• nádory nosu diagnóza   metabolismus   patologie   MeSH
• nádory tračníku diagnóza   metabolismus   patologie   MeSH
• nosní dutina patologie   MeSH
• paranazální dutiny patologie   MeSH
• prognóza MeSH
• senioři MeSH
• střeva patologie   MeSH
• transkripční faktor CDX2 metabolismus   MeSH
• transkripční faktory metabolismus   MeSH
• vazebné proteiny DNA v oblastech připojení k matrix metabolismus   MeSH
• vystavení vlivu životního prostředí škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH