The International Classification of Diseases (ICD) hierarchical taxonomy is used for so-called clinical coding of medical reports, typically presented in unstructured text. In the Czech Republic, it is currently carried out manually by a so-called clinical coder. However, due to the human factor, this process is error-prone and expensive. The coder needs to be properly trained and spends significant effort on each report, leading to occasional mistakes. The main goal of this paper is to propose and implement a system that serves as an assistant to the coder and automatically predicts diagnosis codes. These predictions are then presented to the coder for approval or correction, aiming to enhance efficiency and accuracy. We consider two classification tasks: main (principal) diagnosis; and all diagnoses. Crucial requirements for the implementation include minimal memory consumption, generality, ease of portability, and sustainability. The main contribution lies in the proposal and evaluation of ICD classification models for the Czech language with relatively few training parameters, allowing swift utilisation on the prevalent computer systems within Czech hospitals and enabling easy retraining or fine-tuning with newly available data. First, we introduce a small transformer-based model for each task followed by the design of a transformer-based "Four-headed" model incorporating four distinct classification heads. This model achieves comparable, sometimes even better results, against four individual models. Moreover this novel model significantly economises memory usage and learning time. We also show that our models achieve comparable results against state-of-the-art English models on the Mimic IV dataset even though our models are significantly smaller.
- MeSH
- elektronické zdravotní záznamy MeSH
- klinické kódování * MeSH
- lidé MeSH
- mezinárodní klasifikace nemocí * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Koordinovaný postup provádění odběrů krve, preanalytického zpracování a uchovávání biologického materiálu v kteroukoli denní nebo noční dobu je důležité především u pacientů s prudce probíhajícím onemocněním, kdy zahájení léčby (např. výměnnou plazmaferézou) před provedením odběrů krve může ovlivnit výsledky laboratorních vyšetření a komplikovat další diferenciální diagnostiku. Do této skupiny řadíme jednoznačně i trombotické mikroangiopatie. V článku prezentujeme postup otestovaný v klinické praxi v podmínkách Fakultní nemocnice Ostrava. Ve druhém kroku byl postup představen a diskutován s experty z ostatních hematologických center. Výsledkem této diskuze bylo vytvoření univerzální žádanky o zpracování a archivaci vzorků krve, která může přispět ke standardizaci postupu v dalších zdravotnických zařízeních.
Coordinated blood collection, pre-analytical processing, and storage of biological material at any time of the day or night is particularly important in patients with rapidly progressive disease, where initiation of treatment (e. g., plasmapheresis) before blood collection may affect laboratory results and complicate further differential diagnosis. Thrombotic microangiopathies belong to this group of diseases. In this article, we present a procedure tested in clinical practice at the University Hospital Ostrava. Next, the procedure was presented and discussed with experts from other haematology centres. The result of this discussion was the creation of a universal request form for the processing and archiving of blood samples, which may contribute to the standardization of the procedure in other medical institutions.
- MeSH
- dobrovolné programy MeSH
- formuláře a záznamy - kontrola a vedení MeSH
- lidé MeSH
- povinné programy MeSH
- vakcinace * MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- směrnice pro lékařskou praxi MeSH
- MeSH
- chorobopisy normy MeSH
- formuláře a záznamy - kontrola a vedení * zákonodárství a právo MeSH
- fyzické omezení metody normy zákonodárství a právo MeSH
- krevní transfuze normy MeSH
- odběr tkání a orgánů normy MeSH
- odběr vzorku krve normy MeSH
- poskytování zdravotní péče klasifikace zákonodárství a právo MeSH
- zdravotní záznamy osobní MeSH
- získávání tkání a orgánů normy MeSH
- Klíčová slova
- kontrola kardiostimulátoru, stimulační práh,
- MeSH
- elektrokardiografie MeSH
- implantované elektrody * klasifikace MeSH
- klinické kódování MeSH
- lékařská informatika MeSH
- lidé MeSH
- software MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- MeSH
- demografie MeSH
- formuláře a záznamy - kontrola a vedení MeSH
- hlášení nemocí MeSH
- lidé MeSH
- rizikové faktory MeSH
- tuberkulóza * epidemiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
