Sekvenování nové generace se stává stále rozšířenější technologií s obrovským potenciálem vyšetřování onkologických onemocnění. Předkládáný projekt využívá tuto technologii k detekci mutací v genech, které se zapojují do procesu metylace genomu (TET2, ASXL1, IDH1/2, TP53 a EZH2) u pacientů s myelodysplastickým syndromem (MDS). Budeme zjišťovat vztah mezi úspěšností demetylační léčby a mutačním stavem genů. Navíc budeme studovat souvislost mezi kvantitou mutace TP53 a efektem léčby u pacientů léčených lenalidomidem. Dále budeme zjišťovat prediktivní dopady ultracitlivé detekce mutací v kinázové doméně BCR-ABL s rozvojem rezistence na léčbu imatinibem, nilotinibem a dasatinibem u pacientů s chronickou myeloidní leukémií (CML). Zaměříme se také na asociace mezi polymorfismy v promotorových oblastech genů transportních přenašečů (ABC a SLC) a odpovědí na léčbu. Touto studií bychom chtěli modelově představit možnost využití molekulární high-technologie jako nástroje pro individualizaci terapie MDS a CML.; The proposed project applies Next-generation sequencing for ultra-deep mutation detection in genes involved in genome methylation processes (TET2, ASXL1, IDH1 / 2, TP53, EZH2) in patients with myelodysplastic syndrome (MDS). We will determine the relationship between the success of therapy and the gene mutation status in patients receiving the demethylation treatment. In addition, we will study the relationship between quantity of TP53 mutations and treatment failure in patients treated with Lenalidomide. In chronic myeloid leukemia (CML) we would like to determine the predictive value of ultra-deep sequencing of BCR-ABL mutations for resistance development on tyrosine kinase inhibitors. We will also study the association between polymorphisms found in promoter regions of genes belonging to the superfamilies of membrane transporters (ABC and SLC) and response to treatment. This project introduces the possibility of using molecular high-technology as a tool for individualizing therapy of MDS and CML.

Doba řešení: 2012-2015