Projekt je zaměřen na studium bázových excizních oprav (BER) na buněčné i molekulární úrovni ve vztahu k strukturní a funkční organizaci aktivních replikonů a na cílené poškození BER s cílem nalézt nové možnosti léčby rakoviny. Očekáváme, že interakce enzymů zapojených v BER s modelovými duplexy DNA modifikovanými v kritických místech strukturně odlišnými nukleotidovými jednotkami (nukleosidové analogy a/nebo fosfonátové typy internukleotidových vazeb) umožní získání poznatků nutných pro cílené poškození BER systému. Projekt je navržen s cílem pokrýt celou dráhu od navržení a syntézy nukleosidových, nukleotidových a oligonukleotidových analogů, přes analýzu nukleosidových a nukleotidových koncentrací a mikroskopické analýzy DNA replikace a replikačních aparátů až po molekulární analýzu izolovaných DNA/proteinových komplexů.; The project is focused on the study of base excision repair (BER) at both cellular and molecular levels with respect to the structural and functional organization of active replicons and the targeted impairment of BER with the aim to find new possibilities of cancer treatment. We anticipate that interactions of BER enzymes with the model DNA duplexes modified in critical sites with the structurally diverse unnatural nucleotide units (nucleoside analogs and/or phosphonate types of the internucleotide linkages) enable the achievement of fundamental knowledge on the targeted impairment of base excision repair. The project is designed with the aim of covering the whole pathway from the design and synthesis of nucleoside, nucleotide, and oligonucleotide analogues, through the analysis of nucleoside and nucleotide pools, microscopy analysis of DNA replication and repair machineries up to the molecular analysis of isolated protein-DNA complexes.

Targeted damage of the DNA repair mechanisms as a tool for cancer therapy

Doba řešení: 2015-2018

Obsahuje literaturu