Detail
Report
Web resource
FT
Medvik - Catalogs
  • Something wrong with this record ?

Vývoj a standardizace metody analýzy přestaveb genů pro antigení receptory pomocí sekvenování nové generace pro využití v imunohematologii [The development and standardization of method for analysis of antigen receptor gene rearrangements using next generation sequencing for use in immunoh]

řešitel Eva Froňková, příjemce Univerzita Karlova

Published
2020
Series
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Pagination
Nestr.

Language Czech Country Czech Republic

Persistent link   https://www.medvik.cz/link/MED00208174

Grant support
NV16-32568A MZ0 CEP Register

Digital library NLK
In-house IP
Full text - Book

Links

Digitální knihovna

Next generation sequencing (NGS) has opened a unique possibility to sequence all rearrangements of immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TR) genes in biologic samples. Several groups including ours already presented data on the usefulness of NGS Ig/TR detection for the assessment of minimal residual disease (MRD) in lymphoid malignancies and for the evaluation of the entire immune spectrum in various normal and pathologic conditions. However, despite many advantages, the methodology still suffers from serious flaws, which prevent the introduction of the method into routine diagnostics. The aim of this project is (i) to develop and standardise in international collaboration several types of NGS Ig/TR assays for MRD detection in lymphoproliferative neoplasms, (ii) to prospectively evaluate the feasibility and performance of the new NGS-based approach compared to current gold standard methods (quantitative PCR and flow cytometry) in a cohort of patients with acute lymphoblastic leukemia.

Díky sekvenování nové generace (NGS) je nyní možné sekvenovat všechny přestavby genů pro imunoglobuliny (Ig) a T-buněčné receptory (TR) v biologických vzorcích. Několik skupin, včetně naší, již prezentovalo výsledky dokládající využitelnost detekce Ig/TCR pro stanovení minimální reziduální nemoci (MRD) u lymfoidních malignit a pro hodnocení imunitního repertoáru za fyziologických I patologických podmínek. I přes neoddiskutovatelné výhody má NGS stále závažné nedostatky, které brání použití metody pro rutinní diagnostiku. Cílem tohoto projektu je (i) zavést a standardizovat v rámci mezinárodní spolupráce různé typy Ig/TCR systémů pro detekci MRD u lymfoproliferativních malignit, (ii) prospektivně zhodnotit proveditelnost a využitelnost nového přístupu založeného na NGS v porovnání se současnými standardně používanými metodami (kvantitativní PCR a průtoková cytometry) na kohortě pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií.

The development and standardization of method for analysis of antigen receptor gene rearrangements using next generation sequencing for use in immunoh

Doba řešení: 2016-2019

Bibliography, etc.

Obsahuje literaturu

Owner Details Services
NLK NLK Shelf no. online [0] see E-resources
000      
00000ntm 2200000 i 4500
001      
MED00208174
003      
CZ-PrNML
005      
20231026111138.0
007      
ta
008      
211020s2020 xr a e 000 0|cze||
009      
ND
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e rda
041    0_
$a cze
044    __
$a xr
072    _7
$a 616 $x Patologie. Klinická medicína $2 Konspekt $9 14 $7 sk136316
086    __
$a NV16-32568A $p MZ0
100    1_
$a Froňková, Eva, $4 aut $d 1977- $7 xx0105058
245    10
$a Vývoj a standardizace metody analýzy přestaveb genů pro antigení receptory pomocí sekvenování nové generace pro využití v imunohematologii / $c řešitel Eva Froňková, příjemce Univerzita Karlova
246    31
$a The development and standardization of method for analysis of antigen receptor gene rearrangements using next generation sequencing for use in immunoh
264    _0
$c 2020
300    __
$a Nestr.
336    __
$a text $b txt $2 rdacontent
337    __
$a počítač $b c $2 rdamedia
338    __
$a online zdroj $b cr $2 rdacarrier
347    __
$a textový soubor $b PDF $2 rda
490    1_
$a Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
500    __
$a Doba řešení: 2016-2019
504    __
$a Obsahuje literaturu
520    0_
$a Díky sekvenování nové generace (NGS) je nyní možné sekvenovat všechny přestavby genů pro imunoglobuliny (Ig) a T-buněčné receptory (TR) v biologických vzorcích. Několik skupin, včetně naší, již prezentovalo výsledky dokládající využitelnost detekce Ig/TCR pro stanovení minimální reziduální nemoci (MRD) u lymfoidních malignit a pro hodnocení imunitního repertoáru za fyziologických I patologických podmínek. I přes neoddiskutovatelné výhody má NGS stále závažné nedostatky, které brání použití metody pro rutinní diagnostiku. Cílem tohoto projektu je (i) zavést a standardizovat v rámci mezinárodní spolupráce různé typy Ig/TCR systémů pro detekci MRD u lymfoproliferativních malignit, (ii) prospektivně zhodnotit proveditelnost a využitelnost nového přístupu založeného na NGS v porovnání se současnými standardně používanými metodami (kvantitativní PCR a průtoková cytometry) na kohortě pacientů s akutní lymfoblastickou leukémií.
520    9_
$a Next generation sequencing (NGS) has opened a unique possibility to sequence all rearrangements of immunoglobulin (Ig) and T-cell receptor (TR) genes in biologic samples. Several groups including ours already presented data on the usefulness of NGS Ig/TR detection for the assessment of minimal residual disease (MRD) in lymphoid malignancies and for the evaluation of the entire immune spectrum in various normal and pathologic conditions. However, despite many advantages, the methodology still suffers from serious flaws, which prevent the introduction of the method into routine diagnostics. The aim of this project is (i) to develop and standardise in international collaboration several types of NGS Ig/TR assays for MRD detection in lymphoproliferative neoplasms, (ii) to prospectively evaluate the feasibility and performance of the new NGS-based approach compared to current gold standard methods (quantitative PCR and flow cytometry) in a cohort of patients with acute lymphoblastic leukemia.
650    07
$a genetika, lékařská genetika $7 nlk20040147645 $2 mednas
650    07
$a onkologie $7 nlk20040148136 $2 mednas
650    07
$a alergologie a imunologie $7 nlk20040147037 $2 mednas
650    07
$a reziduální nádor $x diagnóza $x genetika $7 D018365 $2 czmesh
650    07
$a akutní lymfatická leukemie $x diagnóza $x genetika $7 D054198 $2 czmesh
650    07
$a lidé $7 D006801 $2 czmesh
650    07
$a vysoce účinné nukleotidové sekvenování $x metody $7 D059014 $2 czmesh
650    07
$a genová přestavba $7 D015321 $2 czmesh
650    07
$a imunoglobulin G $x genetika $7 D007074 $2 czmesh
650    07
$a receptory antigenů T-buněk $x genetika $7 D011948 $2 czmesh
655    _4
$a závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR $7 nlk-pt193
700    1_
$a Hrušák, Ondřej, $4 aut $d 1965- $7 xx0036691
710    2_
$a Univerzita Karlova. $b Lékařská fakulta, 2 $7 kn20010709367
710    2_
$a Fakultní nemocnice v Motole (Praha, Česko) $7 ko2002152562
810    1_
$a Česko. $b Ministerstvo zdravotnictví. $b Agentura pro zdravotnický výzkum. $t Závěrečná zpráva o řešení grantu
856    4_
$u https://kramerius.medvik.cz/search/handle/uuid:c9db17d7-2874-40f0-89b4-ee09e69ea48e $y Digitální knihovna
910    __
$a ABA008 $b online $y 0
990    __
$a 20211020 $b ABA008
991    __
$a 20231026111133 $b ABA008
999    __
$a kom $b medvik21 $g 1711687 $s 224887
BAS    __
$a 30
LZP    __
$b AZV-2019-20211020