Cirkulující mikroRNA (miRNA) jsou nové perspektivní semi-invazivní molekulární markery nádorů různých tkání. O jejich deregulaci u myelodysplastického syndromu (MDS) není známo mnoho informací. V současnosti je diagnostika MDS založena na morfologickém průkazu dysplázie v kostní dřeni. V navrhovaném projektu chceme využít sekvenování nové generace pro screening cirkulujících miRNA v krevní plazmě pacientů s MDS. Studiem profilů plasmatických miRNA i) u neléčených pacientů s odlišnými subtypy onemocnění, ii) v různých kategoriích rizika a iii) u pacientů v průběhu léčby chceme vytipovat cirkulující miRNA, jejichž hladina je asociovaná s průběhem choroby. Celogenomová analýza, po které bude následovat validační fáze na úrovni jednotlivých vybraných miRNA pomocí digitálního PCR, si klade za cíl nalézt nové semi-invazivní molekulární markery vhodné pro monitorování pacientů s MDS a tím v důsledku přispět k prevenci progrese onemocnění, zvýšení přežití a zároveň ke zlepšení komfortu pacientů.; Circulating microRNAs (miRNAs) are new promising semi-invasive molecular markers of various types of cancer. However, little information is known about their deregulation in myelodysplastic syndromes (MDS). Nowadays, the diagnosis of MDS is based on morphological evidence of bone marrow dysplasia. In the proposed project, we will employ next-generation sequencing for the screening of circulating miRNAs in plasma samples from MDS patients. Comparison of plasma miRNA profiles i) in untreated MDS patients with various disease subtypes, ii) in different risk category, and iii) in MDS patients during treatment will enable to select circulating miRNAs with altered levels associated with the course of the disease. The genome-wide analysis followed by a validation phase performed by digital PCR on the level of particular preselected miRNAs aims to identify novel semi-invasive molecular markers suitable for monitoring of MDS patients, finally contributing to prevention of the disease progression, increase of survival, and improving comfort of the patients.

Application of high-throughput technologies for screening of plasma circulating microRNAs in myelodysplastic syndromes

Doba řešení: 2016-2019

Obsahuje literaturu