Chronická lymfocytární leukémie (CLL) je častou a stále nevyléčitelnou leukémií dospělých, která je charakterizována mimořádnou genetickou i klinickou heterogenitou. V navrhovaném projektu se zaměříme na studium genetického pozadí klonální evoluce u neléčených pacientů s CLL, přičemž budeme sledovat vývoj změn ve vzorcích sbíraných opakovaně v průběhu onemocnění. Naším hlavním cílem je časné odhalení rizika progrese choroby a potřeby léčby. Plánujeme zhodnotit jak prognostický tak prediktivní význam genomických změn detekovaných před podáním terapie. Pro tento účel zavedeme vysoce komplexní test sekvenování nové generace (NGS), který současně analyzuje základní i nové biomarkery CLL. Využijeme výhod tzv. „capture-based” NGS, které umožňuje paralelně analyzovat IGHV mutační status, rekurentní chromozomové a genové defekty i klonalitu lehkých imunoglobulinových řetězců. Předpokládáme, že náš NGS panel navržený konkrétně pro CLL bude používán v klinické praxi jako jednoduchý komplexní test umožňující lepší prognostifikaci pacientů.; Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is common and still incurable leukemia of adults characterized by remarkable genetic and clinical heterogeneity. In the proposed project, we aim to study genetic background of clonal evolution in treatment naive CLL patients by tracking alteration dynamics in consecutive samples collected during the disease course. Our main objective is to early disclose the risk of disease progression and therapy need. We plan to assess both prognostic and predictive value of genomic aberrations detected before treatment administration. For this purpose, a highly complex next-generation sequencing (NGS) tool simultaneously analyzing both fundamental and novel CLL biomarkers will be implemented. We employ benefits of capture-based NGS technology enabling parallel analysis of IGHV mutational status, recurrent chromosomal and gene defects, and immunoglobulin light chains clonality. We presume that our NGS panel tailored for CLL can be widely adopted in clinical practice as a simple comprehensive test for better patient prognostication.

Comprehensive prognostic and predictive panel for chronic lymphocytic leukemia: a next-generation sequencing tool suitable for clinical practice and study of genetic architecture behind the disease evolution

Doba řešení: 2019-2022

Obsahuje literaturu