Analýza genomu je efektivním nástrojem pro určení příčin vzácných nemocí a objasnění funkce lidských genů. Genomický přístup by měl být využíván ve všech případech vzácných nemocí s negativními výsledky klinických, biochemických, metabolických, molekulárně biologických a cytogenetických vyšetření. V tomto projektu navrhujeme pokračování a rozšíření našich aktivit ve studiu genetických příčin a molekulárně biologických a buněčně patologických aspektů vzácných nemocí v pediatrické populaci. Pokusíme určit diagnózu a objasnit etiologii onemocnění ve skupině ~ 120 dětí a jejich rodin se vzácným geneticky podmíněným onemocněním neznámé příčiny. K objasnění genetických příčin využijeme kombinace metod sekvenování exomu, genomu a transkriptomu. Následně se zaměříme na charakterizaci patofyziologických aspektů jednotlivých nemocí , pokusíme se nalézt vhodné biomarkery a zavedeme specifické metody pro jejich postnatální, prenatální a prekoncepční diagnostiku. Součástí projektu bude i snaha o definici potenciálních terapeutických cílů případně protokolů pro cílené ovlivnění nemoci.; Genomic analysis is a very efficient diagnostic and gene discovery tool. It should ideally be applied in the diagnosis of all patients with rare diseases when the results of clinical, biochemical, metabolic, molecular and cytogenetic analyses do not lead to a specific diagnosis. In this project we propose continuation and expansion of our long-term efforts in the establishment and characterization of causal genetic and molecular defects, biological principles and pathophysiologic processes in a wide range of rare diseases. We will investigate a group of ~ 120 carefully phenotyped children and their families with rare diseases of pediatric-onset and unknown etiology using a combination of whole exome, whole genome and genome-wide RNA sequencing. Consequently we will focus on clinical, molecular and pathophysiologic characterization of individual genetic defects, identification of disease biomarkers, development of specific methods for postnatal, prenatal and preconception diagnosis and identification of potential therapeutic targets and protocols for specific therapeutic approaches.

Characterization of the molecular basis of rare genetic diseases of pediatric onset using new methods of genome analysis

Doba řešení: 2019-2022

Obsahuje literaturu