Infekce spojené se zdravotní péčí (ISZP) způsobené multirezistentními bakteriemi jsou častou komplikací provázející hospitalizaci. Jejich následkem dochází ke zhoršení kvality života pacientů, prodloužení doby hospitalizace a zvýšení nákladů na léčbu. Mezi nejzásadnější nemocniční patogeny patří Klebsiella pneumoniae produkující širokospektré betalaktamázy (ESBL KLPN) a karbapenemázy, methicilin-rezistentní Staphylococcus aureus (MRSA) a vankomycin-rezistentní Enterococcus faecium (VRE). Poznání způsobů jejich šíření v nemocničních zařízeních je klíčové pro zavedení účinných protiepidemických opatření. Molekulárně-biologické typizační metody slouží pro odlišení bakteriálních kmenů v rámci jednoho druhu a tím tvoří základní pilíř pro epidemiologické studie. Metodou s nejvyšší diskriminační schopností je v současnosti celogenomové sekvenování, které ve spojení s vhodnými bioinformatickými nástroji poskytuje informace nejen o příbuznosti bakteriálních kmenů izolovaných v nemocnicích, ale také genetické výbavě každého kmene a jeho patogenním potenciálu.; Healthcare associated infections (HAI) caused by multidrug-resistant bacteria are a frequent complication of hospitalization. It results in worsening patients' quality of life, prolonged hospitalization and a significant increase in treatment costs. The most important hospital pathogens include enterobacteria with the production of broad-spectrum betalactamases and carbapenemases, methicil-resistant Staphylococcus aureus and vancomycin-resistant Enterococcus faecium. Knowing the ways in which these dangerous pathogens are spread within hospital facilities is key to implementing effective anti-epidemic measures. Molecular typing methods are able to distinguish bacterial strains within one species and thus form the basis for epidemiological studies. The most discriminative method is currently whole-gene sequencing. In conjunction with appropriate bioinformatics tools, it provides information not only about the relatedness of bacterial strains isolated in hospitals, but also about the genetic content of each strain and its pathogenic potential.

Whole-Genome Sequencing for Hospital Epidemiology and Multi-drug Resistant Bacteria Outbreaks Detection

Doba řešení: 2019-2022

Obsahuje literaturu