Ovarian cancer is a disease with a high proportion of hereditary form. In the preceding project analyzing a gene panel in ovarian cancer patients and population-matched controls, we identified the surprisingly low frequency of mutations in genes with known/anticipated predisposition to ovarian cancer in patients diagnosed with ovarian cancer before the age of 30. Whereas mutation frequency in 18 predisposition genes in these very young patients was 15,5%, mutation frequency in the whole cohort (median age 53,7 years) reached 34,7%. In the proposed project, we aim to perform exome/genome sequencing together with gene panel RNA sequencing in the well-characterized group of women diagnosed with ovarian cancer before the age of 30 and in non-cancer controls older 60 years. After prioritization and confirmation, identified alterations will be further analyzed in other high-risk ovarian cancer patients and in unselected controls. Possible clinical use or inclusion of further regions or gene(s) into diagnostic gene panels will be discussed in Medical Associations.

Karcinom ovaria je onemocnění s vysokým podílem hereditární formy. V předcházejícím projektu zabývajícím se analýzou panelu genů u pacientek s karcinomem ovaria a populačně specifických kontrol jsme u velmi mladých pacientek detekovali překvapivě nízkou frekvenci patogenních mutací v genech se známou/předpokládanou asociací s karcinomem ovaria. U pacientek s diagnózou karcinomu ovaria do 30 let byla frekvence mutací v 18 predispozičních genech 15,5%, zatímco frekvence mutací v celém souboru (medián věku 53,7 let) dosahovala 34,7%. V navrhovaném projektu plánujeme provést sekvenování exomu/genomu v dobře charakterizovaném souboru žen s diagnózou karcinomu ovaria do 30 let doplněné o analýzu panelu genů na úrovni RNA a u nenádorových kontrol starších 60 let. Nalezené alterace budou po prioritizaci a konfirmaci dále analyzovány u dalších vysoce rizikových podskupin pacientek s karcinomem ovaria a u neselektovaných kontrol. Možný klinický výstup projektu a případné zařazení dalších genů/oblastí do používaných diagnostických panelů bude diskutováno v odborných společnostech.

Characterization of genetic predisposition to ovarian cancer using genomic approaches in patients diagnosed with ovarian cancer before the age of 30

Doba řešení: 2020-2023

Obsahuje literaturu