Tradiční metody identifikace mikroorganismů, založené převážně na sledování fenotypových projevů zkoumaných organismů, jsou stále důležitým zdrojem informací při charakterizaci nových bakteriálních druhů. V dnešní době však již existují moderní metody, díky kterým dokážeme nejenom přesněji určit jejich vzájemné fylogenetické vztahy, ale dosáhneme i maximální míry rozlišení mezi velmi příbuznými jedinci. Za zlatý standard se dnes v bakteriální taxonomii považuje sekvenování ribozomálních genů pro 16S nebo 23S rRNA. Důležitou roli hrají i jiné, zejména DNA-typizačni metody (RAPD, RFLP, ARDRA, aj.) nebo pulzní gelová elektroforéza.

Traditional methods of identifying microorganisms based on investigation of phenotypic properties give us still useful information for the characterization of newly revealed species. Nevertheless, faster and more accurate method for identification has been recently established. These methods allow better determination of phvlogenetic relationship and proper discrimination between closely related species. Sequencing of ribosomal genes for 16S and 23S rRNA has become widely accepted in the field of bacterial taxonomy. The important role play also other, mainly DNA-typing methods (RAPD, RFLP, ARDRA, etctc.) or pulsed-field gel electrophoresis.

Ústav kvasné chemie a bioinženýrství Vysoká škola chemicko technologická Praha

Lit.: 11