-
Something wrong with this record ?
První zkušenosti s molekulární analýzou tkáně pakloubu u vrozeně krátkého femuru (PFFD)
[First experience with molecular analysis of pseudoarthrosis tissue in congenital short femur (PFFD)]
Monika Frydrychová, Daniel Tvrdík, Pavel Dungl, Jiří Chomiak
Language Czech Country Czech Republic
Digital library NLK
Source
- MeSH
- Tissue Array Analysis methods MeSH
- Gene Expression genetics MeSH
- Femur abnormalities pathology MeSH
- Financing, Organized MeSH
- Neovascularization, Physiologic genetics MeSH
- Humans MeSH
- Leg Length Inequality genetics congenital MeSH
- Osteogenesis genetics MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
Úvod: I když je vrozený defekt femuru (PFFD) dobře charakterizován morfologicky, změny na molekulární úrovni nejsou v literatuře popsány. Tento informační nedostatek společně s neznámou etiologií vady nás vedl k myšlence analýzy procesů angiogeneze a osteogeneze v tkáni pakloubu pacientů s PFFD v porovnání s fyziologickou kostí. Očekávali jsme rozdíly v genové expresi, zejména kvantitativní. Materiál a metodika: Během plánovaných ortopedických výkonů jsme odebrali kostní bloček, vložili do prezervačního média (RNA stabilization reagent), které brání degradaci RNA, a hluboce zmrazili. Poté jsme izolovali RNA a transkripční profil studovali biočipovou analýzou (SuperArray Bioscience Corporation). Celkem je tímto způsobem možno detekovat 113 genů osteogeneze a 113 genů angiogeneze. Od října roku 2005 do konce roku 2008 jsme vyšetřili vzorky od 7 pacientů s PFFD a 3 kontrolní vzorky. Některé analýzy jsme pro ověření výsledků opakovali, celkem jsme použili 13 čipů pro osteogenezi a 11 pro angiogenezi. Výsledky: Zaznamenali jsme rozdíly v kvantitě i typech exprimovaných genů. Některé geny byly exprimovány u PFFD více proti kontrolnímu vzorku (gen pro kalcitoninový receptor, kolagen XII, kolagen I alfa2, kolagen II, kolagen IX, FGFR2, fibronektin, integrin), jiné naopak vykazovaly sníženou expresi (gen pro annexin A5, kolagen XVIII alfa 1, kolagen I alfa1, katepsin K, FGFR1, FGFR3, IGF2, VEGFB). Závěr: Naše původní předpoklady se potvrdily rozdílnou genovou expresí. Prozatím získané výsledky nedovolují zobecnění, jsou pouze prvním krokem k dalším experimentům, kterými je třeba potvrdit avizované informace a propojit je s klinickými nálezy, jako je alternativní cévní zásobení postižené končetiny u některých pacientů.
First experience with molecular analysis of pseudoarthrosis tissue in congenital short femur (PFFD)
Lit.: 12
- 000
- 00000naa 2200000 a 4500
- 001
- bmc10015268
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20111210175815.0
- 008
- 100629s2010 xr e cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Frydrychová, Monika $7 xx0106722
- 245 10
- $a První zkušenosti s molekulární analýzou tkáně pakloubu u vrozeně krátkého femuru (PFFD) / $c Monika Frydrychová, Daniel Tvrdík, Pavel Dungl, Jiří Chomiak
- 246 11
- $a First experience with molecular analysis of pseudoarthrosis tissue in congenital short femur (PFFD)
- 314 __
- $a Ortopedická klinika IPVZ a 1. LF UK, FN Na Bulovce, Budínova 2, 180 81 Praha 8
- 504 __
- $a Lit.: 12
- 520 3_
- $a Úvod: I když je vrozený defekt femuru (PFFD) dobře charakterizován morfologicky, změny na molekulární úrovni nejsou v literatuře popsány. Tento informační nedostatek společně s neznámou etiologií vady nás vedl k myšlence analýzy procesů angiogeneze a osteogeneze v tkáni pakloubu pacientů s PFFD v porovnání s fyziologickou kostí. Očekávali jsme rozdíly v genové expresi, zejména kvantitativní. Materiál a metodika: Během plánovaných ortopedických výkonů jsme odebrali kostní bloček, vložili do prezervačního média (RNA stabilization reagent), které brání degradaci RNA, a hluboce zmrazili. Poté jsme izolovali RNA a transkripční profil studovali biočipovou analýzou (SuperArray Bioscience Corporation). Celkem je tímto způsobem možno detekovat 113 genů osteogeneze a 113 genů angiogeneze. Od října roku 2005 do konce roku 2008 jsme vyšetřili vzorky od 7 pacientů s PFFD a 3 kontrolní vzorky. Některé analýzy jsme pro ověření výsledků opakovali, celkem jsme použili 13 čipů pro osteogenezi a 11 pro angiogenezi. Výsledky: Zaznamenali jsme rozdíly v kvantitě i typech exprimovaných genů. Některé geny byly exprimovány u PFFD více proti kontrolnímu vzorku (gen pro kalcitoninový receptor, kolagen XII, kolagen I alfa2, kolagen II, kolagen IX, FGFR2, fibronektin, integrin), jiné naopak vykazovaly sníženou expresi (gen pro annexin A5, kolagen XVIII alfa 1, kolagen I alfa1, katepsin K, FGFR1, FGFR3, IGF2, VEGFB). Závěr: Naše původní předpoklady se potvrdily rozdílnou genovou expresí. Prozatím získané výsledky nedovolují zobecnění, jsou pouze prvním krokem k dalším experimentům, kterými je třeba potvrdit avizované informace a propojit je s klinickými nálezy, jako je alternativní cévní zásobení postižené končetiny u některých pacientů.
- 650 _2
- $a femur $x abnormality $x patologie $7 D005269
- 650 _2
- $a nestejná délka dolních končetin $x genetika $x vrozené $7 D007870
- 650 _2
- $a čipová analýza tkání $x metody $7 D046888
- 650 _2
- $a exprese genu $x genetika $7 D015870
- 650 _2
- $a fyziologická neovaskularizace $x genetika $7 D018919
- 650 _2
- $a osteogeneze $x genetika $7 D010012
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a financování organizované $7 D005381
- 700 1_
- $a Tvrdík, Daniel $7 xx0141378
- 700 1_
- $a Dungl, Pavel, $d 1948- $7 jn20000400572
- 700 1_
- $a Chomiak, Jiří $7 xx0060351
- 773 0_
- $w MED00159009 $t Ortopedie $g Roč. 4, č. 3 (2010), s. 131-135 $x 1802-1727
- 910 __
- $a ABA008 $b B 2491 $c 515 $y 8
- 990 __
- $a 20100628164114 $b ABA008
- 991 __
- $a 20101027163207 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 751140 $s 614823
- BAS __
- $a 3
- BMC __
- $a 2010 $b 4 $c 3 $m Ortopedie $x MED00159009 $d 131-135
- LZP __
- $a 2010-30/vtmv