Detail
Article
Online article
FT
Medvik - BMC
  • Something wrong with this record ?

Infrastructure for data storage and computation in biomedical research [Infrastruktura pro ukládání dat a výpočty v biomedicínském výzkumu]

T. Kulhánek

Language English, Czech Country Czech Republic

Infrastruktura jako služba, tedy infrastruktura poskytovaná zákazníkovi formou služby poskytovatele, je jedním z modelu nasazení tzv. cloud computingu, který umožňuje využít datovou a výpočetní kapacitu v cloudu jako množinu fyzických či virtuálních zařízení. Infrastruktura jako služba může být poskytována zvlášť každému výzkumnému projektu a přitom sdílet stejné fyzické kapacity zapojených počítačů a zařízení. V současné době je testováno poskytování infrastruktury jako služby několika projektům v rámci aktivit sdružení CESNET, 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy v Praze (1. LF UK) a Hudební a taneční fakulty Akademie múzických umění v Praze (HAMU). Současný výzkum v oblasti výpočetní fyziologie je náročný na výpočetní kapacitu. Výpočetní úlohy jsou distribuovány počítačům, které jsou poskytovány infrastrukturou. Projekt v oblasti analýzy lidského hlasu je náročný na propustnost počítačové sítě mezi akustickým a video zařízením na lokální straně a analytickou aplikací na straně výkonného serveru. Tento příspěvek popisuje hlavní vlastnosti a výzvy pro infrastruktury určené pro takovýto typ aplikací. Infrastruktura jako model nasazení v rámci cloud computingu může být vhodná pro mezioborové týmy a pro spolupráci a integraci vysoce specializovaných softwarových aplikací.

Infrastructure as a service (infrastructure which is offered to a customer in the form of service of the provider) is a deployment model which allows utilize data and computing capacity of a cloud as a set of virtual devices and virtualized machines. Infrastructure as a service can be offered separately to each project. The same capacity of connected physical machines and devices can be shared. Currently, the concept of an Infrastructure as a service is tested on several projects within activity of the CESNET association, First Faculty of Medicine, Charles University, Prague and Musical and Dance Faculty of Academy of Performing Arts in Prague. The current research in the field of computation physiology is demanding on a high computation capacity. The computation tasks are distributed to computers, which are provided by the infrastructure. The project in the field of the analysis of a human voice is demanding on high throughput of a computer network between an acoustic or video device on the local side and an analytic application on the remote high performance server side. This paper describes features and main challenges for infrastructure dedicated for such a type of an application. Infrastructure as a deployment model of cloud computing might be beneficial for a multi domain team and for collaboration and integration of a high specialized software application.

Infrastruktura pro ukládání dat a výpočty v biomedicínském výzkumu

References provided by Crossref.org

Bibliography, etc.

Lit.: 18

000      
00000naa 2200000 a 4500
001      
bmc11005689
003      
CZ-PrNML
005      
20221006150334.0
008      
110606s2010 xr e eng||
009      
eAR
024    7_
$a 10.24105/ejbi.2010.06.1.10 $2 doi
040    __
$a ABA008 $b cze $c ABA008 $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng $a cze
044    __
$a xr
100    1_
$a Kulhánek, Tomáš $7 xx0094309
245    10
$a Infrastructure for data storage and computation in biomedical research / $c T. Kulhánek
246    31
$a Infrastruktura pro ukládání dat a výpočty v biomedicínském výzkumu
314    __
$a Institute of Pathophysiology, 1st Faculty of Medicine of Charles University, Laboratory of Biocybernetics and Computer Aided Teaching, Prague, Czech
504    __
$a Lit.: 18
520    3_
$a Infrastruktura jako služba, tedy infrastruktura poskytovaná zákazníkovi formou služby poskytovatele, je jedním z modelu nasazení tzv. cloud computingu, který umožňuje využít datovou a výpočetní kapacitu v cloudu jako množinu fyzických či virtuálních zařízení. Infrastruktura jako služba může být poskytována zvlášť každému výzkumnému projektu a přitom sdílet stejné fyzické kapacity zapojených počítačů a zařízení. V současné době je testováno poskytování infrastruktury jako služby několika projektům v rámci aktivit sdružení CESNET, 1. lékařské fakulty Univerzity Karlovy v Praze (1. LF UK) a Hudební a taneční fakulty Akademie múzických umění v Praze (HAMU). Současný výzkum v oblasti výpočetní fyziologie je náročný na výpočetní kapacitu. Výpočetní úlohy jsou distribuovány počítačům, které jsou poskytovány infrastrukturou. Projekt v oblasti analýzy lidského hlasu je náročný na propustnost počítačové sítě mezi akustickým a video zařízením na lokální straně a analytickou aplikací na straně výkonného serveru. Tento příspěvek popisuje hlavní vlastnosti a výzvy pro infrastruktury určené pro takovýto typ aplikací. Infrastruktura jako model nasazení v rámci cloud computingu může být vhodná pro mezioborové týmy a pro spolupráci a integraci vysoce specializovaných softwarových aplikací.
520    9_
$a Infrastructure as a service (infrastructure which is offered to a customer in the form of service of the provider) is a deployment model which allows utilize data and computing capacity of a cloud as a set of virtual devices and virtualized machines. Infrastructure as a service can be offered separately to each project. The same capacity of connected physical machines and devices can be shared. Currently, the concept of an Infrastructure as a service is tested on several projects within activity of the CESNET association, First Faculty of Medicine, Charles University, Prague and Musical and Dance Faculty of Academy of Performing Arts in Prague. The current research in the field of computation physiology is demanding on a high computation capacity. The computation tasks are distributed to computers, which are provided by the infrastructure. The project in the field of the analysis of a human voice is demanding on high throughput of a computer network between an acoustic or video device on the local side and an analytic application on the remote high performance server side. This paper describes features and main challenges for infrastructure dedicated for such a type of an application. Infrastructure as a deployment model of cloud computing might be beneficial for a multi domain team and for collaboration and integration of a high specialized software application.
650    _2
$a využití lékařské informatiky $7 D008491
650    _2
$a počítačové systémy $x trendy $x využití $7 D003199
650    _2
$a počítačové komunikační sítě $x organizace a řízení $x trendy $x využití $7 D003195
650    _2
$a biomedicínské technologie $7 D020811
650    _2
$a financování organizované $7 D005381
650    _2
$a cloud computing $7 D000067917
653    00
$a infrastruktura jako služba
653    00
$a virtualizace
653    00
$a virtualizace
653    00
$a výpočetní fyziologie
653    00
$a identifikace fyziologických systémů
653    00
$a validace fyziologických systémů
653    00
$a protokol vzdálené plochy
653    00
$a grid computing
653    00
$a hlasové pole
773    0_
$w MED00173462 $t European journal for biomedical informatics $g Roč. 6, č. 1 (2010), s. 53-57 $x 1801-5603
910    __
$a ABA008 $b online $y 1 $z 0
990    __
$a 20110321094316 $b ABA008
991    __
$a 20221006150328 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 833134 $s 697766
BAS    __
$a 3 $a 4
BMC    __
$a 2010 $b 6 $c 1 $d 53-57 $m European Journal for Biomedical Informatics $x MED00173462
LZP    __
$a 2011-19/vthv

Find record

Citation metrics

Loading data ...