• Je něco špatně v tomto záznamu ?

Flow cytometric chromosome sorting in plants: the next generation

J. Vrána, H. Simková, M. Kubaláková, J. Cíhalíková, J. Doležel,

. 2012 ; 57 (3) : 331-7.

Jazyk angličtina Země Spojené státy americké

Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc13012728

Genome analysis in many plant species is hampered by large genome size and by sequence redundancy due to the presence of repetitive DNA and polyploidy. One solution is to reduce the sample complexity by dissecting the genomes to single chromosomes. This can be realized by flow cytometric sorting, which enables purification of chromosomes in large numbers. Coupling the chromosome sorting technology with next generation sequencing provides a targeted and cost effective way to tackle complex genomes. The methods outlined in this article describe a procedure for preparation of chromosomal DNA suitable for next-generation sequencing.

Citace poskytuje Crossref.org

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc13012728
003      
CZ-PrNML
005      
20130411121043.0
007      
ta
008      
130404s2012 xxu f 000 0|eng||
009      
AR
024    7_
$a 10.1016/j.ymeth.2012.03.006 $2 doi
035    __
$a (PubMed)22440520
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng
044    __
$a xxu
100    1_
$a Vrána, Jan $u Centre of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Institute of Experimental Botany, Sokolovská 6, CZ-77200 Olomouc, Czech Republic.
245    10
$a Flow cytometric chromosome sorting in plants: the next generation / $c J. Vrána, H. Simková, M. Kubaláková, J. Cíhalíková, J. Doležel,
520    9_
$a Genome analysis in many plant species is hampered by large genome size and by sequence redundancy due to the presence of repetitive DNA and polyploidy. One solution is to reduce the sample complexity by dissecting the genomes to single chromosomes. This can be realized by flow cytometric sorting, which enables purification of chromosomes in large numbers. Coupling the chromosome sorting technology with next generation sequencing provides a targeted and cost effective way to tackle complex genomes. The methods outlined in this article describe a procedure for preparation of chromosomal DNA suitable for next-generation sequencing.
650    _2
$a umělé bakteriální chromozomy $7 D022202
650    _2
$a chromozomy rostlin $x ultrastruktura $7 D032461
650    _2
$a průtoková cytometrie $x metody $7 D005434
650    _2
$a délka genomu $7 D059646
650    12
$a genom rostlinný $7 D018745
650    _2
$a klíčení $x genetika $7 D018525
650    _2
$a vysoce účinné nukleotidové sekvenování $7 D059014
650    _2
$a ječmen (rod) $x cytologie $x genetika $7 D001467
650    _2
$a hybridizace in situ fluorescenční $7 D017404
650    _2
$a metafáze $x genetika $7 D008677
650    _2
$a fluorescenční mikroskopie $7 D008856
650    _2
$a polyploidie $7 D011123
650    _2
$a žito $x cytologie $x genetika $7 D012434
650    _2
$a semena rostlinná $x genetika $7 D012639
650    _2
$a sekvenční analýza DNA $7 D017422
650    _2
$a pšenice $x cytologie $x genetika $7 D014908
655    _2
$a časopisecké články $7 D016428
655    _2
$a práce podpořená grantem $7 D013485
700    1_
$a Simková, Hana $u -
700    1_
$a Kubaláková, Marie $u -
700    1_
$a Cíhalíková, Jarmila $u -
700    1_
$a Doležel, Jaroslav $u -
773    0_
$w MED00005029 $t Methods (San Diego, Calif.) $x 1095-9130 $g Roč. 57, č. 3 (2012), s. 331-7
856    41
$u https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22440520 $y Pubmed
910    __
$a ABA008 $b sig $c sign $y a $z 0
990    __
$a 20130404 $b ABA008
991    __
$a 20130411121313 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 975926 $s 811009
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2012 $b 57 $c 3 $d 331-7 $i 1095-9130 $m Methods $n Methods $x MED00005029
LZP    __
$a Pubmed-20130404

Najít záznam

Citační ukazatele

Možnosti archivace