• Je něco špatně v tomto záznamu ?

Detection panel for identification of twelve hemorrhagic viruses using real-time RT-PCR [Real time RT-PCR panel pro identifikaci dvanácti virů hemoragických horeček]

Fajfr M., Neubauerová V., Pajer P., Kubíčková P., Růžek D.

. 2014 ; 63 (3) : 238-244.

Jazyk angličtina Země Česko

Perzistentní odkaz   https://www.medvik.cz/link/bmc14079712

Úvod: Virové hemoragické horečky jsou způsobovány zástupci čtyř virových čeledí a patří mezi choroby s velmi vysokou smrtností. Pro jejich diagnostiku není dostupný žádný komerční kit. Výsledky: Vytvořili jsme real time RT-PCR panel pro detekci a identifikaci virů Ebola, Marburg, Lassa, Guanarito, Machupo, Sabiá, Seoul, Puumala, Hantaan, virus krymsko-konžské hemoragické horečky a horečky Rift Valley. Protokol funguje na principu jednotných reakčních podmínek a byl testován na různých PCR přístrojích jak kapilárních, tak i destičkových včetně polní verze termocykleru Ruggedized Advanced Pathogen Identification Device (R.A.P.I.D.) (Idaho Technology, Inc.). Závěr: V kombinaci s adaptovanými protokoly z již publikovaných prací představujeme jednoduchý detekční systém pro rychlou identifikaci původců virových hemoragických horeček z čeledí filoviru, arenavirů a bunyavirů s dostatečnou senzitivitou a specificitou pro použití laboratořích prvního kontaktu a pro diagnostiku v polních podmínkách.

Background: Viral hemorrhagic fevers are caused by viruses from four viral families and develop diseases with high fatality rates. However, no commercial diagnostic assay for these pathogens is available. Findings: We developed real-time RT-PCR assays for viruses Ebola, Marburg, Lassa, Guanarito, Machupo, Junin, Sabiá, Seoul, Puumala, Hantaan, Crimean-Congo hemorrhagic fever virus and Rift Valley fever virus. The assays were optimized for identical reaction conditions and can be performed using several types of real-time PCR instruments, both capillary and plate, including a portable Ruggedized Advanced Pathogen Identification Device (R.A.P.I.D.) (Idaho Technology, Inc.). Conclusions: In combination with primers and probes from previously published studies, we present a simple system for rapid identification of hemorrhagic filoviruses, arenaviruses and bunyaviruses with sufficient sensitivity for first contact laboratory and diagnosis under field conditions.

Real time RT-PCR panel pro identifikaci dvanácti virů hemoragických horeček

000      
00000naa a2200000 a 4500
001      
bmc14079712
003      
CZ-PrNML
005      
20141217121924.0
007      
ta
008      
141121s2014 xr d f 000 0|eng||
009      
AR
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
041    0_
$a eng $b cze
044    __
$a xr
100    1_
$a Fajfr, Miroslav $7 xx0238808 $u Faculty of Military Health Sciences, University of Defense, Hradec Králové; Institute of Clinical Microbiology, University Hospital in Hradec Králové, Hradec Králové
245    10
$a Detection panel for identification of twelve hemorrhagic viruses using real-time RT-PCR / $c Fajfr M., Neubauerová V., Pajer P., Kubíčková P., Růžek D.
246    31
$a Real time RT-PCR panel pro identifikaci dvanácti virů hemoragických horeček
520    3_
$a Úvod: Virové hemoragické horečky jsou způsobovány zástupci čtyř virových čeledí a patří mezi choroby s velmi vysokou smrtností. Pro jejich diagnostiku není dostupný žádný komerční kit. Výsledky: Vytvořili jsme real time RT-PCR panel pro detekci a identifikaci virů Ebola, Marburg, Lassa, Guanarito, Machupo, Sabiá, Seoul, Puumala, Hantaan, virus krymsko-konžské hemoragické horečky a horečky Rift Valley. Protokol funguje na principu jednotných reakčních podmínek a byl testován na různých PCR přístrojích jak kapilárních, tak i destičkových včetně polní verze termocykleru Ruggedized Advanced Pathogen Identification Device (R.A.P.I.D.) (Idaho Technology, Inc.). Závěr: V kombinaci s adaptovanými protokoly z již publikovaných prací představujeme jednoduchý detekční systém pro rychlou identifikaci původců virových hemoragických horeček z čeledí filoviru, arenavirů a bunyavirů s dostatečnou senzitivitou a specificitou pro použití laboratořích prvního kontaktu a pro diagnostiku v polních podmínkách.
520    9_
$a Background: Viral hemorrhagic fevers are caused by viruses from four viral families and develop diseases with high fatality rates. However, no commercial diagnostic assay for these pathogens is available. Findings: We developed real-time RT-PCR assays for viruses Ebola, Marburg, Lassa, Guanarito, Machupo, Junin, Sabiá, Seoul, Puumala, Hantaan, Crimean-Congo hemorrhagic fever virus and Rift Valley fever virus. The assays were optimized for identical reaction conditions and can be performed using several types of real-time PCR instruments, both capillary and plate, including a portable Ruggedized Advanced Pathogen Identification Device (R.A.P.I.D.) (Idaho Technology, Inc.). Conclusions: In combination with primers and probes from previously published studies, we present a simple system for rapid identification of hemorrhagic filoviruses, arenaviruses and bunyaviruses with sufficient sensitivity for first contact laboratory and diagnosis under field conditions.
650    12
$a polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí $x využití $7 D020133
650    12
$a hemoragické horečky virové $x diagnóza $x klasifikace $7 D006482
650    _2
$a RNA $x analýza $7 D012313
650    _2
$a hemoragická horečka Ebola $x diagnóza $7 D019142
650    _2
$a marburgská horečka $x diagnóza $7 D008379
650    _2
$a horečka Lassa $x diagnóza $7 D007835
650    _2
$a infekce viry z čeledi Arenaviridae $x diagnóza $7 D001117
650    _2
$a zvířata $7 D000818
650    _2
$a lidé $7 D006801
700    1_
$a Neubauerová, Věra, $d 1973- $7 stk2007383205 $u Central Military Institute of Health, Army of the Czech Republic, Prague
700    1_
$a Pajer, Petr $7 xx0119188 $u Central Military Institute of Health, Army of the Czech Republic, Prague
700    1_
$a Kubíčková, Petra $7 xx0241074 $u Central Military Institute of Health, Army of the Czech Republic, Prague
700    1_
$a Růžek, Daniel, $d 1981- $7 stk2008441707 $u Institute of Parasitology, Biology Centre of the Academy of Sciences of the Czech Republic, České Budějovice; Department of Virology, Veterinary Research Institute, Brno
773    0_
$w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 63, č. 3 (2014), s. 238-244
856    41
$u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2014-3-5/detection-panel-for-identification-of-twelve-hemorrhagic-viruses-using-real-time-rt-pcr-50386 $y plný text volně dostupný
910    __
$a ABA008 $b A 981 $c 560 $y 4 $z 0
990    __
$a 20141121 $b ABA008
991    __
$a 20141217122034 $b ABA008
999    __
$a ok $b bmc $g 1048821 $s 878733
BAS    __
$a 3
BAS    __
$a PreBMC
BMC    __
$a 2014 $b 63 $c 3 $d 238-244 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 75277
LZP    __
$c NLK183 $d 20141217 $b NLK118 $a Meditorial-20141121

Najít záznam

Citační ukazatele

    Možnosti archivace