-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Průkaz bakteriálních agens z hemokultur metodou fluorescenční in situ hybridizace
[Identification of bacteria from blood cultures by fluorescence in situ hybridization]
Černohorská L., Dolinková L.
Jazyk čeština Země Česko
- MeSH
- barvení a značení MeSH
- hybridizace in situ fluorescenční metody využití MeSH
- kultivační vyšetření krve MeSH
- lidé MeSH
- sepse diagnóza krev mikrobiologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
Diagnostika bakteriálního původce sepse z hemokultur bývá stěžejním bodem pro následnou léčbu. Cílem studie bylo porovnat barvení podle Grama, kultivaci a biochemickou identifikaci s metodikou, která detekuje mikroorganismy z pozitivních hemokultur pomocí specificky připravených sond na podkladě genotypové metody fluorescenční in situ hybridizace (FISH) a zjistit využitelnost této metody pro běžnou klinickou praxi. Metodou FISH bylo vyhodnoceno celkem 71 vzorků pozitivních hemokultur. Všechny tyto hemokultury byly zpracovány i klasickým způsobem tj. detekovány analyzátorem BACTEC, následně byly zachycené bakterie kultivovány na pevných půdách a biochemicky identifikovány. Shoda mezi výsledky získanými klasicky a stanovením HemoFISH nebyla stoprocentní, senzitivita byla 90,1 %. Velmi dobré výsledky vykazovala analýza stafylokoků a enterobakterií. Pouze ve třech případech jsme nezískali metodou FISH výsledek, protože nedošlo k hybridizaci sondy a bakteriální rRNA. Identifikace bakterií pomocí FISH je rychlejší než klasické metody, ale měla by být ověřena dalšími metodami.
The diagnosis of bacterial agents of sepsis from blood cultures is crucial for the subsequent treatment of this condition. The aim of this study was to compare Gram stain, culture, and biochemical identification (conventional methods) and fluorescence in-situ hybridisation (FISH) that detects microorganisms from positive blood cultures using specific probes. Another aim was to evaluate the potential of this method for use in clinical practice. Altogether 71 samples of positive blood cultures were tested by FISH. Blood cultures were also processed in the conventional way using the BACTEC analyser. The bacteria recovered were inoculated on solid media and then identified biochemically. The results obtained by the conventional methods and HemoFISH were not 100% concordant. The sensitivity of HemoFISH was 90.1%. Very good results were achieved for staphylococci and enterobacteria. FISH identification failed in three cases because the hybridization probes were not able to bind to bacterial rRNA. The FISH bacterial identification is faster than the conventional methods, but should be confirmed by the latter.
Identification of bacteria from blood cultures by fluorescence in situ hybridization
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc17022230
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20170724110509.0
- 007
- ta
- 008
- 170711s2017 xr f 000 0|cze||
- 009
- AR
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a cze $b eng
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Černohorská, Lenka $u Mikrobiologický ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně $7 xx0036697
- 245 10
- $a Průkaz bakteriálních agens z hemokultur metodou fluorescenční in situ hybridizace / $c Černohorská L., Dolinková L.
- 246 31
- $a Identification of bacteria from blood cultures by fluorescence in situ hybridization
- 520 3_
- $a Diagnostika bakteriálního původce sepse z hemokultur bývá stěžejním bodem pro následnou léčbu. Cílem studie bylo porovnat barvení podle Grama, kultivaci a biochemickou identifikaci s metodikou, která detekuje mikroorganismy z pozitivních hemokultur pomocí specificky připravených sond na podkladě genotypové metody fluorescenční in situ hybridizace (FISH) a zjistit využitelnost této metody pro běžnou klinickou praxi. Metodou FISH bylo vyhodnoceno celkem 71 vzorků pozitivních hemokultur. Všechny tyto hemokultury byly zpracovány i klasickým způsobem tj. detekovány analyzátorem BACTEC, následně byly zachycené bakterie kultivovány na pevných půdách a biochemicky identifikovány. Shoda mezi výsledky získanými klasicky a stanovením HemoFISH nebyla stoprocentní, senzitivita byla 90,1 %. Velmi dobré výsledky vykazovala analýza stafylokoků a enterobakterií. Pouze ve třech případech jsme nezískali metodou FISH výsledek, protože nedošlo k hybridizaci sondy a bakteriální rRNA. Identifikace bakterií pomocí FISH je rychlejší než klasické metody, ale měla by být ověřena dalšími metodami.
- 520 9_
- $a The diagnosis of bacterial agents of sepsis from blood cultures is crucial for the subsequent treatment of this condition. The aim of this study was to compare Gram stain, culture, and biochemical identification (conventional methods) and fluorescence in-situ hybridisation (FISH) that detects microorganisms from positive blood cultures using specific probes. Another aim was to evaluate the potential of this method for use in clinical practice. Altogether 71 samples of positive blood cultures were tested by FISH. Blood cultures were also processed in the conventional way using the BACTEC analyser. The bacteria recovered were inoculated on solid media and then identified biochemically. The results obtained by the conventional methods and HemoFISH were not 100% concordant. The sensitivity of HemoFISH was 90.1%. Very good results were achieved for staphylococci and enterobacteria. FISH identification failed in three cases because the hybridization probes were not able to bind to bacterial rRNA. The FISH bacterial identification is faster than the conventional methods, but should be confirmed by the latter.
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a sepse $x diagnóza $x krev $x mikrobiologie $7 D018805
- 650 _2
- $a kultivační vyšetření krve $7 D000071997
- 650 _2
- $a hybridizace in situ fluorescenční $x metody $x využití $7 D017404
- 650 _2
- $a barvení a značení $7 D013194
- 700 1_
- $a Dolinková, L. $u Mikrobiologický ústav LF MU a FN u sv. Anny v Brně $7 _AN092299
- 773 0_
- $w MED00011002 $t Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x 1210-7913 $g Roč. 66, č. 2 (2017), s. 86-90
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2017-2-4/prukaz-bakterialnich-agens-z-hemokultur-metodou-fluorescencni-in-situ-hybridizace-61277 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 981 $c 560 $y 4 $z 0
- 990 __
- $a 20170711 $b ABA008
- 991 __
- $a 20170724111007 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1238765 $s 983136
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2017 $b 66 $c 2 $d 86-90 $i 1210-7913 $m Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie $x MED00011002 $y 81386
- LZP __
- $c NLK182 $d 20170724 $b NLK111 $a Meditorial-20170711
