-
Je něco špatně v tomto záznamu ?
Whole-genome sequence of a reassortant G9P[4] rotavirus A strain from two children in the Czech Republic
R. Moutelíková, P. Sauer, J. Prodělalová,
Jazyk angličtina Země Rakousko
Typ dokumentu časopisecké články
Grantová podpora
16-29937A
Agentura Pro Zdravotnický Výzkum České Republiky
RO0518
Ministerstvo Zemědělství
NLK
ProQuest Central
od 2002-01-01 do Před 1 rokem
Medline Complete (EBSCOhost)
od 2000-01-01 do Před 1 rokem
Health & Medicine (ProQuest)
od 2002-01-01 do Před 1 rokem
Public Health Database (ProQuest)
od 2002-01-01 do Před 1 rokem
- MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom virový MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- rotavirové infekce virologie MeSH
- Rotavirus klasifikace genetika izolace a purifikace MeSH
- sekvence nukleotidů MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- Check Tag
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
An unusual reassortant rotavirus A (RVA) strain was isolated during RVA surveillance in two previously hospitalized children in 2018. G/P typing revealed uncommon G9P[4] genotypes, so the strains were further characterized by Illumina next-generation sequencing. Whole-genome typing showed that the two strains had a DS-1-like backbone except for NSP2: G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2. The two strains shared 99.9-100% nucleotide sequence identity in all genes.
Citace poskytuje Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc20022985
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20201214125055.0
- 007
- ta
- 008
- 201125s2020 au f 000 0|eng||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.1007/s00705-020-04648-w $2 doi
- 035 __
- $a (PubMed)32405825
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a eng
- 044 __
- $a au
- 100 1_
- $a Moutelíková, Romana $u Veterinary Research Institute, Brno, Czech Republic. moutelikova@vri.cz.
- 245 10
- $a Whole-genome sequence of a reassortant G9P[4] rotavirus A strain from two children in the Czech Republic / $c R. Moutelíková, P. Sauer, J. Prodělalová,
- 520 9_
- $a An unusual reassortant rotavirus A (RVA) strain was isolated during RVA surveillance in two previously hospitalized children in 2018. G/P typing revealed uncommon G9P[4] genotypes, so the strains were further characterized by Illumina next-generation sequencing. Whole-genome typing showed that the two strains had a DS-1-like backbone except for NSP2: G9-P[4]-I2-R2-C2-M2-A2-N1-T2-E2-H2. The two strains shared 99.9-100% nucleotide sequence identity in all genes.
- 650 _2
- $a sekvence nukleotidů $7 D001483
- 650 _2
- $a ženské pohlaví $7 D005260
- 650 _2
- $a genom virový $7 D016679
- 650 _2
- $a lidé $7 D006801
- 650 _2
- $a kojenec $7 D007223
- 650 _2
- $a fylogeneze $7 D010802
- 650 _2
- $a Rotavirus $x klasifikace $x genetika $x izolace a purifikace $7 D012401
- 650 _2
- $a rotavirové infekce $x virologie $7 D012400
- 650 _2
- $a sekvenování celého genomu $7 D000073336
- 651 _2
- $a Česká republika $7 D018153
- 655 _2
- $a časopisecké články $7 D016428
- 700 1_
- $a Sauer, Pavel $u Department of Microbiology, University Hospital Olomouc and Faculty of Medicine, Palacký University, Olomouc, Czech Republic.
- 700 1_
- $a Prodělalová, Jana $u Veterinary Research Institute, Brno, Czech Republic.
- 773 0_
- $w MED00009266 $t Archives of virology $x 1432-8798 $g Roč. 165, č. 7 (2020), s. 1703-1706
- 856 41
- $u https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32405825 $y Pubmed
- 910 __
- $a ABA008 $b sig $c sign $y a $z 0
- 990 __
- $a 20201125 $b ABA008
- 991 __
- $a 20201214125055 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1595304 $s 1113661
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2020 $b 165 $c 7 $d 1703-1706 $e 20200513 $i 1432-8798 $m Archives of virology $n Arch Virol $x MED00009266
- GRA __
- $a 16-29937A $p Agentura Pro Zdravotnický Výzkum České Republiky
- GRA __
- $a RO0518 $p Ministerstvo Zemědělství
- LZP __
- $a Pubmed-20201125
