Východiska: Invazivní duktální karcinom (invasive ductal carcinoma – IDC) je nejčastějším typem karcinomu prsu (breast cancer – BC) u žen s vysokou klinickou zátěží v důsledku svých vysoce invazivních vlastností. I přes to, že se rychle objevují nová data týkající se molekulární heterogenity invazivních karcinomů, mnohem méně je známo o molekulárních vzorcích IDC. Stále se zvyšující množství důkazů ukázalo, že heterogenní povaha BC souvisí s dysregulací dlouhých nekódujících RNA (long noncoding RNAs – lncRNAs). Metody: V této studii jsme analyzovali hladinu exprese dvou nových lncRNAs, LOC100288637 a RP11-48B3, v 51 tkáních IDC, které jsme porovnali s přilehlými nekancerózními tkáněmi. Nakonec bylo provedeno bioinformatické hodnocení. Výsledky: Výsledky kvantitativní polymerázové řetězové reakce ukázaly, že LOC100288637 a RP11-48B3 byly v nádorové tkáni významně overexprimovány, a to v porovnání s normálními vzorky (p = 0,0085 a p = 0,0002). Tyto dvě lncRNAs byly také overexprimovány jak v buněčné linii MDA-MB-231 tak v MCF-7 BC, ovšem v buněčné linii MDA-MB-231 byl pozorován vyšší vzorec exprese než u MCF7. Navíc LOC100288637 měl zvýšenou hladinu exprese u HER-2 pozitivních nádorů v porovnání s HER-2 negativními nádory (p = 0,031). Je zajímavé, že lncRNA RP11-48B3.4 byla upregulována u subjektů s IDC a menarche ve věku < 14 let, a to v porovnání s pacientkami s menarche ve věku ≥ 14 let (p = 0,041). Při jiném výsledku bylo pozorováno, že lncRNA RP11-48B3.4 je významně upregulována u nádorů nižšího histologického grade v porovnání se vzorky nádorů s vyšším grade (p = 0,047). A nakonec jsme pomocí bioinformatického hodnocení našli předpokládanou interakci mezi RP11-48B3.4 a mRNA „zinc finger and BTB domain containing 10“. Závěr: Naše zjištění svědčí o tom, že tyto lncRNAs, které potenciálně hrají onkogenní roli, jsou klinicky významně zapojeny do patogeneze IDC a mohou tedy sloužit jako nové markery pro diagnostiku a léčbu IDC.

Background: Invasive ductal carcinoma (IDC) is the most frequent type of breast cancer (BC) in women, with a high clinical burden due to its high invasive properties. Despite of quickly emerging new data regarding the molecular heterogeneity of invasive cancers, far less is known about the molecular patterns among cases of IDC. An expanding body of evidence has demonstrated that dysregulation of long noncoding RNAs (lncRNAs) is involved in the heterogeneity feature of BC. Methods: In this study, we analyzed the expression levels of two novel lncRNAs LOC100288637 and RP11-48B3 in 51 IDC tissues in comparison with adjacent non-cancerous tissues. And finally, bioinformatic evaluation has been done. Results: The results of quantitative polymerase chain reaction showed that LOC100288637 and RP11-48B3 were significantly overexpressed in tumor tissues compared to normal samples (P = 0.0085 and P = 0.0002, respectively). Also, the two lncRNAs were overexpressed in both MDA-MB-231 and MCF-7 BC cell lines, nevertheless, with a higher expression pattern in MDA-MB-231 than MCF7 cell line. Furthermore, LOC100288637 had an elevated expression level in HER-2 positive tumors compared to HER-2 negative tumors (P = 0.031). Interestingly, the lncRNA RP11-48B3.4 was upregulated in IDC subjects with the age at menarche < 14 years compared to patients with the age at menarche ≥ 14 (P = 0.041). It was observed in another result that lncRNA RP11-48B3.4 is significantly upregulated in tumors with a lower histological grade compared to tumor samples with higher grades (P = 0.047). And finally, using bioinformatic evaluation, we found a predicted interaction between RP11-48B3.4 and mRNA zinc finger and BTB domain containing 10 (ZBTB10). Conclusion: Altogether, our findings suggest that these lncRNAs with potential oncogenic roles are involved in the pathogenesis of IDC with clinical significance and they may therefore serve as novel markers for the diagnosis and treatment of IDC.

Department of Biology Faculty of Sciences Yazd University Yazd Iran

Department of Genetics Faculty of Medicine Babol University of Medical Sciences Babol Iran

Department of life science and system bio logy University of Turin Turin Italy

Department of Medical Genetics Fasa University of Medical Science Fasa Iran

Department of Medical Genetics School of Medicine Shiraz University of Medical Science Shiraz Iran

Department of Medical Immunology Shiraz University of Medical Science Shiraz Iran

Klinické hodnoty dvou lncRNA signální dráhy estrogenového receptoru u invazivního duktálního karcinomu prsu

Citace poskytuje Crossref.org