-
Something wrong with this record ?
Differential diagnosis of glioblastoma and solitary brain metastasis - the success of artificial intelligence models created with radiomics data obtained by automatic segmentation from conventional MRI sequences [Diferenciální diagnostika glioblastomu a solitárních metastáz mozku - úspěch modelů umělé inteligence vytvořených na základě radiomických dat získaných automatickou segmentací z konvenčních MR sekvencí]
E. Demirel, C. O. Gökaslan, O. Dilek, C. Ozdemir, M. G. Boyaci, S. Korkmaz
Language English Country Czech Republic
Digital library NLK
Source
NLK
ROAD: Directory of Open Access Scholarly Resources
from 2007
- Keywords
- automatická segmentace,
- MeSH
- Diagnosis, Computer-Assisted MeSH
- Glioblastoma * diagnostic imaging diagnosis MeSH
- Humans MeSH
- Magnetic Resonance Imaging MeSH
- Neoplasm Metastasis MeSH
- Brain Neoplasms * diagnostic imaging diagnosis secondary MeSH
- Image Processing, Computer-Assisted MeSH
- Machine Learning MeSH
- Check Tag
- Humans MeSH
Cíl: Cílem naší studie bylo odlišit glioblastom (GBM) od solitární metastázy mozku za pomoci strojových modelů vyvinutých na základě radiomických dat získaných automatickou segmentací nádoru z konvenčích MR skenů pacientů pomocí umělé inteligence. Metody: Naše studie byla prováděna na jednom pracovišti a byla retrospektivní. Do studie bylo zařazeno 35 pacientů s GBM a 25 pacientů se solitární metastázou na mozku, u nichž byla před operací provedena MR mozku s kontrastní látkou. Do programu BraTumIA byly nahrány T1 vážené obrazy, T1 vážené obrazy po podání kontrastní látky, T2 vážené obrazy a T2 vážené obrazy s využitím sekvence fluid attenuated inversion recovery (FLAIR). V programu byly léze pacienta pomocí umělé inteligence rozděleny do čtyř různých segmentů: nekróza, nesytící se solidní oblast, sytící se solidní oblast a peritumorózní edém. Z T1 obrazů po podání kontrastní látky a T2 FLAIR obrazů bylo extrahováno 856 znaků. Pro výběr znaků, optimalizaci modelu a validaci byl použit vnořený (nested) přístup. Byly modelovány umělé neuronové sítě, podpůrný vektorový stroj, náhodný les a naivní bayesovský klasifikátor. Funkce modelu byla hodnocena pomocí přesnosti, senzitivity, specificity a plochy pod křivkou (area under the curve; AUC). Výsledky: Mezi skupinami s GBM a s metastázou nebyly rozdíly ve věku a pohlaví. Nejúspěšnější výsledky byly získány pomocí algoritmu neuronové sítě – byla získána hodnota AUC 0,970. U algoritmů za použití podpůrného vektorové stroje, naivního bayesovského klasifikátoru, logistické regrese či náhodného lesu byly získány hodnoty AUC 0,959, 0,955, 0,955, respektive 0,917. Závěr: V diferenciální diagnostice GBM a solitárních metastáz mozku mohou modely umělé inteligence založené na radiomických datech pomocí automatické segmentace objektivně a s vysokou přesností odlišovat tak, že závislost na prostředku a osobě udržují na nejnižší úrovni za použití prostých konvenčních sekvencí.
Aim: Our study aimed to distinguish glioblastoma (GBM) from solitary brain metastasis with machine models developed with radiomics data obtained by artificial intelligence-based automatic tumour segmentation over conventional MRI of the patients. Methods: Our study was conducted as single-centre and retrospective. Thirty-five GBM and 25 solitary brain metastasis patients who had pre-operative contrast-enhanced brain MRI were included in the study. T1-weighted, postcontrast T1-weighted, T2-weighted and fluid attenuated inversion recovery (FLAIR) T2-weighted images of the patients were uploaded to the program named BraTumIA. With the program, the patient‘s lesions were divided into four different segments by artificial intelligence as necrosis, non-enhancing solid area, enhancing solid area and peritumorous oedema. 856 features were extracted from T1 post-contrast and T2 FLAIR images. A nested approach was used for feature selection, model optimization and validation. Artificial neural networks, support vector machine, random forest and naive bayes were modelled. Accuracy, sensitivity, specificity and area under the curve (AUC) parameters were used to evaluate the model performance. Results: There was no difference between GBM and metastasis groups in terms of age and gender. The most successful results were obtained in the neural network algorithm; 0.970 AUC was found. Other support vector machine, naive bayes, logistic regression and random forest algorithms also found 0.959, 0.955, 0.955, 0.917 AUC values, respectively. Conclusion: In the differential diagnosis of GBM and solitary brain metastasis, radiomics-based artificial intelligence models obtained by automatic segmentation can distinguish objectively and with high accuracy by keeping device and person dependency at the lowest level with only conventional sequences.
Department of Neurosurgery Afyonkarahisar Health Sciences University Afyonkarahisar Turkey
Department of Pathology Afyonkarahisar Health Sciences University Afyonkarahisar Turkey
Department of Radiology Afyonkarahisar Health Sciences University Afyonkarahisar Turkey
Diferenciální diagnostika glioblastomu a solitárních metastáz mozku - úspěch modelů umělé inteligence vytvořených na základě radiomických dat získaných automatickou segmentací z konvenčních MR sekvencí
References provided by Crossref.org
- 000
- 00000naa a2200000 a 4500
- 001
- bmc22005208
- 003
- CZ-PrNML
- 005
- 20220218154210.0
- 007
- ta
- 008
- 220124s2021 xr d f 000 0|eng||
- 009
- AR
- 024 7_
- $a 10.48095/cccsnn2021541 $2 doi
- 040 __
- $a ABA008 $b cze $d ABA008 $e AACR2
- 041 0_
- $a eng $b cze
- 044 __
- $a xr
- 100 1_
- $a Demirel, E. $u Department of Radiology, Afyonkarahisar Health Sciences University, Afyonkarahisar, Turkey
- 245 10
- $a Differential diagnosis of glioblastoma and solitary brain metastasis - the success of artificial intelligence models created with radiomics data obtained by automatic segmentation from conventional MRI sequences / $c E. Demirel, C. O. Gökaslan, O. Dilek, C. Ozdemir, M. G. Boyaci, S. Korkmaz
- 246 31
- $a Diferenciální diagnostika glioblastomu a solitárních metastáz mozku - úspěch modelů umělé inteligence vytvořených na základě radiomických dat získaných automatickou segmentací z konvenčních MR sekvencí
- 520 3_
- $a Cíl: Cílem naší studie bylo odlišit glioblastom (GBM) od solitární metastázy mozku za pomoci strojových modelů vyvinutých na základě radiomických dat získaných automatickou segmentací nádoru z konvenčích MR skenů pacientů pomocí umělé inteligence. Metody: Naše studie byla prováděna na jednom pracovišti a byla retrospektivní. Do studie bylo zařazeno 35 pacientů s GBM a 25 pacientů se solitární metastázou na mozku, u nichž byla před operací provedena MR mozku s kontrastní látkou. Do programu BraTumIA byly nahrány T1 vážené obrazy, T1 vážené obrazy po podání kontrastní látky, T2 vážené obrazy a T2 vážené obrazy s využitím sekvence fluid attenuated inversion recovery (FLAIR). V programu byly léze pacienta pomocí umělé inteligence rozděleny do čtyř různých segmentů: nekróza, nesytící se solidní oblast, sytící se solidní oblast a peritumorózní edém. Z T1 obrazů po podání kontrastní látky a T2 FLAIR obrazů bylo extrahováno 856 znaků. Pro výběr znaků, optimalizaci modelu a validaci byl použit vnořený (nested) přístup. Byly modelovány umělé neuronové sítě, podpůrný vektorový stroj, náhodný les a naivní bayesovský klasifikátor. Funkce modelu byla hodnocena pomocí přesnosti, senzitivity, specificity a plochy pod křivkou (area under the curve; AUC). Výsledky: Mezi skupinami s GBM a s metastázou nebyly rozdíly ve věku a pohlaví. Nejúspěšnější výsledky byly získány pomocí algoritmu neuronové sítě – byla získána hodnota AUC 0,970. U algoritmů za použití podpůrného vektorové stroje, naivního bayesovského klasifikátoru, logistické regrese či náhodného lesu byly získány hodnoty AUC 0,959, 0,955, 0,955, respektive 0,917. Závěr: V diferenciální diagnostice GBM a solitárních metastáz mozku mohou modely umělé inteligence založené na radiomických datech pomocí automatické segmentace objektivně a s vysokou přesností odlišovat tak, že závislost na prostředku a osobě udržují na nejnižší úrovni za použití prostých konvenčních sekvencí.
- 520 9_
- $a Aim: Our study aimed to distinguish glioblastoma (GBM) from solitary brain metastasis with machine models developed with radiomics data obtained by artificial intelligence-based automatic tumour segmentation over conventional MRI of the patients. Methods: Our study was conducted as single-centre and retrospective. Thirty-five GBM and 25 solitary brain metastasis patients who had pre-operative contrast-enhanced brain MRI were included in the study. T1-weighted, postcontrast T1-weighted, T2-weighted and fluid attenuated inversion recovery (FLAIR) T2-weighted images of the patients were uploaded to the program named BraTumIA. With the program, the patient‘s lesions were divided into four different segments by artificial intelligence as necrosis, non-enhancing solid area, enhancing solid area and peritumorous oedema. 856 features were extracted from T1 post-contrast and T2 FLAIR images. A nested approach was used for feature selection, model optimization and validation. Artificial neural networks, support vector machine, random forest and naive bayes were modelled. Accuracy, sensitivity, specificity and area under the curve (AUC) parameters were used to evaluate the model performance. Results: There was no difference between GBM and metastasis groups in terms of age and gender. The most successful results were obtained in the neural network algorithm; 0.970 AUC was found. Other support vector machine, naive bayes, logistic regression and random forest algorithms also found 0.959, 0.955, 0.955, 0.917 AUC values, respectively. Conclusion: In the differential diagnosis of GBM and solitary brain metastasis, radiomics-based artificial intelligence models obtained by automatic segmentation can distinguish objectively and with high accuracy by keeping device and person dependency at the lowest level with only conventional sequences.
- 650 _7
- $a lidé $7 D006801 $2 czmesh
- 650 17
- $a glioblastom $x diagnostické zobrazování $x diagnóza $7 D005909 $2 czmesh
- 650 17
- $a nádory mozku $x diagnostické zobrazování $x diagnóza $x sekundární $7 D001932 $2 czmesh
- 650 _7
- $a metastázy nádorů $7 D009362 $2 czmesh
- 650 _7
- $a magnetická rezonanční tomografie $7 D008279 $2 czmesh
- 650 _7
- $a strojové učení $7 D000069550 $2 czmesh
- 650 _7
- $a diagnóza počítačová $7 D003936 $2 czmesh
- 650 _7
- $a počítačové zpracování obrazu $7 D007091 $2 czmesh
- 653 00
- $a automatická segmentace
- 700 1_
- $a Gökaslan, O. C. $u Department of Radiology, Afyonkarahisar Health Sciences University, Afyonkarahisar, Turkey
- 700 1_
- $a Dilek, O. $u Department of Radiology, University of Health Sciences, Adana Teaching and Research Hospital, Adana, Turkey
- 700 1_
- $a Ozdemir, C. $u Department of Pathology, Afyonkarahisar Health Sciences University, Afyonkarahisar, Turkey
- 700 1_
- $a Boyaci, G. M. $u Department of Neurosurgery, Afyonkarahisar Health Sciences University, Afyonkarahisar, Turkey
- 700 1_
- $a Korkmaz, S. $u Department of Neurosurgery, Afyonkarahisar Health Sciences University, Afyonkarahisar, Turkey
- 773 0_
- $w MED00010979 $t Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie $x 1210-7859 $g Roč. 84, č. 6 (2021), s. 541-546
- 856 41
- $u https://www.prolekare.cz/casopisy/ceska-slovenska-neurologie/2021-6-7/diferencialni-diagnostika-glioblastomu-a-solitarnich-metastaz-mozku-uspech-modelu-umele-inteligence-vytvorenych-na-zaklade-radiomickych-dat-ziskanych-automatickou-segmentaci-z-konvencnich-mr-sekvenci-129375 $y plný text volně dostupný
- 910 __
- $a ABA008 $b A 4085 $c 616 $y p $z 0
- 990 __
- $a 20220124 $b ABA008
- 991 __
- $a 20220218154202 $b ABA008
- 999 __
- $a ok $b bmc $g 1758577 $s 1156357
- BAS __
- $a 3
- BAS __
- $a PreBMC
- BMC __
- $a 2021 $b 84 $c 6 $d 541-546 $i 1210-7859 $m Česká a slovenská neurologie a neurochirurgie $x MED00010979 $y 129375
- LZP __
- $c NLK109 $d 20220218 $b NLK111 $a Meditorial-20220124