Mass spectrometry analyses of rat 2b myosin heavy chain isoform
Jazyk angličtina Země Česko Médium print
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
PubMed
17973598
DOI
10.33549/physiolres.931280
PII: 1280
Knihovny.cz E-zdroje
- MeSH
- chromatografie kapalinová MeSH
- databáze proteinů MeSH
- elektroforéza v polyakrylamidovém gelu MeSH
- hmotnostní spektrometrie s elektrosprejovou ionizací * MeSH
- konformace proteinů MeSH
- kosterní svaly chemie MeSH
- krysa rodu Rattus MeSH
- molekulární sekvence - údaje MeSH
- nesvalový myosin typu IIB chemie izolace a purifikace MeSH
- peptidové mapování MeSH
- sekvence aminokyselin MeSH
- spektrometrie hmotnostní - ionizace laserem za účasti matrice * MeSH
- tandemová hmotnostní spektrometrie * MeSH
- těžké řetězce myosinu chemie izolace a purifikace MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- krysa rodu Rattus MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Názvy látek
- nesvalový myosin typu IIB MeSH
- nonmuscle myosin type IIB heavy chain MeSH Prohlížeč
- těžké řetězce myosinu MeSH
We have separated 2b myosin heavy chain (MyHC) isoform from the rat extensor digitorum longus muscle by SDS-PAGE and analyzed it by two subsequent mass spectrometry techniques. After tryptic digestion, the obtained peptides were identified by Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionisation reflectron Time of Flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and sequenced by liquid chromatography tandem mass spectrometry (ESI LC/MS/MS). The analyzed peptides proportionally covered 30 % of the 2b MyHC isoform sequence. The results suggest that the primary structure is identical with the highest probability to a NCBI database record ref|NP_062198.1|, representing the last updated record of rat 2b isoform. Nonetheless, four peptides carrying amino acid substitution(s) in comparison with the NCBI database record were identified.
Citace poskytuje Crossref.org
