Prevalence study and phylogenetic analysis of group C porcine rotavirus in the Czech Republic revealed a high level of VP6 gene heterogeneity within porcine cluster I1
Jazyk angličtina Země Rakousko Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- MeSH
- antigeny virové genetika MeSH
- feces virologie MeSH
- fylogeneze MeSH
- genetická variace MeSH
- lidé MeSH
- nemoci prasat epidemiologie virologie MeSH
- prasata MeSH
- prevalence MeSH
- rotavirové infekce epidemiologie veterinární virologie MeSH
- Rotavirus klasifikace MeSH
- shluková analýza MeSH
- virové plášťové proteiny genetika MeSH
- zvířata MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- zvířata MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika epidemiologie MeSH
- Názvy látek
- antigeny virové MeSH
- virové plášťové proteiny MeSH
- VP6 protein, Rotavirus MeSH Prohlížeč
Group C rotavirus (RVC) has been described to be a causative agent of gastroenteritis in humans and animals. In the current study, the presence of porcine RVC was confirmed in 25.6 % of 293 porcine faecal samples collected from seven Czech farms. A significantly larger (p < 0.05) number of RVC-positive samples was detected in groups of finisher pigs and post-weaning piglets (4-12 weeks of age). Phylogenetic analysis of nine RVC-positive Czech strains and their comparison with available sequence data for the gene encoding RVC group antigen VP6 revealed two separate lineages within porcine cluster I1.
Citace poskytuje Crossref.org
