The complete mitogenome of Fusarium culmorum
Jazyk angličtina Země Anglie, Velká Británie Médium print-electronic
Typ dokumentu časopisecké články, práce podpořená grantem
- Klíčová slova
- Fungi, Fusarium culmorum, mitogenome,
- MeSH
- délka genomu MeSH
- Fusarium klasifikace genetika MeSH
- fylogeneze MeSH
- genom mitochondriální * MeSH
- mitochondriální geny MeSH
- otevřené čtecí rámce MeSH
- sekvenční analýza DNA MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- zastoupení bazí MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
The structure of the Fusarium culmorum mitogenome is similar to that of closely related Fusarium spp.: it has a total length of 103,844 bp, the base composition of the genome is the following: A (35.4%), T (32.9%), C (14.6%), and G (17.1%). The mitogenome contains 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA (rRNA), and 28 transfer RNA (tRNA) genes, all coded on the same strand of DNA. The gene order is identical to that of the other Fusarium and Hypocreales mitogenomes. Maximum likelihood and Bayesian analysis based on the concatenated amino acid dataset of mitochondrial protein-coding genes confirmed close genetic relationship of F. culmorum to the other type B trichothecene producers F. graminearum and F. gerlachii.
b CBS KNAW Fungal Biodiversity Centre Utrecht the Netherlands and
c Department of Biology and Ecology University of Ostrava Ostrava Czech Republic
Department of Botany and Nature Protection University of Warmia and Mazury in Olsztyn Olsztyn Poland
Citace poskytuje Crossref.org