The collet (root-hypocotyl junction) region is an important plant transition zone between soil and atmospheric environments. Despite its crucial importance for plant development, little is known about how this transition zone is specified. Here we document the involvement of the exocyst complex in this process. The exocyst, an octameric tethering complex, participates in secretion and membrane recycling and is central to numerous cellular and developmental processes, such as growth of root hairs, cell expansion, recycling of PIN auxin efflux carriers and many others. We show that dark-grown Arabidopsis mutants deficient in exocyst subunits can form a hair-bearing ectopic collet-like structure above the true collet, morphologically resembling the true collet but also retaining some characteristics of the hypocotyl. The penetrance of this phenotypic defect is significantly influenced by cultivation temperature and carbon source, and is related to a defect in auxin regulation. These observations provide new insights into the regulation of collet region formation and developmental plasticity of the hypocotyl.
Cíl práce: Kandidémie patří mezi poměrně časté infekční komplikace u kriticky nemocných pacientů. V posledním desetiletí se díky novým terapeutickým přístupům (zejména u některých skupin pacientů) mění spektrum kvasinek, které infekci způsobují. Předkládaná multicentrická studie si dala za úkol získat aktuální informace o epidemiologické situaci týkající se invazivních kandidóz (IC) v České republice. Materiál a metody: Do souboru byla zařazena data pacientů s kultivačně pozitivním nálezem kvasinky v krvi z 11 mikrobiologických pracovišť v České republice v rozmezí let 2012–2015. Byla hodnocena incidence, zastoupení jednotlivých kvasinkových druhů podle sledovaných let, podle věku a podle odborností. Dále byl posouzen vliv kolonizace a nakonec zda IC předcházela přítomnost toxigenního kmene Clostridium difficile ve stolici. U části izolovaných kmenů byly standardní metodikou stanoveny minimální inhibiční koncentrace (MIC) systémových antimykotik. Výsledky: V průběhu sledovaného období bylo v zúčastněných laboratořích zachyceno 921 kvasinkových kmenů od 886 pacientů. Celková incidence IC na 1 000 přijatých pacientů byla 0,40 (rozmezí 0,21–1,22 podle pracovišť). Takřka polovina izolátů spadala do druhu Candida albicans (49,7 %), následovaná Candida glabrata (15,3 %) a Candida parapsilosis (11,2 %). Na onkologických odděleních výrazně převažovaly non-albicans druhy (71,6 %), na rozdíl od chirurgických (40,4 %) nebo interních (52,0 %) oborů. Více než 70,0 % pacientů bylo v době pozitivní kultivace hospitalizováno na jednotkách intenzivní péče (JIP) a 65,0 % nemocných bylo kolonizováno stejným druhem kvasinky, který byl později nalezen v hemokultuře. Pouze u 5,1 % pacientů z celkového počtu byla potvrzena předchozí přítomnost toxigenního kmene C. difficile ve stolici. Celkem bylo otestováno 56 kmenů kvasinek (z 921) a byla zaznamenána zvýšená MIC u azolů pro C. glabrata. Závěr: Incidence kandidémií v České republice se ve sledovaném období výrazně neměnila a po C. albicans je druhou nejčastěji izolovanou kvasinkou v krvi C. glabrata.
Background: Candidemia is a severe and often life-threatening infection frequently occurring in critically ill patients. During the last decade, new therapeutic and prophylactic strategies influenced (at least in some patient subgroups) the epidemiological situation and the spectrum of causative Candida strains. The present multicentre study aimed to assess the current epidemiological situation of Candida strains causing invasive candidiasis (IC) in patients of tertiary care hospitals in the Czech Republic. Material and methods: Clinical and microbiological data on patients with bloodstream yeast isolates collected in 11 tertiary care hospitals in the Czech Republic between 2012 and 2015 were analysed. The incidence of cases and species distribution were assessed by study year, age, and specialty. Moreover, an association with the Candida colonization and presence of toxigenic strains of Clostridium difficile in stool prior to blood culture positivity was analysed. For some of the strains, minimum inhibitory concentrations (MICs) of systemic antifungals were determined using standard methods. Results: A total of 886 episodes of candidemia (921 yeast strains) were identified during the study period. The overall incidence per 1000 admissions was 0.40 (range 0.21–1.22 depending on the hospital). Almost half of the isolates belonged to the species Candida albicans (49.7 %), followed by Candida glabrata (15.3 %) and Candida parapsilosis (11.2 %). Non-albicans species of Candida significantly predominated in oncology wards (71.6 %) as compared to surgery (40.4 %) or internal medicine (52.0 %) departments. More than 70.0 % of patients stayed in intensive care units at the time of positive culture; in 65.0 % of patients, colonization with the same yeast species preceded blood culture positivity. In only 5.1 % of all patients, the previous presence of toxigenic strains of Clostridium difficile in stool was found. Fifty-six of the 921 yeast strains were tested for antifungal susceptibility, with an increase in MICs to azoles being observed for C. glabrata. Conclusion: The incidence of candidemia in the Czech Republic did not vary significantly between 2012 and 2015, and C. glabrata was the second most common yeast species after C. albicans isolated from blood.
- MeSH
- antifungální látky MeSH
- Candida klasifikace patogenita MeSH
- incidence MeSH
- infekce spojené se zdravotní péčí * MeSH
- kandidemie * diagnóza epidemiologie krev MeSH
- lidé MeSH
- mikrobiální testy citlivosti metody MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- multicentrická studie MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
RAB GTPases are important directional regulators of intracellular vesicle transport. Membrane localization of RAB GTPases is mediated by C-terminal double geranylgeranylation. This post-translational modification is catalyzed by the alpha-beta-heterodimer catalytic core of RAB geranylgeranyl transferase (RAB-GGT), which cooperates with the RAB escort protein (REP) that presents a nascent RAB. Here, we show that RAB-geranylgeranylation activity is significantly reduced in two homozygous mutants of the major Arabidopsis beta-subunit of RAB-GGT (AtRGTB1), resulting in unprenylated RAB GTPases accumulation in the cytoplasm. Both endocytosis and exocytosis are downregulated in rgtb1 homozygotes defective in shoot growth and morphogenesis. Root gravitropism is normal in rgtb1 roots, but is significantly compromised in shoots. Mutants are defective in etiolation and show constitutive photomorphogenic phenotypes that cannot be rescued by brassinosteroid treatment, similarly to the det3 mutant that is also defective in the secretory pathway. Transcriptomic analysis revealed an upregulation of specific RAB GTPases in etiolated wild-type plants. Taken together, these data suggest that the downregulation of the secretory pathway is interpreted as a photomorphogenic signal in Arabidopsis.
- MeSH
- Arabidopsis genetika růst a vývoj metabolismus MeSH
- gravitropismus MeSH
- prenylace MeSH
- proteiny huseníčku genetika metabolismus MeSH
- rekombinantní fúzní proteiny genetika metabolismus MeSH
- transferasy genetika metabolismus MeSH
- výhonky rostlin genetika růst a vývoj MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- práce podpořená grantem MeSH
