• MeSH
• hematologické testy MeSH
• imunofenotypizace * MeSH
• Publikační typ
• monografie MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství

Předmětem projektu je výzkum imunofenotypu buněk v cytologii moči odebrané od nemocných s uroteliálním karcinomem močového měchýře. Cytologie moči, jež je vyšetření morfologických změn buněk na mikroskopické úrovni, je v současné době jediným široce používaným neinvazivním markerem u pacientů s těmito nádory. Změny buněk na molekulární úrovni mohou být zodpovědné za změnu chování nádoru, tzn. za vznik recidiv a progresi nádoru. Tyto molekulární změny se projeví rozdílnou expresí proteinů v buňkách či na povrchu buněk. Studiem změn v imunofenotypu buněk v moči by tedy bylo možno získat markery, které zvýší výpovědní hodnotu cytologie. Tak bude umožněna neinvazivní diagnostika nádoru, jeho sledování, předpověď přechodu do invazivní formy a vzniku recidivy. Celkový benifit pro zdraví nemocného je zcela zjevný. Plánujeme prospektivní studii, ve které bude moč odebírána od pacientů vyšetřovaných, léčených a sledovaných na urologické klinice FNM 2. LF UK Praha. Cytologické zpracování s imunofenotypizací buněk bude probíhat v ústavu patologie a molekulární biologie FNM 2. LF UK Praha.; The object of the project is a research of urine immunocytologic profile in patients with bladder cancer. Urine cytology, studying morphological changes of the cells, represents the only non-invasive diagnostic marker in patients with this malignancy. Molecular changes in the cells might be responsible for the change in cell behavior, causing recurrence or progression of the cancer. These molecular changes would result in different protein expression inside the cells or on the cells. By research of the cell immunoprofile in cytology, there is a prospect to obtain markers enabling the increase of cytology`s diagnostic capacity in primary diagnosis and follow-up. Moreover, prediction of the progression and recurrence will be possible. Entirely positive efect on the health of our patients is evident. We are planning prospective trial. Urine will be sampled from the patients at the Department of Urology in University Hospital in Motol, Prague. Urine cytology and immunocytology will be performed at the Department of Pathology and Molecular Medicine in University Hospital in Motol, Prag...

• MeSH
• analýza moči MeSH
• cytodiagnostika MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• karcinom z přechodných buněk diagnóza   MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory močového měchýře diagnóza   MeSH
• prognóza MeSH
• terciární prevence MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• onkologie
• cytologie, klinická cytologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

U pacientů s imunodeficiencí vyšetřeným v regionálních centrech (Praha a Brno) zavedeme v mezinárodní spolupráci s EuroFlow-PID jednotnou a optimalizovanou metodiku vyšetření podrobného imunofenotypu lymfocytů metodou mnohobarevné průtokové cytometrie (8-12 parametrů). Projekt povede ke zlepšení diagnostiky a klasifikace imunodeficiencí, především u vzácných typů onemocnění. Povede také k objevení patofysiologických mechanismů a mechanismů jež modifikují klinický průběh onemocnění (u primárních i sekundárních imunodeficiencí). Projekt je koncipován jako multicentrický, což povede jednak k pokrytí většiny imunodeficientních pacientů v ČR, jednak k maximálnímu uplatnění výsledků v praxi. Spolupráce s ÚMG AV ČR umožní odhalení patofysiologických mechanismů na detailní molekulární úrovni.; In international cooperation with EuroFlow PID, we will introduce uniform and optimized methodology for a detailed immunophenotyping of lymphocytes using multicolor flow cytometry (8-12 parameters) in patients with immunodeficiency, which are examinated in regional centers in Prague and Brno. The project will lead to improved diagnostics and classification of immunodeficiencies, particularly the rare types of these diseases, as well as to revealing of patophysiological mechanisms and mechanisms that modify the clinical progress of the primary and secondary immunodeficiencies. The project is designed as multicentric to cover the majority of immunodeficient patients in the Czech Republic and to reach the maximal application of the results in practice. Cooperation with Institute of Molecular Genetics of Academy of Science of the Czech Republic will allow detection of patophysiological mechanisms on detailed molecular level.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• B-lymfocyty cytologie   MeSH
• běžná variabilní imunodeficience diagnóza   klasifikace   MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• T-lymfocyty cytologie   MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt je zaměřen na studium regulačních buněk u pacientů ve fázi prvního klinicky izolovaného syndromu (CIS) roztroušené sklerózy (RS), ještě před její definitivní diagnózou. Monitorace zastoupení různých typů regulačních buněk se zaměřením na CD8+ by měla pomoci k účelnému vedení terapie a optimálně zabránit dalšímu vývoji nemoci. V rámci projektu budou opakovaně vyšetřováni pacienti s CIS z RS centra VFN v laboratoři buněčné imunologie ÚIM 1.LF UK. První úkolem bude určit subpopulaci regulačních buněk, která bude odlišovat pacienty s CIS od pacientů s definitivní diagnózou RS (dle předběžných výsledků CD8+CD28-) a zdravých kontrol a která bude odrážet i eventuální vývoj nemoci. Následně pak bude výběr verifikován doplněním kontrolních souborů a hodnoty regulačních buněk budou korelovány s vývojem nemoci a jejím ovlivněním léčbou a možnou parazitární infekcí. Výsledky projektu budou publikovány v časopisech s impact faktorem s dedikací IGA a využity v klinické praxi při léčení nemocných s CIS.; The project aims to study regulatory cells in patients at the first stage of clinically isolated syndrome (CIS) of multiple sclerosis (MS). Regular assessment of the proportion of different types of regulatory cells, with the emphasis placed on CD8+ cells, should assist in efficient therapy guidance. The first challenge will be to define the subsets that would distinguish patients with CIS from patients with confirmed diagnosis of MS (on the basis of our preliminary results, these might be CD8+CD28-), and from healthy controls. Alterations in the subpopulation might also reflect the possible disease development. Subsequently, the results will be verified by further control groups. The number of regulatory cells will be correlated with the disease development, therapy effects and potential parasite infection. The obtained results will be published in a journal with an impact factor, with sponsor dedication, and used in clinical practice for the selection of therapeutic strategies in patients with CIS.

• MeSH
• adherence k farmakoterapii MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• interferon beta imunologie   terapeutické užití   MeSH
• Kaplanův-Meierův odhad MeSH
• lymfocyty cytologie   MeSH
• monocyty cytologie   MeSH
• prediktivní hodnota testů MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• ROC křivka MeSH
• roztroušená skleróza farmakoterapie   MeSH
• software MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• cytologie, klinická cytologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Biologické účinky látek manumycinového typu budou testovány pomocí modelu tkáňových kultivací s lidskými liniemi monocytů/makrofágů (THP-1) a epiteliálních linií. Pro screening potenciálního efektu testovaných látek na tvorbu prozánětlivých cytokinů a chemokinů bude využita multiplexová kvantitativní RT-PCR s následným měřením koncentrací cytokinů, imunofenotypizací a funkčními testy. Kmeny streptomycet produkující manumycinové látky budou identifikovány pomocí genového screeningu, bude provedena izolace a charakterizace nových látek, konstrukce kosmidových knihoven a genetická manipulace horního polyketidového řetězce manumycinů (délka, štěpení, saturace) včetně genového "shufflingu" mezi producenty.; Biological effects of manumycin-related compounds will be tested using a tissue culture models with human monocyte/macrophages (THP-1) and epithelial cell lines. For a screening of potential effect of tested compounds on pro-inflammatory cytokines and chemokines production, multiplex qRT-PCR will be used followed by measurement of proinflammatory cytokine concentrations, immunophenotypying and functional tests. Genetic screening will be used for identification of streptomycete strains producing manumycine-related compounds with consequent isolation and characterization of new compounds, construction of cosmid libraries, and genetic manipulations with the upper polyketide chain of manumycins (length, branching, saturation) including gene shuffling between producers.

• MeSH
• azithromycin MeSH
• cytokiny MeSH
• epitelové buňky MeSH
• genetické techniky MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• imunomodulace MeSH
• klarithromycin MeSH
• kosmidy MeSH
• makrofágy MeSH
• polymerázová řetězová reakce s reverzní transkripcí MeSH
• Streptomyces MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• biologie
• farmacie a farmakologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt se zabývá začleněním polychromatické průtokové cytometrie a nových molekulárních metod do diagnostického algoritmu nejčastějších hematologických příčin selhání kostní dřeně v dětském věku. Prospektivním sledováním a detailní analýzou pacientů s myelodysplastickým syndromem a aplastickou anémií chceme nalézt charakteristické znaky, které do budoucna přispějí ke klasifikaci obou onemocnění a k rozlišení od reaktivních stavů. Využití výše uvedených technik povede k získání nových informací o imunopatologii a patogenezi nemoci.; The project deals with implementation of polychromatic flow cytometry and new molecular methods in diagnostic algorithm for most common hematological causes of bone marrow failure in childhood. By prospective follow-up and detailed analysis of patients with myelodysplastic syndrome and aplastic anemia we will define characteristic factors, which will contribute to classification of both diseases and distinguishing from reactive states in the future. The use of above listed techniques will lead to new information about immunopathology and pathogenesis of the diseases.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• aplastická anemie diagnóza   MeSH
• diagnostické techniky molekulární MeSH
• dítě MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• myelodysplastické syndromy diagnóza   MeSH
• pancytopenie diagnóza   MeSH
• proteiny WT1 MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• vzácné nemoci diagnóza   MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• pediatrie
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• vzácné nemoci
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt si klade za cíl zavést 8-mi barevnou standardizovanou cytometrickou diagnostiku hematologických malignit v návaznosti na evropský projekt Euroflow. Jednotně provedená diagnostika navíc umožní komputační zpracování dat a hledání prognostických vztahů v multicentrických souborech. Důležitou součástí projektu je vývoj jednotného postupu detekce odpovědi na léčbu (stanovení minimální reziduální nemoci), a zavedení metodiky externí kontroly kvality stanovení. Projekt je navržen jako projekt multicentrický se zastoupením 4 významných diagnostických center tak, aby bylo zajištěno dostatečné zastoupení všech klinických skupin hematologických malignit.; We expect end up with standardized 8-color flow cytometry for diagnosing and disease monitoring of various hematological malignancies as currently is within the Euroflow project under the development. Uniformly performed diagnostics across the centers inCzechia will enable searching new prognostic correlations and computer assisted diagnostic evaluation. Important part of the project is the development of minimal residual disease detection on common basis which will also enable inter-laboratory standardization and quality data control. Four centers focused on different patients group agreed in participation in the project and all disease categories are covered within these center.

• MeSH
• hematologické nádory diagnóza   prevence a kontrola   MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• metody pro podporu rozhodování MeSH
• plošný screening MeSH
• průtoková cytometrie metody   normy   přístrojové vybavení   trendy   MeSH
• referenční standardy MeSH
• reziduální nádor MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

V tomto projektu bude ve 40 vzorcích biopsií štěpů od pacientů po Tx ledviny stanoven celogenomový expresní profil pomocí microarray techniky. Biopsie budou vybrány na základě histopatologického nálezu a stavu funkce štěpu v 1. a 2.roce a po transplantaci (9 s normálním nálezem a zhoršenou fcí + 9 s normálním nálezem a stabilní fcí, 6 s nálezem hraničních změn a zhoršenou fcí + 6 s nálezem hraničních změn a stabilní fcí v protokolární biopsii a 5 s nálezem hraničních změn a zhoršenou fcí + 5 s nálezem hraničních změn a stabilní fcí v časné biopsii do třetího měsíce po Tx). Na základě vyhodnocení dat z microarray bude vybrán set genů pro jednotlivé skupinu determinující. Schopnost predikce osudu transplantované ledviny pomocí námi vybraného setu genů bude ověřena pomocí metody RT-qPCR na ?validační skupině? 80 biopsií štěpů rozděleném ve stejném poměru jako skupiny pro analýzu pomocí microarray techniky.; In this project, the genome-wide expression will be assessed by microarray technology in 40 biopsy specimens from kidney Tx recipients. The biopsy specimens will be selected based on the histopathological finding and graft function status at 1 and 2 years post-Tx (9 normal finding and deteriorated function (DF) + 9 normal finding and stable function (SF), 6 borderline changes and SF + 6 borderline changes and DF in protocol biopsy, and 5 borderline changes and SF + 5 borderline changes and DF in early biopsy within 3 months post-transplant). Based on microarray data analysis, a set of genes identifying individual groups will be selected. Using RT-qPCR, this set of genes will be tested, in a ?validation group? of 80 graft biopsy specimens divided at a ratio identical to that used for microarray analysis, for its ability to predict the fate of the kidney transplant.

• MeSH
• genetické markery MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• rejekce štěpu MeSH
• transplantace ledvin MeSH

• Konspekt
• Experimentální medicína
• NLK Obory
• transplantologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Průtoková cytometrie je významnou diagnostickou metodou v hematonkologii. Navrhovaný projekt má za cíl imunologicky charakterizovat nádorové buňky a složení nemaligních subpopulací u lymfomů dětského věku a porovnat nálezy s patologickou diagnostikou. Vyšetřovat budeme jak vlastní nádorovou tkáň, tak i periferní krev a kostní dřeň. Součástí diagnostického algoritmu bude rovněž zhodnocení imunitního stavu pacienta s cílem odhalit případný imunodeficit. Tímto projektem přispějeme ke zkvalitnění diagnostiky a zefektivnění léčby maligních lymfomů u dětí.; Flow cytometry is an important and fast method in diagnostic process of hematological malignancies. We will analyze by flow cytometry tumor cells and composition of non malignant background in children with lymphomas. The findings will be correlated withpathological investigation. Tumor tissue, bone marrow and peripheral blood will be analyzed by polychromatic flow cytometry. In all patients we will evaluate immune status at diagnosis with primary aim to exclude underlying immunodeficiency.

• MeSH
• diferenciální diagnóza MeSH
• dítě MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• lymfom diagnóza   MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• Check Tag
• dítě MeSH

• Konspekt
• Pediatrie
• NLK Obory
• pediatrie
• hematologie a transfuzní lékařství
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Projekt je zaměřen na vyšetření několika aspektů selektivního deficitu IgA(IgAD). Bude sledován výskyt mutací genu TACI u osob s IgAD a v běžné populaci. Ačkoliv jsou mutace TACI častější u osob s geneticky příbuzným běžným variabilním imunodeficitem, zatím jediná rozsáhlá studie provedená na ne-slovanské populaci asociaci s IgAD nepotvrdila. Dále budeme sledovat lymfocytární subpopulace, jejichž počet byl zvýšen v našich předchozích studiích. Bude se jednat zejména o subpopulaci CD4+CD25+. Může se jednat o buňky aktivované, ale i Treg lymfocyty, ty budeme detekovat pomocí kombinace znaků CD4,CD25,CD127. Bude zkoumána i subpopulace B-lymfocytů CD21-CD38-, jejíž procentuální zastoupení bylo u nemocných s IgAD zvýšeno. Soustředíme se na fenotypovou charakteristiku těchto buněk a závislost na přítomnosti autoimunitních fenoménů. Lymfocytární abnormality budou korelovány s hladinou endotoxinémie ke zjištění, zda-li zvýšená resorpce endotoxinu nevysvětluje zmíněné abnormality aktivací imunitního systému.; The project is focused on selective IgA deficiency (IgAD). The frequency of TACI mutations will be determined in IgAD patients and in a healthy Czech population. Although the TACI mutations were shown to be increased in patients with genetically relatedCVID, the only study published yet did not find any increase in TACI mutation in IgAD patients. The lymphocyte subpopulations which were shown to be abnormal in IgAD patients in our previous studies will also be studied. These will include CD4+CD25+ cells, which can both be activated such as regulatory (Treg) lymphocytes. The number of Treg cells will be determined by a combination of CD4,CD25,CD127 antigens. CD21-CD38- B-cells will also be studied by immunophenotype analysis and correlated with autoimmune phenomena in IgAD patients. Lymphocyte subpopulations will also be correlated with the serum endotoxin level to elucidate whether increased endotoxin resorption may explain the above-mentioned abnormalities by activation of the immune system.

• MeSH
• běžná variabilní imunodeficience MeSH
• deficience IgA MeSH
• endotoxiny analýza   MeSH
• imunofenotypizace MeSH
• mutace MeSH
• podskupiny B-lymfocytů MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• průtoková cytometrie MeSH
• T-lymfocyty - podskupiny MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• alergologie a imunologie
• biologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR