V tomto projektu bude ve 40 vzorcích biopsií štěpů od pacientů po Tx ledviny stanoven celogenomový expresní profil pomocí microarray techniky. Biopsie budou vybrány na základě histopatologického nálezu a stavu funkce štěpu v 1. a 2.roce a po transplantaci (9 s normálním nálezem a zhoršenou fcí + 9 s normálním nálezem a stabilní fcí, 6 s nálezem hraničních změn a zhoršenou fcí + 6 s nálezem hraničních změn a stabilní fcí v protokolární biopsii a 5 s nálezem hraničních změn a zhoršenou fcí + 5 s nálezem hraničních změn a stabilní fcí v časné biopsii do třetího měsíce po Tx). Na základě vyhodnocení dat z microarray bude vybrán set genů pro jednotlivé skupinu determinující. Schopnost predikce osudu transplantované ledviny pomocí námi vybraného setu genů bude ověřena pomocí metody RT-qPCR na ?validační skupině? 80 biopsií štěpů rozděleném ve stejném poměru jako skupiny pro analýzu pomocí microarray techniky.; In this project, the genome-wide expression will be assessed by microarray technology in 40 biopsy specimens from kidney Tx recipients. The biopsy specimens will be selected based on the histopathological finding and graft function status at 1 and 2 years post-Tx (9 normal finding and deteriorated function (DF) + 9 normal finding and stable function (SF), 6 borderline changes and SF + 6 borderline changes and DF in protocol biopsy, and 5 borderline changes and SF + 5 borderline changes and DF in early biopsy within 3 months post-transplant). Based on microarray data analysis, a set of genes identifying individual groups will be selected. Using RT-qPCR, this set of genes will be tested, in a ?validation group? of 80 graft biopsy specimens divided at a ratio identical to that used for microarray analysis, for its ability to predict the fate of the kidney transplant.

Doba řešení: 2010-2014

Obsahuje literaturu