Nedávné technologické pokroky biomedicínského výzkumu umožnily zkoumat základní biologické procesy v živých organismech při různých rozlišeních a z různých úhlů pohledu. Zatímco množství produkovaných dat v průběhu let dramaticky roste, tempo našich získávaných znalostí spíše zaostává, což ukazuje na neschopnost současných výpočetních nástrojů umožnit extrakci znalostí z velkého množství zašuměných dat. NEUROMINER poskytne rámec pro strojové učení a dolování z obrazových dat se zvláštním důrazem na neurovědní výzkum. Tři hlavní osy projektu odpovídají problémům, pro které v současné době není známo řešení: (1) extrakce a selekce příznaků se silnou diskriminačních schopností z mnohorozměrných dat, (2) nepřeučené systémy učící se z mnohorozměrných dat (3) rigorózní postup pro statistické validace modelů. Navrhovatelé projektu jsou experty ve zpracování analýze medicínských obrazů, biostatistice a strojovém učení.; The recent technological advances enabled the biomedical research to explore the underlying biological processes of the living organisms at various resolutions and from different perspectives. While the amount of produced data grew dramatically over the years, the pace at which our knowledge lagged behind - an indication of inability of the current computational tools to extract knowledge from the large pool of noisy data. NEUROMINER will provide a framework for machine learning and data mining, with a special emphasis on neuroscience research. The project has three main axes of research, each corresponding to a currently unmet need: (1) extraction and selection of features with strong discrimination properties, (2) systems able to learn from high-dimensional data and not suffering from overfitting problems, and (3) rigorous statistical model assessment procedure. The applicants are experts in medical image processing and analysis, biostatistics and machine learning.

• MeSH
• biostatistika MeSH
• data mining MeSH
• mozek diagnostické zobrazování   MeSH
• neuronové sítě MeSH
• neurozobrazování MeSH
• počítačové zpracování obrazu MeSH
• reprodukovatelnost výsledků MeSH
• schizofrenie diagnostické zobrazování   MeSH
• strojové učení MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• lékařská informatika
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR

Předkládaný projekt navrhuje vytvořit software využitelný v klinické praxi při počítačové diagnostice neuropsychiatrických poruch z obrazů mozku pořízených magnetickou rezonancí (MR). Projekt vychází ze zkušeností s pokročilou analýzou MR obrazů včetně hodnocení morfologie mozku pacientů s první epizodou schizofrenie. Autorizovaný software - hlavní předmět předkládaného projektu - bude spojovat metody zpracování a analýzy obrazů mozku s pokročilými algoritmy strojového učení pro predikci, klasifikaci a rozpoznávání. Vznikne tak nový prostředek pro analýzu obrazových dat, který přiblíží zobrazovací metody klinické praxi v psychiatrii, umožní objektivní diagnostiku, která je v současné praxi založena na subjektivním hodnocení klinicky patrných změn psychických funkcí a chování. Metodika řešení projektu zahrnuje jednak vývoj metod zaměřených na popis obrazů s důrazem na využití automatických morfometrických metod a dále vývoj klasifikátorů využívajících příznakového popisu z různých datových zdrojů.; The project proposes to develop software usable in clinical practice for computer aided diagnosis of neuropsychiatric disorders from MR images of brain. It is based on experience with advanced analysis of MR images, including assessment of brain morphology in the first episode of schizophrenia. Authorized software - the main subject of the proposed project - will combine methods for image processing and analysis with advanced machine learning algorithms for prediction, classification and recognition. This will provide a new tool for analyzing image data, which will bring medical imaging closer to the clinical psychiatry by making diagnosis objective, which is in the current practice based on subjective evaluation of clinically evident changes in mental function and behavior. The methodology includes the development of algorithms aimed at the description of the images with the use of automated morphometry as well as the development of classifiers using features extracted from various data sources.

• MeSH
• algoritmy MeSH
• magnetická rezonanční tomografie MeSH
• morfologické a mikroskopické nálezy MeSH
• mozek MeSH
• multimodální zobrazování MeSH
• neuroanatomie MeSH
• neuropsychiatrie MeSH
• neurovědy MeSH
• pozorovací studie jako téma MeSH
• rozpoznávání automatizované MeSH
• schizofrenie diagnóza   MeSH
• strojové učení MeSH
• zobrazování trojrozměrné MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• neurovědy
• psychiatrie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• informační systémy MeSH
• kontinuální vzdělávání lékařů MeSH
• lékařská počítačová informatika MeSH
• studium lékařství MeSH
• využití lékařské informatiky MeSH
• Publikační typ
• příručky MeSH

• Konspekt
• Vysoké školy
• NLK Obory
• pedagogika
• lékařská informatika

Předkládaný projekt navrhuje vytvořit autorizovaný software využitelný v klinické praxi při počítačové diagnostice neuropsychiatrických poruch z MRI obrazů mozku. Návrh projektu vychází ze zkušeností s existujícími softwarovými balíky, které jsou v současné době využívány v neurozobrazovací komunitě a dále z vlastní metodiky pro hodnocení morfologie mozku při první epizodě schizofrenie. Plánovaný software, který je hlavním předmětem předkládaného projektu, v sobě bude spojovat komplexní metody zpracování a analýzy 3-D MRI obrazů mozku s následným hodnotícím aparátem založeným na metodách rozpoznávání a strojového učení. Vznikne tak nový prostředek pro automatickou analýzu obrazových dat v oblasti výpočetní neuroanatomie, který na rozdíl od existujícíchmetod VBM (voxel-based morphometry) a DBM (deformation-based morphometry) umožní vedle konvenčního srovnávání souborů pacientů a zdravých kontrol také nový typ klasifikačního hodnocení, a to i v případě individuálního analyzovaného subjektu.; The presented project suggests creation of authorized software utilizable in the clinical practice for computer-aided diagnostics of neuropsychiatric disorders from MRI brain images. The project proposal comes from the experience with existing software packages which are nowadays utilized in the neuroimaging community and also from our original methodology for brain morphology assessment in first episode schizophrenia. The software, which is the main subject of the proposed project, will connect complexmethods for 3-D MRI brain image processing and analysis with an advanced assessing apparatus based on pattern recognition and machine learning methods. A new tool for automated analysis of image data will be developed for the application field of computational neuroanatomy. Besides common comparisons among groups of patients and normal subjects, it will make it possible to set a new type of classification assessment , even in the case of an individual analyzed subject, in contrast to VBM and DBM.

• MeSH
• magnetická rezonanční tomografie metody   využití   MeSH
• neuroanatomie MeSH
• neuropsychiatrie klasifikace   MeSH
• počítačové zpracování obrazu MeSH
• rozpoznávání automatizované MeSH
• subtrakční technika MeSH
• validace softwaru MeSH
• zobrazování trojrozměrné MeSH

• Konspekt
• Patologie. Klinická medicína
• NLK Obory
• neurologie
• psychiatrie
• radiologie, nukleární medicína a zobrazovací metody
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

Predikce dlouhodobého průběhu nemoci po první epizodě schizofrenie pomocí morfologie mozku.; Prediction of the long-term outcome of schizophrenia after the first episode using the features of brain morphology.

• MeSH
• kvalita života MeSH
• mozek anatomie a histologie   MeSH
• předpověď MeSH
• schizofrenie MeSH
• zkreslení výsledků (epidemiologie) MeSH
• zobrazování trojrozměrné MeSH

• Konspekt
• Psychiatrie
• NLK Obory
• neurologie
• psychiatrie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

• MeSH
• akademický sbor lékařské fakulty MeSH
• lékařská informatika MeSH
• mezinárodní spolupráce MeSH
• muskuloskeletální systém MeSH
• počítačem řízená výuka MeSH
• studenti lékařství MeSH
• výchova a vzdělávání MeSH
• Publikační typ
• abstrakt z konference MeSH

• Konspekt
• Výchova a vzdělávání
• NLK Obory
• pedagogika
• lékařská informatika

Pracovní setkání a prezentace jednotlivých účastníků konference, pořádané 11. listopadu 2005 Lékařskou fakultou MU v Brně. Neprodejné.

• MeSH
• informační věda MeSH
• informatika MeSH
• počítačem řízená výuka MeSH
• studium lékařství MeSH
• telemedicína MeSH
• Publikační typ
• učebnice MeSH

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• Učební osnovy. Vyučovací předměty. Učebnice
• NLK Obory
• lékařská informatika
• pedagogika
• lékařství

• Konspekt
• Lékařské vědy. Lékařství
• NLK Obory
• lékařská informatika
• farmacie a farmakologie