Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
nestr.
Plasmocelulární leukemie (PCL) je nejagresivnější formou monoklonálních gamapatií. Je to raritní onemocnění, s incidencí v Evropě jen zhruba 0,04 případů na 100 000 obyvatel za rok. Diagnostická kritéria PCL jsou založena na více než 20 % cirkulujících plazmatických buňkách v periferní krvi a jejich absolutním počtem vyšším než 2x109/l. Tyto hodnoty byly však nastaveny v roce 1974 a kvůli malému množství pacientů nebyly nikdy řádně validovány a mohou podhodnocovat opravdový počet pacientů s PCL. Je tedy možné, že nižší hladina plasmocytózy je dostatečná pro definici této choroby. Zároveň, nekódující molekuly RNA přímo regulují expresi genů, které mohou ovlivnit migraci plazmatických buněk z kostní dřeně do periferní krve. Tento grant se zaměří na redefinování diagnostických kritérií PCL na základě flowcytometrické analýzy cirkulujících plazmatických buněk, změn jejich hladin v závislosti na léčbě a na analýzu nekódujících molekul RNA.; Plasma cell leukemia (PCL) is the most aggressive form of monoclonal gammopathies. It is a rare disease with incidence in Europe of only 0.04 cases per 100 000 people per year. The PCL diagnostic criteria are based on more than 20% of plasma cells in peripheral blood and their absolute count greater than 2x109/L. However, these values were set in 1974; due to very small number of patients, they were not properly validated and may underestimate the real number of PCL patients. Thus, it is possible that lower degree of peripheral plasmocytosis is sufficient to define the disease. At the same time, the so-called non-coding RNA molecules directly regulate expression of genes; thus, the effect of these molecules on changes that allow cPC to migrate out of the bone marrow will be analyzed. This grant aims to redefine diagnostics criteria of PCL based on flowcytometric analysis of circulating plasma cells, changes in their amounts in connection to treatment and on analysis of non-coding RNA molecules.
- MeSH
- exprese genu MeSH
- nekódující RNA MeSH
- plazmocelulární leukemie diagnóza MeSH
- průtoková cytometrie MeSH
- tekutá biopsie MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- hematologie a transfuzní lékařství
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
nestr.
Dlouhé nekódující RNA (lncRNA) regulují diferenciaci krevních buněk na mnoha úrovních a jejich abnormální exprese tak přispívá k různým hematopoetickým onemocněním. LncRNA se mohou ukázat jako významné diagnostické a prognostické markery přispívajícími k včasné detekci progrese MDS a zlepšení přežití pacientů, či se mohou v budoucnu stát potenciálními terapeutickými cíli. V navrhovaném projektu budou prováděna celogenomová vyšetření hladin lncRNAs u pacientů s MDS a srovnání expresních profilů mezi různými skupinami pacientů s cílem najít lncRNAs s výrazně odlišnými hladinami a potenciálním využitím v diagnostice MDS. Protože znalosti o jednotlivých lncRNA jsou často limitovány na pouhou anotaci transkriptu, budou v rámci projektu dále studovány příčiny, role a důsledky deregulovaných lncRNA pro patogenezi MDS pomocí experimentálních a výpočetních přístupů.; Long non-coding RNAs (lncRNAs) regulate hematopoietic lineage differentiation at almost every stage and their abnormal expression may contribute to various hematopoietic disorders. They may become useful diagnostic and prognostic markers contributing to detection of the MDS progression and increase of the patients' survival, and even potential therapeutic targets in future. In the proposed project, genome-wide screening of lncRNA levels in MDS patients will be employed to compare expression profiles between various risk groups of patients with the aim to find lncRNAs with significantly different levels and relevance to MDS diagnostics. Because the knowledge about individual lncRNAs is often limited to the simple transcript annotation, the causes, roles and consequences of deregulated lncRNAs in the pathogenesis of MDS will be studied by experimental and computational approaches.
- MeSH
- exprese genu MeSH
- myelodysplastické syndromy diagnóza genetika MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- RNA dlouhá nekódující genetika škodlivé účinky MeSH
- sekvenování celého genomu MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- hematologie a transfuzní lékařství
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Diamondova-Blackfanova anémie (DBA) je vzácná vrozená aplázie erytropoézy manifestující se v 90% případů v prvním roce života. DBA je prvním onemocněním u člověka způsobeným mutacemi ribozomálních proteinů (RP). Přes intenzivní výzkum zůstává stále mnoho nevyřešených otázek týkajících se patofyziologie ribozomální dysfunkce. V rámci projektu je plánována analýza 1) molekulární patogeneze, genové exprese a abnormalit jadérek u DBA pacientů; 2) eryptózy, feroptózy, oxidačního stresu, metabolizmu erytrocytů a účinku antioxidantů na erytroidní diferenciaci a zralé erytrocyty. V souvislostech s nálezy u pacientů bude analyzována 3) eryptóza, oxidační stres a metabolizmus železa u DBA myšího modelu a současně efekt látek stimulujících erytropoézu. Cílem projektu je nalezení nových diagnostických markerů ke zpřesnění diagnostiky DBA a nových léčebných přístupů, protože současná standardní léčba zahrnující pouze steroidy, podávání transfuzí a transplantaci kostní dřeně je spojena s výraznými nežádoucími účinky včetně přetížení železem.; Diamond-Blackfan anemia (DBA) is a rare inherited erythroid aplasia diagnosed in early infancy in 90% of cases and the first human disease caused by mutations in ribosomal proteins (RP). Despite intensive research, there are still many unresolved issues concerning the pathophysiology of ribosomal dysfunction. We plan to evaluate 1) molecular pathogenesis, gene expression profiling and nucleolar disruption in DBA patients 2) eryptosis, ferroptosis, anti-oxidative defense, metabolism of red blood cells (RBC) and the effect of antioxidants on the erythroid differentiation program and mature RBC of DBA patients. In connection to patients' we will analyze 3) eryptosis, oxidative defense and iron metabolism in RPS19-deficient mice as well as the effect of erythropoiesis stimulating agents. We aim to find new diagnostic markers for more precise diagnosis of DBA and new effective treatment modalities as the current standard treatment approaches are limited and include only steroids, transfusions and bone marrow transplantation, all of which have serious side-effects including iron overload.
- MeSH
- biologické markery MeSH
- Diamondova-Blackfanova anemie genetika MeSH
- erytrocyty metabolismus MeSH
- exprese genu MeSH
- lidé MeSH
- modely nemocí na zvířatech MeSH
- myši MeSH
- oxidační stres MeSH
- ribozomy patologie MeSH
- stanovení celkové genové exprese MeSH
- železo MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- myši MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- hematologie a transfuzní lékařství
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Komplexní patologické změny při chronické bakteriální infekci spolu s antibiotickou terapií představují stres, který selektuje adaptovanou bakteriální populaci na účinek antibiotik. Staphylococcus aureus je modelovým příkladem mimořádně úspěšného patogena, jehož neobvyklými strategiemi tolerance a alternativní rezistence k antibiotikům (perzistence, mutace cílového místa pro antibiotika a hypermutabilita) při chronické infekci se bude navrhovaný projekt prioritně zabývat. V rámci projektu bude pomocí fenotypových, genotypových a transkriptomických metod analyzován soubor vybraných časných a pozdních izolátů S. aureus od kohorty pacientů s cystickou fibrózou a porovnán s kontrolními kmeny z akutní infekce novorozenců a referenčními stafylokokových kmenů (n=100). Průkaz molekulárních mechanismů adaptací povede k lepšímu pochopení tohoto fenoménu a může vést k optimalizaci léčby konkrétních pacientů Pražského centra pro cystickou fibrózu.; Complex structural changes in the affected tissues develop during the course of chronic bacterial infection and along with antibiotic therapy act as strong stressors exerting a severe selective pressure and resulting in adapted bacterial population tolerant to antibiotics. Staphylococcus aureus is an extraordinarily successful opportunistic pathogen whose survival adaptation strategies like tolerance and alternative resistance to antibiotics (persistence, target site mutation, hypermutability) will be the main object of the Project. Therefore, a collection of early and subsequent late S. aureus isolates cultured from respiratory samples of chronically infected cystic fibrosis patients cohort will be analyzed using phenotypic, genotypic and transcriptomic methods and compared with the controls - S. aureus strains from newborn acute infections, and control reference strains (n=100). Determination of these molecular adaptation mechanisms may lead to improve understanding of the phenomena and optimization of antibiotic therapy for individual patients of Prague Cystic Fibrosis Centre.
- MeSH
- bakteriální léková rezistence MeSH
- bakteriologické techniky metody MeSH
- diagnostické techniky molekulární metody MeSH
- fenotyp MeSH
- genotyp MeSH
- lidé MeSH
- mutace MeSH
- perzistentní infekce mikrobiologie MeSH
- stafylokokové infekce mikrobiologie MeSH
- Staphylococcus aureus izolace a purifikace MeSH
- tolerance léku MeSH
- transkriptom MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- infekční lékařství
- molekulární biologie, molekulární medicína
- farmacie a farmakologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
HNF-1B je transkripční faktor, který hraje klíčovou roli při ontogenezi a reguluje expresi četných genů podílejících se na modulaci buněčného cyklu. Epigenetické změny a mutace HNF-1B (TCF2) se podílí na vzniku některých nádorů a na imunohistochemické úrovni se tyto změny mohou projevit ztrátou nebo zvýšenou expresí proteinu HNF-1ß. Protein se vyskytuje ve více izoformách, jejichž počet a přesná charakterizace však v současné době nejsou přesně známé. Celogenomové asociační studie prokázaly souvislost některých jednonukleotidových polymorfismů se zvýšenou či naopak sníženou incidencí některých solidních nádorů, jako jsou například karcinomy prostaty a endometria. Celkové znalosti týkající se epigenetických a zejména genetických změn HNF1B a jejich vztahu k nádorovým onemocněním jsou však velmi limitované. V naší práci chceme navázat na náš předchozí projekt zabývající se problematikou HNF1B u nádorů ženského genitálu a rozšířit analýzu na další typy solidních epitelových nádorů této a jiných oblastí, u kterých lze účast HNF1B v procesu karcinogeneze očekávat.; HNF1B is a transcription factor which plays a key role in ontogenesis and regulates the expression of numerous genes involved in cell cycle modulation. Epigenetic changes and mutations of HNF1B (TCF2) are involved in the tumorigenesis of certain tumors. Immuno-histochemically, these changes can be associated with the loss or overexpression of the HNF1B protein. The protein exists in several isoforms, whose number and precise characterization are presently not exactly known. Genome-wide association studies have found an association of certain single nucleotide polymorphisms with an increased or conversely decreased incidence of certain solid tumors, such as carcinomas of the prostate and endometrium. However, overall knowledge of the epigenetic and genetic changes of HNF1B and their relation to neoplasms is very limited. In our work we want to build on our previous project focused on the problematics of HNF-1B in female genital tract tumors, and extend the analysis to other types of solid tumors of this and other areas, in which HNF1B involvement in carcinogenesis can be expected.
- MeSH
- epigeneze genetická MeSH
- exprese genu MeSH
- hepatocytární jaderný faktor 1-beta genetika MeSH
- imunohistochemie metody MeSH
- lidé MeSH
- nádory genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- onkologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Během posledního desetiletí byla objasněna zásadní role mikroRNA (malé RNA s 20-22 nukleotidy) jako perspektivních biomarkerů a/nebo kauzálních faktorů kardiovaskulárních onemocnění. MikroRNA regulují posttranskripční expresi genů, a tím významně zasahují do metabolismu cholesterolu, funkce endoteliálních buněk, hladkých svalových buněk a makrofágů. Tím se podílejí na regulaci vzniku a progrese aterosklerózy. Na základě výsledků našich pilotních studií je záměrem předkládaného projektu analyzovat (i) vybrané cirkulující mikroRNA, které se podílejí na regulaci exprese genů, (ii) jejich cílových proteinů/klinických parametrů a (iii) genetické polymorfismy ve vztahu k ateroskleróze u pacientů se závažnou hypercholesterolémií, léčených lipoproteinovou aferézou. Předpokládáme, že robustní změny v homeostáze lipidů, navozené lipoproteinovou aferézou, umožní dále objasnit úlohu vybraných cirkulujících mikroRNA, účastnících se řízení exprese genů a tvorby cílových proteinů v procesu aterogeneze.; Over past decade, the crucial role of microRNAs (small RNA molecules of 20-22 nucleotides) as perspective biomarkers, main players of the cardiovascular disease or both, has become widely recognized. By controlling the post-transcriptional gene expression, several miRNAs have been shown to modulate the cholesterol metabolism, function of endothelial cells, vascular smooth muscle cells, and macrophages, thereby regulating the development and progression of atherosclerosis. Based on our pilot studies we intend to analyze (i) selected circulating microRNAs mostly involved in regulation of genes, (ii) their target proteins/clinical parameters and (iii) genetic polymorphisms related to atherosclerosis in patients with severe hypercholesterolemia under lipoprotein apheresis treatment. We expect that robust changes of lipid homeostasis, induced by lipoprotein apheresis, might bring further insights into the role of selected circulating microRNAs mostly involved in regulation of genes and their target proteins related to the crucial atherogenic mechanisms.
- MeSH
- ateroskleróza etiologie komplikace MeSH
- biologické markery analýza MeSH
- exprese genu MeSH
- hyperlipoproteinemie typ II diagnóza farmakoterapie MeSH
- lidé MeSH
- lipoproteiny LDL terapeutické užití MeSH
- mikro RNA analýza škodlivé účinky MeSH
- polymorfismus genetický MeSH
- separace krevních složek MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- genetika, lékařská genetika
- vnitřní lékařství
- kardiologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Přestože se spektrum biomarkerů užívaných v onkologii neustále rozšiřuje, zůstává stanovení morfologie nádorů rozhodujícím kritériem diagnostiky. U karcinomů prsu bylo nedávno zjištěno, že stupeň diferenciace je provázen změnami exprese miRNA. Není však nic známo o tom, zda popsané změny souvisí se změnou morfologie a zda mají individuální nebo obecný charakter. Cílem navrhovaného projektu je použít zatím unikátní přístup a srovnat expresní profil miRNA z různých částí téhož nádoru s rozdílnou morfologickou charakteristikou i nádorů se stejnou morfologií od různých pacientek a zároveň zjistit, zda je možné tyto specifické miRNA detekovat v krvi. Pro řešení navrhujeme použít mikrodisekční metody izolace buněk z parafínových bloků TNBC a mikročipovou analýzu miRNA. Tkáňové a sérové hladiny vybraných miRNA budou sledovány pomocí qPCR v rozšířeném validačním souboru a jejich funkce bude studována pomocí experimentů na buněčných liniích. Projekt by mohl přispět k odhalení nových principů řídících morfogenezi v nádorech a rovněž k identifikaci nových diagnostických a prognostických znaků.; Although the spectrum of cancer biomarkers is constantly expanding, determining the morphology is a decisive criterion for diagnosis. Recent research in breast cancer has shown that the degree of differentiation is accompanied by changes in miRNA expression. However, nothing is known about relationship between the described changes and tumor morphology or whether these changes have an individual or general character. We suggest to compare the miRNA expression profiles from different parts of the same tumor which have different morphology as well as tumors with the same morphology from different patients and analyse whether specific miRNAs are released into blood. Microdissection of cells from paraffin blocks of TNBC and miRNA microarray analysis will be used. Tissue and serum levels of selected miRNAs will be monitored by qPCR in an extended validation set and their functions will be studied by experiments on cell lines. The project could contribute to the discovery of new principles governing morphogenesis in tumors as well as identify novel diagnostic and prognostic markers.
- MeSH
- časná detekce nádoru MeSH
- exprese genu MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA MeSH
- mikročipová analýza MeSH
- mikrodisekce MeSH
- morfogeneze MeSH
- nádorové biomarkery analýza MeSH
- prognóza MeSH
- triple-negativní karcinom prsu diagnóza MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Lymfomy centrální nervové soustavy (CNS) představují jednu z nejagresivnějších malignit, vyznačující se špatnou prognózou a krátkou dobou přežití. Jejich současná diagnóza je založena na metodách s nízkou citlivostí a specifičností, schopných zachytit až již rozvinutý a hůře léčitelný lymfom. MikroRNA jsou krátké nekódující, nádorově specifické RNA, regulující genovou expresi na post-transkripční úrovni, jejichž specifickou vlastností je vysoká stabilita v tělních tekutinách. Cílem návrhu je vyvinout metodu pro včasnou a citlivou detekci lymfomů CNS na základě měření extracelulární mikroRNA v mozkomíšním moku a plazmě, která by umožnila včasnou a tím efektivnější léčbu nebo CNS profylaxi. V laboratoři 1.LF UK jsme vyvinuli metodu stanovení mikroRNA v mozkomíšním moku a předběžné výsledky ukazují, že jsme identifikovali index specifických nádorových mikroRNA, schopný s vysokou senzitivitou a s několikaměsíčním předstihem detekovat lymfomové postižení CNS, předpovědět jeho progresi či relaps a odrážející účinnost léčby; nahrazující tak nedostatky současných diagnostických metod. ...; Lymphoma involving CNS represents one of the most aggressive malignancies with poor prognosis and high mortality. Currently, their diagnosis suffers from low sensitivity and specificity. More powerful tools for early detection, response evaluation and CNS relapse risk prediction are urgently needed. Lymphomas overexpress short oncogenic regulatory RNAs called microRNAs that influence tumor growth and spreading. Unlike longer species, microRNAs are surprisingly stable and detectable in body fluids including cerebrospinal fluid (CSF). Proposed aim is to develop a method for sensitive and early detection and monitoring of CNS lymphoma, based on measurement of extracellular microRNAs in CSF and plasma that can serve as criteria for more effective early treatment or CNS prophylaxis. Our preliminary data indicate that we identified specific set of oncogenic microRNAs that can with high sensitivity and several months in advance identify CNS lymphoma involvement, reflects therapy efficiency or predict progression or relapse, thus substituting the weakness of current diagnostic methods.
- MeSH
- časná detekce nádoru MeSH
- exprese genu MeSH
- krevní plazma MeSH
- lidé MeSH
- lymfom diagnóza genetika MeSH
- mikro RNA krev mozkomíšní mok MeSH
- mozkomíšní mok MeSH
- nemoci centrálního nervového systému diagnóza genetika MeSH
- recidiva MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- genetika, lékařská genetika
- neurologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Těhotenství lze chápat jako zátěž organismu, která může odstartovat změny, v jejichž důsledku se mohou objevit klinicky závažná onemocnění v pozdějším životě pacientky. Riziko vzniku chronického onemocnění v pozdějším životě se zvyšuje zejména u pacientek s těhotenskými komplikacemi (preeklampsie, gestační hypertenze, předčasný porod, porod plodu s nízkou váhou). Epidemiologická data poukazují na fakt, že rovněž děti narozené z komplikovaného průběhu gravidity mají zvýšené riziko pozdějšího rozvoje kardiovaskulárních onemocnění, neboť v důsledku placentární nedostatečnosti se u nich častěji vyskytuje obezita, hypertenze a diabetes. Projekt významně přispěje k implementaci molekulárně-biologických přístupů v oblasti stratifikace kardiovaskulárního rizika žen a dětí narozených z patologicky probíhajícího těhotenství. Očekáváme identifikaci mikroRNA, podílejících se na regulaci kardiovaskulárního systému, jejichž abnormální profil genové exprese v důsledku manifestace těhotenských komplikací může mít za následek pozdější rozvoj kardiovaskulárních a cerebrovaskulárních onemocnění.; Pregnancy represents a physiological stressor that may contribute to the inducement of severe chronic diseases later in the life. The risk of latter development of chronic diseases increases in women with pregnancy related complications (preeclampsia, gestational hypertension, pre-term delivery, and intrauterine growth restriction). Epidemiologic data indicate that also children born from complicated pregnancies have a higher risk of cardiovascular diseases as a long-term consequence of placental insufficiency. Children obesity, hypertension, and diabetes occur more frequently in children descending from complicated pregnancies. The project contributes to the implementation of molecular biology in the stratification of cardiovascular risk in women and their children born from such complicated pregnancies. We would identify microRNAs, participating in regulation of cardiovascular system, whose abnormal expression profile was induced by the appearance of pregnancy related complications, and may contribute to cardiovascular and cerebrovascular diseases from long-term perspectives.
- MeSH
- dítě MeSH
- exprese genu MeSH
- fetální krev MeSH
- genetické testování metody MeSH
- kojenec MeSH
- komplikace těhotenství MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA analýza MeSH
- novorozenec MeSH
- plod MeSH
- rizikové faktory kardiovaskulárních chorob MeSH
- Check Tag
- dítě MeSH
- kojenec MeSH
- lidé MeSH
- novorozenec MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- kardiologie
- gynekologie a porodnictví
- perinatologie a neonatologie
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR
Závěrečná zpráva o řešení grantu Agentury pro zdravotnický výzkum MZ ČR
Nestr.
Použití inhibitorů signalizace přes B-buněčný receptor (BCR) má slibné terapeutické výsledky u B-buněčných malignit, ale nejsou dobře známy mechanismy jejich působení a molekulární dráhy důležité pro vznik rezistence a volbu vhodné kombinační léčby. V projektu navrhujeme studovat expresi miRNA a protein-kódujících genů po aplikaci BCR-inhibitorů (ibrutinib a idelalisib) v maligních buňkách pacientů s chronickou lymfatickou leukémií (CLL) s využitím technologie masivního paralelního sekvenování (Illumina). Cílem projektu je i) popsání molekulárních drah miRNA-mRNA, které jsou ovlivněny BCR-inhibicí, ii) nalezení miRNA, které mohou být prognostickými a prediktivními biomarkery a iii) definovat na základě analýzy molekulárních drah potenciální nové terapeutické přístupy, které napodobují efekt BCR-inhibitorů a/nebo s nimi mohou být kombinovány. V předběžných analýzách jsme identifikovali mRNA/miRNA ovlivněné BCR-inhibicí a popsali, že BCR-asociované miRNA mohou být využity jako biomarkery, což bude dále testováno na velkých souborech pacientů s CLL a folikulárním lymfomem.; The clinical use of BCR-inhibitors in B cell malignancies has promising clinical effects; however, better understanding is needed to design combinatorial treatments, and to understand their mechanisms of action and molecular pathways of resistance. In this project we propose to study the expression of miRNAs and protein-coding genes after therapeutic targeting of BCR (ibrutinib and idelalisib) in malignant B cells of patients with chronic lymphocytic leukemia (CLL) using massive parallel sequencing technology (Illumina). The aims are to i) describe the molecular pathways of miRNAs-mRNA affected by BCR inhibition, ii) describe miRNAs that can be used a prognostic and predictive biomarkers, and iii) based on the pathway analysis define potential novel therapeutic approaches that mimic BCR-inhibitors or could be used in combinational therapy. Our preliminary data identified mRNA/miRNAs that are affected by BCR inhibition, and we have shown that BCR-associated miRNAs can be used as biomarkers, which will be further validated on large cohorts of CLL and follicular lymphoma patients.
- MeSH
- chronická lymfatická leukemie genetika terapie MeSH
- exprese genu MeSH
- folikulární lymfom genetika terapie MeSH
- inhibitory proteinkinas terapeutické užití MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA MeSH
- nádorové biomarkery MeSH
- prognóza MeSH
- protoonkogenní proteiny c-bcr genetika MeSH
- signální transdukce genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Konspekt
- Patologie. Klinická medicína
- NLK Obory
- onkologie
- genetika, lékařská genetika
- NLK Publikační typ
- závěrečné zprávy o řešení grantu AZV MZ ČR