BACKGROUND: Monoallelic germline pathogenic variants (GPVs) in five Fanconi anemia (FA) genes (BRCA1/FANCS, BRCA2/FANCD1, PALB2/FANCN, BRIP1/FANCJ, and RAD51C/FANCO) confer an increased risk of breast (BC) and/or ovarian (OC) cancer, but the role of GPVs in 17 other FA genes remains unclear. METHODS: Here, we investigated the association of germline variants in FANCG/XRCC9 with BC and OC risk. RESULTS: The frequency of truncating GPVs in FANCG did not differ between BC (20/10,204; 0.20%) and OC (8/2966; 0.27%) patients compared to controls (6/3250; 0.18%). In addition, only one out of five tumor samples showed loss-of-heterozygosity of the wild-type FANCG allele. Finally, none of the nine functionally tested rare recurrent missense FANCG variants impaired DNA repair activities (FANCD2 monoubiquitination and FANCD2 foci formation) upon DNA damage, in contrast to all tested FANCG truncations. CONCLUSION: Our study suggests that heterozygous germline FANCG variants are unlikely to contribute to the development of BC or OC.
- MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci * MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * genetika MeSH
- nádory vaječníků * genetika MeSH
- oprava DNA genetika MeSH
- protein FANCG * genetika MeSH
- senioři MeSH
- studie případů a kontrol MeSH
- zárodečné mutace * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Germline CHEK2 pathogenic variants confer an increased risk of female breast cancer (FBC). Here we describe a recurrent germline intronic variant c.1009-118_1009-87delinsC, which showed a splice acceptor shift in RNA analysis, introducing a premature stop codon (p.Tyr337PhefsTer37). The variant was found in 21/10,204 (0.21%) Czech FBC patients compared to 1/3250 (0.03%) controls (p = 0.04) and in 4/3639 (0.11%) FBC patients from an independent German dataset. In addition, we found this variant in 5/2966 (0.17%) Czech (but none of the 443 German) ovarian cancer patients, three of whom developed early-onset tumors. Based on these observations, we classified this variant as likely pathogenic.
- MeSH
- checkpoint kinasa 2 * genetika MeSH
- dospělí MeSH
- genetická predispozice k nemoci * genetika MeSH
- introny * genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- nádory prsu * genetika MeSH
- nádory vaječníků genetika MeSH
- prekurzory RNA genetika MeSH
- sestřih RNA * genetika MeSH
- zárodečné mutace * MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- ženské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
- Německo MeSH
miRNA expression in triple-negative breast cancers (TNBC) has mainly been studied from a methodological viewpoint. However, it has not been considered that miRNA expression profile may be associated with a specific morphological entity inside every tumor. The verification of this hypothesis on a set of 25 TNBCs was the subject of our previous work, where we confirmed specific expression of the studied miRNAs in 82 samples of different morphologies including inflammatory infiltrate, spindle cell, clear cell, and metastases after RNA extraction and purification as well as microchip and biostatistical analysis. In the current work, we demonstrate a low suitability of in situ hybridization method for miRNA detection compared to RT-qPCR, and in detail discuss the biological role of 8 miRNAs with the most significant changes of expression.
- MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * genetika metabolismus MeSH
- triple-negativní karcinom prsu * genetika patologie MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- časopisecké články MeSH
Stanovisko podporují tyto odborné společnosti ČLS JEP Česká gastroenterologická společnost (ČGS) Společnost pro gastrointestinální onkologii (SGO) Česká chirurgická společnost (ČCHS) Česká onkologická společnost (ČOS) Český pankreatologický klub (ČPK). Terminologická poznámka Pojem surveillance (dohled) je v textu použit podle terminologického standardu používaného v České republice. V tomto smyslu nahrazuje termín screening (osob ve vysokém riziku), který se vyskytuje v některých anglických textech. Preambule Karcinom pankreatu (PC – pancreatic cancer) je závažné onemocnění s narůstající incidencí a vysokou letalitou. V posledních letech byly definovány skupiny osob se zvýšeným rizikem onemocnění a dále byly publikovány výsledky studií z expertních center, ukazující prodloužené dožití nemocných, u nichž byl PC diagnostikován v asymptomatickém stadiu. S vědomím rychlého vývoje znalostí v této oblasti si autoři textu kladou za cíl shrnout současnou úroveň poznání, definovat principy surveillance PC a přispět ke zvýšení úrovně péče o ohrožené osoby v České republice. Souhrn výstupů V rámci surveillance PC doporučujeme: 1. Neprovádět screening u osob s průměrným rizikem. 2. Dispenzarizovat osoby s vysokým rizikem. 3. Zařazovat pouze osoby poučené o výhodách a limitech surveillance, které jsou současně potenciálními kandidáty chirurgické léčby. 4. Používat metody EUS a MR/MRCP v jednoročních intervalech. 5. Za klinické cíle považovat prekancerózní léze, resekabilní a hraničně resekabilní PC (T1–3 a/nebo N0–2). 6. Vést registr zařazených osob.
- MeSH
- lidé MeSH
- nádory slinivky břišní * diagnóza epidemiologie etiologie MeSH
- plošný screening MeSH
- rizikové faktory MeSH
- surveillance populace MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- směrnice pro lékařskou praxi MeSH
Východiska: Hereditární nádorové syndromy tvoří významnou podskupinu zhoubných nádorových onemocnění způsobených patogenními variantami v některém z mnoha známých nádorových predispozičních genů. Diagnostika nádorové predispozice je založena na genetickém testování pomocí sekvenování nové generace. To umožňuje analýzu mnoha genů najednou, nicméně zároveň se zvyšuje počet identifikovaných variant. Správná klasifikace nalezených variant je zásadní pro klinickou interpretaci výsledků genetického testování. Cíl: Cílem práce je shrnutí pravidel pro klasifikaci identifikovaných variant v rámci jednotlivých pracovišť a představení procesu tvorby společné klasifikace. Sdílení nalezených genetických variant a tvorba jejich konsenzuální klasifikace v rámci národních laboratorně diagnostických komunit probíhá v ČR v rámci konzorcia Czech Cancer Panel for Clinical Application (CZECANCA) sdružujícího výzkumné a diagnostické onkogenetické laboratoře. Tvorba konsenzu pro klasifikaci variant probíhá podle definovaného protokolu. Sdílení výsledků a konsenzuální klasifikace zrychluje a zpřesňuje vydávání výsledků genetického testování, harmonizuje výsledky mezi laboratořemi a přispívá tak ke zkvalitnění péče o jedince ve vysokém riziku vzniku nádorových onemocnění a jejich příbuzné.
Background: Hereditary cancer syndromes are an important subset of malignant cancers caused by pathogenic variants in one of many known cancer predisposition genes. Diagnosis of cancer predisposition is based on genetic testing using next-generation sequencing. This allows many genes to be analysed at once, increasing the number of variants identified. The correct classification of the variants found is essential for the clinical interpretation of genetic test results. Purpose: The aim of this study is to summarise the rules for classifying identified variants within individual laboratories and to present the process for creating a common classification. In the Czech Republic, the sharing of identified genetic variants and the development of their consensus classification among national laboratory diagnostic communities is carried out within the Czech Cancer Panel for Clinical Application (CZECANCA) consortium of scientific and diagnostic oncogenetic laboratories. Consensus for variant classification follows a defined protocol. Sharing the results and consensus classification accelerates and refines the release of genetic test results, harmonises results between laboratories and thus contributes to improving the care of individuals at high risk of cancer and their relatives.
- Klíčová slova
- CZECANCA,
- MeSH
- dědičné nádorové syndromy * diagnóza genetika klasifikace MeSH
- genetická predispozice k nemoci genetika prevence a kontrola MeSH
- genetické testování metody MeSH
- klasifikace MeSH
- konsensus * MeSH
- lidé MeSH
- nádory genetika klasifikace MeSH
- vysoce účinné nukleotidové sekvenování metody MeSH
- zárodečné mutace genetika MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- práce podpořená grantem MeSH
- přehledy MeSH
- Geografické názvy
- Česká republika MeSH
Cíl: Shrnutí poznatků v oblasti karcinomu ovaria a genetické dispozice. Výsledky: Nádory ovarií jsou obvykle dia gnostikovány v pokročilých stadiích nemoci a prognóza těchto nemocných je všeobecně špatná. Pětileté celkové přežití bez ohledu na histopatologický typ nádoru se pohybuje kolem 44 %. Na vzniku epiteliálního ovariálního nádoru se majoritně podílejí germinální mutace způsobující dědičné nádorové syndromy. Nejčastější je dědičný nádorový syndrom prsu a vaječníku, který je zapříčiněn germinální mutací v tumor supresorových genech BRCA1 a BRCA2. Je známo i několik dalších tumor supresorových genů a onkogenů, které jsou asociovány s ovariálními nádory a způsobují jiné typy nádorových syndromů. Z dědičných nádorových syndromů je to např. Lynchův syndrom, Peutz-Jegersův syndrom, Gorlinův syndrom, Li-Fraumeniho syndrom a další. Indikaci ke genetickému vyšetření germinálních mutací dává klinický genetik na základě doporučení ošetřujícího lékaře. V současné době je každý ovariální nádor, primární peritoneální nádor a nádor tuby diagnostikovaný v jakémkoliv věku indikován ke genetickému vyšetření. Závěr: Časná identifikace genů dědičných nádorových syndromů díky rychle se rozvíjejícím molekulárně genetickým metodám představuje důležitý krok k personalizované léčbě nádorů ovaria a k preventivním opatřením u rizikových rodin. Důležité je si zároveň uvědomit, že negativní výsledek molekulárně genetického vyšetření není vyloučením genetického rizika.
Objective: Summary of knowledge in the field of ovarian cancer and genetic predisposition. Results: Ovarian tumors are usually diagnosed at advanced stages of the disease and the prognosis for these patients is generally poor. The 5-year overall survival rate, regardless of the histopathological type of tumor, is around 44%. Germline mutations causing hereditary tumor syndromes are predominantly involved in the development of epithelial ovarian tumors. The most common is hereditary breast and ovarian cancer syndrome, which is caused by germline mutations in the tumor suppressor genes BRCA1 and BRCA2. Several other tumor suppressor genes and oncogenes are known to be associated with ovarian tumors and cause other types of tumor syndromes. Inherited tumor syndromes include Lynch syndrome, Peutz-Jegers syndrome, Gorlin syndrome, Li-Fraumeni syndrome and others. The indication for genetic examination of germline mutations is given by a clinical geneticist on the basis of the recommendation of the attending physician. At present, every ovarian tumor, primary peritoneal tumor and tube tumor diagnosed at any age is indicated for genetic testing. Conclusion: Early identification of genes for hereditary cancer syndromes, thanks to rapidly developing molecular genetic methods, is an important step towards personalized treatment of ovarian cancer and preventive measures in families at risk. It is also important to note that a negative molecular genetic test result does not exclude genetic risk.
Gastrointestinálne stromálne tumory (GISTy) predstavujú najčastejšie mezenchýmové nádory tráviaceho traktu. Ich súčasná liečba dnes, v závislosti od viacerých parametrov ochorenia, zahŕňa najmä chirurgickú resekciu a biologickú liečbu inhibítormi tyrozínových kináz (TKIs). Tu prezentujeme raritný prípad 53-ročného pacienta s mutáciou p.W557_558Kdel exónu 11 c-KIT génu v primárnom GISTe žalúdka diagnostikovanom v gastroskopickej biopsii, ktorý bol liečený neoadjuvantnou cielenou liečbou imatinibom. Po počiatočnej fáze stabilizácie ochorenia vznikla u pacienta rezistencia na túto terapiu. Napriek liečbe TKI inhibítormi druhej a tretej línie a totálnej chirurgickej extirpácii v ďalšom priebehu dochádzalo k opakovaným remisiám a relapsom. V resekčnom materiáli sme identifikovali viacpočetné mutácie v rôznych exónoch c-KIT génu, kde pri perzistencii primárnej delečnej mutácie v exóne 11 vznikli ďalšie sekundárne zriedkavé mutácie v exónoch 13 (p.V654A) a 17 (p.Y823D). Opakované úseky remisií a relapsov tak po liečbe TKIs, ako aj po chirurgickej resekcii tumoru, poukazujú na nepriaznivý vplyv týchto genetických zmien a otvárajú otázku potreby modifikácie terapeutického prístupu imatinib-rezistentných GISTov striedaním jednotlivých TKIs namiesto doteraz zaužívanej monoterapie.
Gastrointestinal stromal tumours (GISTs) represent the most common mesenchymal tumours of the digestive tract. Based on various parameters, the recent GIST treatment includes surgical and/or targeted therapy using tyrosine kinase inhibitors (TKIs). In this paper we present a case of 53-year-old patient with c-KIT exon 11 (p.W557_558Kdel) mutated primary GIST of stomach diagnosed by a gastroscopic biopsy and treated by neoadjuvant TKI therapy using imatinib. After incipient disease stabilization, the patient developed therapy resistance. In spite of the second and third-line TKI treatment and radical surgery, the following disease course consisted of repeated remissions and relapses. The resection material showed multiple c-KIT mutations in various exons, including persisting primary exon 11 deletion mutation and two secondary infrequent c-KIT mutations in exon 13 (p.V654A) and exon 17 (p.Y823D). Repeating cycles of remissions and relapses after TKI treatments and surgical resection show the adverse effects of these genetic mutations on GIST behaviour and might advocate therapy management modification allowing therapeutic combinations of TKIs instead of conventional monotherapies in imatinib resistent GISTs.
- MeSH
- axony patologie MeSH
- biologická terapie metody MeSH
- chemorezistence MeSH
- cílená molekulární terapie metody MeSH
- gastrointestinální stromální tumory * chirurgie farmakoterapie MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mezenchymom chirurgie farmakoterapie MeSH
- mutace MeSH
- neoadjuvantní terapie metody MeSH
- protinádorové látky terapeutické užití MeSH
- protoonkogenní proteiny c-kit * genetika MeSH
- stomatochirurgické výkony MeSH
- tyrosinkinasy antagonisté a inhibitory MeSH
- Check Tag
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mužské pohlaví MeSH
- Publikační typ
- kazuistiky MeSH
Triple negative breast cancers (TNBC) are a morphologically and genetically heterogeneous group of breast cancers with uncertain prediction of biological behavior and response to therapy. Epithelial to mesenchymal transition (EMT) is a dynamic process characterized by loss of typical epithelial phenotype and acquisition of mesenchymal characteristics. Aberrant activation of EMT can aggravate the prognosis of patients with cancer, however, the mechanisms of EMT and role of microRNAs (miRNAs) in EMT activation is still unclear. The aim of our study was to analyze miRNA expression within areas of TNBCs with cellular morphology that may be related to the EMT process and discuss possible associations. Out of all 3953 re-examined breast cancers, 460 breast cancers were diagnosed as TNBC (11.64%). With regard to complete tumor morphology preservation, the tissue samples obtained from core-cut biopsies and influenced by previous neoadjuvant therapy were excluded. We assembled a set of selected 25 cases to determine miRNA expression levels in relation to present focal spindle cell and apocrine cell morphology within individual TNBCs. We used descriptive (histological typing and morphology), morphometric, molecular (microdissection of tumor and non-tumor morphologies, RNA isolation and purification, microchip analysis) and bioinformatic analysis (including pathway analysis). The results were verified by quantitative real-time PCR (RT-qPCR) on an extended set of 70 TNBCs. The majority of TNBCs were represented by high-grade invasive carcinomas of no special type (NST) with medullary features characterized by well-circumscribed tumors with central necrosis or fibrosis and frequent tendency to spindle-cell and/or apocrine cell transformation. Apocrine and spindle cell transformation showed a specific miRNA expression profile in comparison to other tumor parts, in situ carcinoma or non-tumor structures, particularly down-regulated expression of hsa-miRNA-143-3p and hsa-miRNA-205-5p and up-regulated expression of hsa-miR-22-3p, hsa-miRNA-185-5p, and hsa-miR-4443. Apocrine cell tumor morphology further revealed decreased expression of hsa-miR-145-5p and increased expression of additional 14 miRNAs (e.g. hsa-miR-182-5p, hsa-miR-3135b and hsa-miR-4417). Pathway analysis for target genes of these miRNAs revealed several shared biological processes (i.e. Wnt signaling, ErbB signaling, MAPK signaling, endocytosis and axon guidance), which may in part contribute to the EMT and tumor progression. We provide the first miRNA expression profiling of specific tissue morphologies in TNBC. Our results demonstrate a specific miRNA expression profile of apocrine and spindle cell morphology which can exhibit a certain similarity with the EMT process and may also be relevant for prognosis and therapy resistance of TNBC.
- MeSH
- apokrinní žlázy * mikrobiologie patologie MeSH
- dospělí MeSH
- epitelo-mezenchymální tranzice * genetika MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- mikro RNA * genetika MeSH
- regulace genové exprese u nádorů genetika MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- signální dráha Wnt genetika MeSH
- stanovení celkové genové exprese MeSH
- triple-negativní karcinom prsu * genetika patologie MeSH
- Check Tag
- dospělí MeSH
- lidé středního věku MeSH
- lidé MeSH
- senioři nad 80 let MeSH
- senioři MeSH
- ženské pohlaví MeSH
Včasná detekce karcinomu pankreatu je považována za nejúčinnější způsob, jak zvýšit míru přežití u pacientů s tímto onemocněním. Jedinci s familiárním výskytem nebo syndromy genetické náchylnosti mají prokazatelně zvýšené riziko vzniku karcinomu pankreatu. Současná odborná doporučení vycházejí z důkazů o přínosech systematického sledování těchto rizikových jedinců a zdůrazňují potenciál screeningu k ovlivnění tohoto onemocnění. Takový screeningový program nebyl v České republice zatím zaveden, nicméně v některých zemích se tomu tak již děje. Cílem naší přehledové práce je shrnout poznatky o hereditárním a familiárním karcinomu pankreatu a vyzvat ke spolupráci na pilotním screeningovému programu.
Early detection of pancreatic cancer is considered to be the most effective way to improve survival. Individuals with familial occurrence or genetic susceptibility syndromes have an increased risk of developing pancreatic cancer. Current guidelines are based on evidence of the benefits of systematic surveillance in high-risk individuals and emphasize the potential of screening programs to affect overall survival. This type of screening has not yet been introduced in the Czech Republic even though such programs are already being established in other countries. With this review we aim to summarize knowledge about hereditary and familial pancreatic cancer and issue a call for collaboration on a pilot screening program.
- Klíčová slova
- hereditární karcinom pankreatu, onkologický screening,
- MeSH
- lidé MeSH
- nádory slinivky břišní * diagnóza epidemiologie MeSH
- plošný screening MeSH
- Check Tag
- lidé MeSH
- Publikační typ
- přehledy MeSH
- Publikační typ
- abstrakt z konference MeSH
