The interferon signalling system elicits a robust cytokine response against a wide range of environmental pathogenic and internal pathological signals, leading to induction of a subset of interferon-induced proteins. We applied DSS (disuccinimidyl suberate) mediated cross-linking mass spectrometry (CLMS) to capture novel protein-protein interactions within the realm of interferon induced proteins. In addition to the expected interferon-induced proteins, we identified novel inter- and intra-molecular cross-linked adducts for the canonical interferon induced proteins, such as MX1, USP18, OAS3, and STAT1. We focused on orthogonal validation of a cohort of novel interferon-induced protein networks formed by the HLA-A protein (H2BFS-HLA-A-HMGA1) using co-immunoprecipitation assay, and further investigated them by molecular dynamics simulation. Conformational dynamics of the simulated protein complexes revealed several interaction sites that mirrored the interactions identified in the CLMS findings. Together, we showcase a proof-of-principle CLMS study to identify novel interferon-induced signaling complexes and anticipate broader use of CLMS to identify novel protein interaction dynamics within the tumour microenvironment.

• MeSH
• HLA antigeny MeSH
• HLA-A antigeny MeSH
• hmotnostní spektrometrie metody   MeSH
• interferony * MeSH
• lidé MeSH
• proteiny * chemie   MeSH
• reagencia zkříženě vázaná chemie   MeSH
• thiolesterasa ubikvitinu MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Next-generation sequencing (NGS) is increasingly used in transplantation settings, but also as a method of choice for in-depth analysis of population-specific HLA genetic architecture and its linkage to various diseases. With respect to complex ethnic admixture characteristic for East Croatian population, we aimed to investigate class-I (HLA-A, -B, -C) and class-II (HLA-DRB1, -DQA1, -DQB1) HLA diversity at the highest, 4-field resolution level in 120 healthy, unrelated, blood donor volunteers. Genomic DNA was extracted and HLA genotypes of class I and DQA1 genes were defined in full-length, -DQB1 from intron 1 to 3' UTR, and -DRB1 from intron 1 to intron 4 (Illumina MiSeq platform, Omixon Twin algorithms, IMGT/HLA release 3.30.0_5). Linkage disequilibrium statistics, Hardy-Weinberg departures, and haplotype frequencies were inferred by exact tests and iterative Expectation-Maximization algorithm using PyPop 0.7.0 and Arlequin v3.5.2.2 software. Our data provide first description of 4-field allele and haplotype frequencies in Croatian population, revealing 192 class-I and class-II alleles and extended haplotypic combinations not apparent from the existing 2-field HLA reports from Croatia. This established reference database complements current knowledge of HLA diversity and should prove useful in future population studies, transplantation settings, and disease-associated HLA screening.

• MeSH
• běloši genetika   MeSH
• dárci krve MeSH
• dospělí MeSH
• frekvence genu MeSH
• haplotypy MeSH
• HLA-A antigeny genetika   MeSH
• HLA-B antigeny genetika   MeSH
• HLA-C antigeny genetika   MeSH
• HLA-DQ alfa řetězec genetika   MeSH
• HLA-DQ beta řetězec genetika   MeSH
• HLA-DRB1 řetězec genetika   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• sekvenční analýza DNA MeSH
• vazebná nerovnováha MeSH
• vysoce účinné nukleotidové sekvenování MeSH
• zdraví dobrovolníci pro lékařské studie MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Chorvatsko MeSH

Práca podáva stručný literárny prehľad vybraných biologických markerov (genetické markery, protilátky proti jadrovému antigénu-1 vírusu Epsteinovej-Barrovej, hladiny vitamínu D) a ich potenciálne využitie v diagnostike, stanovení aktivity ochorenia, predpovedaní klinického priebehu a odpovede na terapeutickú intervenciu.

This paper discusses the potential applicability of some biological markers (genetic markers, Epstein-Barr virus nuclear antigen 1 antibody, vitamin D) for the diagnosis, disease activity, prediction of clinical courses and response to disease modifying therapies.

• MeSH
• 25-hydroxyvitamin D 2 biosyntéza   diagnostické užití   MeSH
• apolipoprotein E4 diagnostické užití   MeSH
• biologické markery * MeSH
• demyelinizační nemoci MeSH
• genetické markery MeSH
• HLA-A antigeny diagnostické užití   MeSH
• kalcitriol biosyntéza   diagnostické užití   MeSH
• lidé MeSH
• polymorfismus genetický MeSH
• prognóza * MeSH
• receptory kalcitriolu genetika   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• roztroušená skleróza * diagnóza   etiologie   genetika   MeSH
• virus Epsteinův-Barrové patogenita   MeSH
• vitamin D metabolismus   MeSH
• výsledek terapie MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

A somatic mutation of the human leukocyte antigen (HLA)-A gene revealed in tumour cells of acute myelogenous leukemia (AML) is described. A patient with AML and her siblings were routinely typed for HLA in order to find a suitable donor for haematopoietic stem cell transplantation. Sequencing-based typing of the initial patient's sample characterized by high proportion of blasts revealed unknown G/A exchange at position 781 of the HLA-A gene (exon 4) associated with HLA-A*02:01 allele. Importantly, this G781A variant was completely absent in the patient's remission sample obtained after the clearance of blasts. Our results are a reminder that HLA mutations in tumour cells may interfere with routine HLA typing and should always be considered, namely, in patients with haematological malignancies.

• MeSH
• akutní myeloidní leukemie genetika   patologie   terapie   MeSH
• alely MeSH
• bodová mutace * MeSH
• dospělí MeSH
• exony genetika   MeSH
• HLA-A2 antigen genetika   MeSH
• indukce remise MeSH
• lidé MeSH
• missense mutace * MeSH
• molekulární sekvence - údaje MeSH
• nádorové kmenové buňky chemie   MeSH
• sekvence nukleotidů MeSH
• sourozenci MeSH
• substituce aminokyselin MeSH
• testování histokompatibility MeSH
• transplantace hematopoetických kmenových buněk MeSH
• zárodečné mutace MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• kazuistiky MeSH
• práce podpořená grantem MeSH

Terapeutický efekt nepříbuzenské transplantace krvetvorných buněk (TKB) je nejvíce určován genetickou – HLA – neshodou mezi příjemcem a dárcem. Ta umožňuje jak u malignit žádoucí reakci štěpu proti leukemii (GVL – graft versus leukemia effect) snižující riziko relapsu, tak reakci štěpu proti hostiteli (GVHD-graft versus host disease) zvyšující mortalitu. Práce se snaží shrnout současný pohled na celkový význam HLA shody a interpretovat kvalitativní a kvantitativní efekt neshod v individuálních HLA genech na výsledek TKB od dospělého nepříbuzného dárce a to především u maligních onemocnění. Standardem je v současnosti snaha nalézt dárce alelicky shodného minimálně v HLA-A,-B,-C a–DRB1, protože izolovaná neshoda v každém z těchto genů zvyšuje mortalitu o přibližně 10 % a vícečetné neshody mají dokonce synergický negativní vliv. Efekt neshody je však významně ovlivněn stadiem základního onemocnění, protože u vysoce rizikových nemocných je v důsledku akcentované GVL reakce mnohem méně významný či dokonce zanedbatelný. S možnou výjimkou HLA-C lokusu u transplantace periferními krvetvornými buňkami jsou neshody na alelické i antigenní úrovni zřejmě srovnatelně tolerované. Je-li nutné akceptovat neshodného dárce, pak u kostní dřeně je lépe vyhnout se neshodám v HLA-A či DRB1, u periferních krvetvorných buněk je nejhůře tolerovanou „antigenní“ neshoda v HLA-C. Mimo HLA shodu existuje celá řada faktorů na straně dárce, které ovlivňují výsledek TKB a zde nutno zdůraznit především včasnost provedení transplantace, protože rychlost nalezení nepříbuzného dárce a neprodlené provedení TKB je takřka stejně důležité jako stupeň shody.

The therapeutic effect of unrelated donor stem cell transplantation (SCT) is predominantly determined by genetic non-identity – HLA-mismatch – between recipient and donor. This facilitates both the desirable graft versus leukaemia (GVL) effect, which reduces the risk of relapse in malignancies as well as the graft-versus-host disease (GVHD), which increases mortality. This paper attempts to summarize the current view on the overall significance of HLA match and to interpret the qualitative and quantitative effect of mismatches in individual HLA genes on the outcome of SCT from an unrelated adult donor, particularly in malignant diseases. The current standard involves an effort to find an allele-level matched donor at least in HLA-A,-B,-C,-DRB1, because isolated mismatch in each of these genes increases mortality by approximately 10% and multiple mismatches actually have a negative synergistic effect. However, the consequences of incompatibility are significantly influenced by disease stage, as in high-risk patients these are much less significant or even negligible because of the accentuated GVL response. With the possible exception of the HLA-C locus, mismatches either on allelic or antigenic level seem to be comparably tolerated in peripheral blood stem cell transplantation. If it is necessary to accept a mismatched donor, then in the case of bone marrow it is best to avoid mismatches in HLA-A and DRB1, while in the case of peripheral blood stem cells the worst tolerated “antigenic” mismatch involves HLA-C. Apart from HLA match, there are many factors on the donor side that affect SCT outcome. These especially include timely transplantation, as the speed of finding an unrelated donor and SCT within the shortest possible time are almost as important as the degree of HLA-compatibility.

• Klíčová slova
• krvetvorné buňky,
• MeSH
• časové faktory MeSH
• dárci krve MeSH
• dospělí MeSH
• HLA antigeny genetika   imunologie   MeSH
• HLA-A antigeny genetika   imunologie   MeSH
• HLA-B antigeny genetika   imunologie   MeSH
• HLA-C antigeny genetika   imunologie   MeSH
• HLA-DRB1 řetězec genetika   imunologie   MeSH
• homologní transplantace MeSH
• krevní a lymfatické nemoci terapie   MeSH
• lidé MeSH
• nepříbuzný dárce * MeSH
• reakce štěpu proti hostiteli genetika   imunologie   MeSH
• reakce štěpu proti leukémii imunologie   MeSH
• rizikové faktory MeSH
• testování histokompatibility * metody   MeSH
• transplantace kmenových buněk * MeSH
• výběr dárců MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

AIMS: To determine the impact of HLA compatibility measured by the Compatibility Index, on survival, rate of rejections, malignancies and infections in patients after heart transplantation (HTx). METHODS: We carried out a retrospective analysis of 182 consecutive patients who underwent heart transplantation in our center from January 2001 to April 2010. According to degree of HLA-A, B and DR matching (Compatibility Index, CI) the patients were divided in two groups, Group A (n=83) with an IC 0-17 and group B (n=99) with an IC 18-26. There was no significant difference in demographic parameters between recipients and donors. RESULTS: We found no difference in rates of rejections or infections between Group A and Group B (AR: 22 (26.5%) vs. 34 (34.3%), P=0.2539; infections: 21 (25.3%) vs. 27 (27%) P=0.7637). The distribution of infections in terms of type (bacterial, viral, fungal, including Aspergillus) was similar in both groups. The incidence of malignant tumours was infrequent (3 (3.6%) vs. 4 (4.0%), P=0.8817). We found trend toward lower level of tacrolimus in Group A. Long term survival was similar in both groups. CONCLUSIONS: Based on the results of our single-center trial, we found no impact of higher degree of HLA-A,-B, and -DR matching on survival, rejection episodes or infection. Further large studies are necessary to confirm our hypothesis that subjects with better HLA compatibility could require lower dose immunosuppression.

• MeSH
• biologické markery metabolismus   MeSH
• dospělí MeSH
• HLA antigeny imunologie   MeSH
• HLA-A antigeny imunologie   MeSH
• HLA-B antigeny imunologie   MeSH
• HLA-DR antigeny imunologie   MeSH
• hodnocení rizik MeSH
• imunosupresiva terapeutické užití   MeSH
• Kaplanův-Meierův odhad MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• následné studie MeSH
• přežívání štěpu imunologie   MeSH
• rejekce štěpu imunologie   MeSH
• retrospektivní studie MeSH
• rizikové faktory MeSH
• senioři MeSH
• testování histokompatibility * metody   MeSH
• transplantace srdce * metody   mortalita   MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• srovnávací studie MeSH

The new HLA-A*02:395N allele differs from A*02:01:01 at one nucleotide position in the exon 2.

• MeSH
• alely * MeSH
• dárci tkání MeSH
• databáze genetické MeSH
• exony genetika   MeSH
• HLA-A2 antigen genetika   MeSH
• jednonukleotidový polymorfismus MeSH
• lidé MeSH
• nesmyslný kodon genetika   MeSH
• terminační kodon genetika   MeSH
• testování histokompatibility MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• ženské pohlaví MeSH
• Publikační typ
• časopisecké články MeSH
• práce podpořená grantem MeSH
• Geografické názvy
• Česká republika MeSH

Jedním z faktorů, které zásadně ovlivňují prognózu pacientů po transplantaci srdce, je absence rejekce – odhojení štěpu. Pokud k rejekci dojde, může být zprostředkována imunokompetentními buňkami nebo protilátkami. Historicky lépe prozkoumanou i terapeuticky lépe zvládnutou je buněčná rejekce, která byla v popředí výzkumu a zájmu posledních 45 let. K výraznému oživení zájmu o protilátkami zprostředkovanou rejekci došlo poté, co byla prokázána kauzální souvislost s rozvojem dysfunkce až selháním štěpu v časném potransplantačním období a s koronární nemocí štěpu v pozdějším období. Tento přehledový článek si klade za cíl seznámit čtenáře se současnými možnostmi diagnostiky a léčby rejekce zprostředkované protilátkami.

A factor shown to heavily impact the prognosis of heart transplant recipients is absence of rejection, i.e., the failure of the body to accept a transplanted tissue. Historically, a better characterized and more readily treatable type is cellular rejection which has been at the forefront of research and interest over the past 45 years. There has been an appreciable renewal of interest in antibody-mediated rejection after graft dysfunction up to graft failure in the early post-transplant period had been shown to be causally related to transplant coronary artery disease at a later time. This review article aims at keeping the reader up to date about current options in diagnosing and treating antibody-mediated rejection.

• Klíčová slova
• Diagnostika, Léčba,
• MeSH
• financování organizované MeSH
• glukokortikoidy terapeutické užití   MeSH
• hemaglutininy imunologie   izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• histokompatibilní antigeny imunologie   izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• HLA-A antigeny imunologie   izolace a purifikace   škodlivé účinky   MeSH
• imunokomplex imunologie   izolace a purifikace   MeSH
• intravenózní imunoglobuliny terapeutické užití   MeSH
• kyseliny boronové terapeutické užití   MeSH
• lidé MeSH
• monoklonální protilátky terapeutické užití   MeSH
• průtoková cytometrie metody   využití   MeSH
• pyraziny terapeutické užití   MeSH
• rejekce štěpu diagnóza   etiologie   komplikace   MeSH
• sirolimus terapeutické užití   MeSH
• splenektomie metody   využití   MeSH
• transplantace srdce imunologie   škodlivé účinky   MeSH
• Check Tag
• lidé MeSH
• Publikační typ
• přehledy MeSH

Different strategies appear to improve the success in treatment of antibody-mediated rejection (AMR), although no one best method has yet emerged. The objective of this study was to compare the efficacy of the combination of Plasmapheresis/intravenous immunoglobulin (IVIg)/anti-CD20-based regimes versus high-dose IVIg alone in the treatment of AMR. Group A (12 patients) was treated with high-dose IVIg between January 2000 and December 2003; group B (12 patients) was treated by Plasmapheresis/IVIg/anti-CD20 between January 2004 and December 2005. Graft survival at 36 months was 91.7% in group B versus 50% in group A (p = 0.02). Donor-specific human leukocyte antigens (DSA) levels detected by Luminex single antigen (Luminex SA) and ELISA, 3 months postrejection are significantly lower in group B than in group A: DSA ELISA class 2 score 6-8 (p = 0.02), DSA mean intensity of fluorescence (MFI) max (p = 0.009) and DSA mean MFI (p = 0.0004). The persistence of elevated DSA levels posttreatment is more frequent in patients with graft loss as compared to those with preserved renal function: score 6-8 on ELISA (p = 0.04); mean MFI (p = 0.00009) and MFImax (p = 0.018). We conclude that: (1) high dose IVIg alone is inferior to Plasmapheresis/IVIg/anti-CD20 as therapy for AMR and (2)DSA postrejection can be quantified using solid phase assays, showing that 3 months after AMR, DSA levels are higher in patients with graft loss.

• MeSH
• antigeny CD20 imunologie   MeSH
• B-lymfocyty imunologie   MeSH
• biopsie MeSH
• dospělí MeSH
• fokálně segmentální glomeruloskleróza chirurgie   MeSH
• HLA antigeny imunologie   MeSH
• HLA-A antigeny imunologie   MeSH
• HLA-B antigeny imunologie   MeSH
• intravenózní imunoglobuliny terapeutické užití   MeSH
• isoprotilátky imunologie   krev   MeSH
• kombinovaná terapie MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• plazmaferéza MeSH
• rejekce štěpu imunologie   patologie   prevence a kontrola   MeSH
• T-lymfocyty imunologie   MeSH
• testování histokompatibility MeSH
• transplantace ledvin imunologie   MeSH
• tvorba protilátek MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mladiství MeSH
• mladý dospělý MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• ženské pohlaví MeSH

BACKGROUND: Renal cell carcinomas have developed various strategies to escape immune cell recognition, including down-regulation or loss of classic HLA class I antigens (A, B, C) and aberrant expression of non-classic HLA class I antigens (G, E). In this study both classic and non-classic HLA class I antigens were tested in tumor specimens and established primary cell cultures derived from renal cell carcinoma patients. MATERIAL/METHODS: HLA class I antigens were evaluated by immunohistochemical staining and the intensity of cytoplasmic staining was measured semiquantitatively. Renal tumor tissue obtained from nephrectomy was used for the explant culture. MTT assay was performed to test the chemoresistance of primary cell line cultures to common cytostatics. RESULTS: HLA-G and HLA-E were found in 62% and 100% of the analyzed tumor samples, respectively. Markedly higher levels of the non-classic HLA-G and -E antigens compared with the classic HLA-A, -B, and -C antigens were observed. The cells of the control renal tissues were HLA-A, -B, -C, and -E positive and HLA-G negative. Cell line cultures were successfully established in 85% of the renal cell carcinoma specimens. No or minimal changes in classic HLA-A, B, and C antigen staining were observed during cultivation of the primary cell line cultures. No correlation between HLA class I antigen expression and chemoresistance, histopathological stage, or nuclear grade was found. CONCLUSIONS: These findings suggest that primary cell line cultures derived from surgical specimens of renal cell carcinomas are a feasible model for immunotherapy research through their high cultivation potential.

• MeSH
• buněčné kultury metody   MeSH
• dospělí MeSH
• HLA antigeny metabolismus   MeSH
• HLA-A antigeny metabolismus   MeSH
• HLA-B antigeny imunologie   MeSH
• HLA-C antigeny MeSH
• HLA-G antigeny MeSH
• imunohistochemie MeSH
• imunoterapie MeSH
• karcinom z renálních buněk imunologie   terapie   MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• MHC antigeny I. třídy metabolismus   MeSH
• nádorové buňky kultivované MeSH
• nádory ledvin imunologie   terapie   MeSH
• senioři MeSH
• Check Tag
• dospělí MeSH
• lidé středního věku MeSH
• lidé MeSH
• mužské pohlaví MeSH
• senioři MeSH
• ženské pohlaví MeSH