• Something wrong with this record ?

Prognostický a prediktivní význam alternativních sestřihových variant genu BRCA1 u karcinomu prsu

řešitel projektu Petra Kleiblová ; spoluřešitel David Pavlišta, Ondřej Měšťák ; nositel Univerzita Karlova v Praze, 1. lékařská fakulta, Všeobecná fakultní nemocnice, Nemocnice Na Bulovce

Published
2015
Series
Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
Pagination
1 svazek : ilustrace, tabulky ; 30 cm

Language Czech Country Czech Republic

Persistent link   https://www.medvik.cz/link/MED00187209

Grant support
NT12280 MZ0 CEP Register

Cílem projektu je identifikace tkáňové specifičnosti sestřihových forem genu BRCA1 s ohledem na jejich význam jako prognostických a prediktivních ukazatelů karcinomu prsu. Vzorky RNA izolované z peroperačně získané mamární tkáně pacientek s ca prsu a ženbez nádoru podstupujících mamoplastiku a izolované z periferní krve budou sloužit pro syntézu cDNA. Sestřihové varianty BRCA1 mRNA budou z cDNA amplifikovány s primery zasahujícími 5' a 3' UTR sekvece BRCA1 a analyzovány fragmentační gelovou elektroforézou (Agilent 2100). Alternativní sestřihové varianty budou zaklonovány pomocí TA-klonování do vektorů a sekvenačně charakterizovány ze získaných plasmidů. Tkáňová exprese jednotlivých variant BRCA1 bude kvantifikována pomocí qPCR. Statisticky budou vyhodnoceny rozdíly v sestřihovém vzorci buněk periferní krve a mamy a mezi pacientkami s ca prsu a nenádorovou populací, u pacientek s ca prsu budou vyhodnoceny sestřihové vzorce BRCA1 mRNA ve vztahu k průběhu a léčbě onemocnění.; The aim of the project is identification of BRCA1 splicing variants specificity regarding their significance as a prognostic factors and predictive markers of breast cancer. cDNA will be synthesized from RNA isolated from mammary tissue samples receivedfrom breast cancer patients and from women without breast cancer and from their peripheral blood. BRCA1 mRNA splicing variants will be identified using cDNA as a template for PCR amplification with primers localized in 5´ and 3´ BRCA1 UTR and subsequently analyzed by fragmentation gel electrophoresis (Agilent 2100). Detected BRCA1 splicing variants will be cloned into TA ? cloning vector and sequenced. Tissue specific expression of particular variants will be quantified by qPCR. Differences between splicing patterns of lymphocytes and mammary tissue within patients with breast cancer and controls will be statistically evaluated. BRCA1 splicing variants within breast cancer patients will be evaluated in relation to disease course and treatment.

Doba řešení: 2011-2014

Owner Details Services
NLK NLK Shelf no. G 4749 [1]
Volume Location Shelf no. Status Order
000      
00000ntm 2200000 i 4500
001      
MED00187209
003      
CZ-PrNML
005      
20170427092108.0
007      
ta
008      
151208s2015 xr da e 000 0|cze||
009      
ND
040    __
$a ABA008 $b cze $d ABA008 $e rda
041    0_
$a cze $b eng
044    __
$a xr
072    _7
$a 618 $x Gynekologie. Porodnictví $2 Konspekt $9 14 $7 sk136318
086    __
$a NT12280 $p MZ0
100    1_
$a Kleiblová, Petra $7 xx0125463 $4 aut
245    10
$a Prognostický a prediktivní význam alternativních sestřihových variant genu BRCA1 u karcinomu prsu / $c řešitel projektu Petra Kleiblová ; spoluřešitel David Pavlišta, Ondřej Měšťák ; nositel Univerzita Karlova v Praze, 1. lékařská fakulta, Všeobecná fakultní nemocnice, Nemocnice Na Bulovce
264    _0
$c 2015
300    __
$a 1 svazek : $b ilustrace, tabulky ; $c 30 cm
336    __
$a text $b txt $2 rdacontent
337    __
$a bez média $b n $2 rdamedia
338    __
$a svazek $b nc $2 rdacarrier
490    1_
$a Závěrečná zpráva o řešení grantu Interní grantové agentury MZ ČR
500    __
$a Doba řešení: 2011-2014
520    0_
$a Cílem projektu je identifikace tkáňové specifičnosti sestřihových forem genu BRCA1 s ohledem na jejich význam jako prognostických a prediktivních ukazatelů karcinomu prsu. Vzorky RNA izolované z peroperačně získané mamární tkáně pacientek s ca prsu a ženbez nádoru podstupujících mamoplastiku a izolované z periferní krve budou sloužit pro syntézu cDNA. Sestřihové varianty BRCA1 mRNA budou z cDNA amplifikovány s primery zasahujícími 5' a 3' UTR sekvece BRCA1 a analyzovány fragmentační gelovou elektroforézou (Agilent 2100). Alternativní sestřihové varianty budou zaklonovány pomocí TA-klonování do vektorů a sekvenačně charakterizovány ze získaných plasmidů. Tkáňová exprese jednotlivých variant BRCA1 bude kvantifikována pomocí qPCR. Statisticky budou vyhodnoceny rozdíly v sestřihovém vzorci buněk periferní krve a mamy a mezi pacientkami s ca prsu a nenádorovou populací, u pacientek s ca prsu budou vyhodnoceny sestřihové vzorce BRCA1 mRNA ve vztahu k průběhu a léčbě onemocnění.
520    9_
$a The aim of the project is identification of BRCA1 splicing variants specificity regarding their significance as a prognostic factors and predictive markers of breast cancer. cDNA will be synthesized from RNA isolated from mammary tissue samples receivedfrom breast cancer patients and from women without breast cancer and from their peripheral blood. BRCA1 mRNA splicing variants will be identified using cDNA as a template for PCR amplification with primers localized in 5´ and 3´ BRCA1 UTR and subsequently analyzed by fragmentation gel electrophoresis (Agilent 2100). Detected BRCA1 splicing variants will be cloned into TA ? cloning vector and sequenced. Tissue specific expression of particular variants will be quantified by qPCR. Differences between splicing patterns of lymphocytes and mammary tissue within patients with breast cancer and controls will be statistically evaluated. BRCA1 splicing variants within breast cancer patients will be evaluated in relation to disease course and treatment.
650    07
$a gynekologie a porodnictví $7 nlk20040147647 $2 mednas
650    07
$a onkologie $7 nlk20040148136 $2 mednas
650    07
$a nádory prsu $7 D001943 $2 czmesh
650    07
$a dědičný syndrom nádoru prsu a vaječníků $7 D061325 $2 czmesh
650    07
$a genetická predispozice k nemoci $7 D020022 $2 czmesh
650    07
$a prediktivní hodnota testů $7 D011237 $2 czmesh
650    07
$a geny BRCA1 $7 D019398 $2 czmesh
650    07
$a alternativní sestřih $7 D017398 $2 czmesh
655    _4
$a závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR $7 nlk-pt176
700    1_
$a Pavlišta, David $7 xx0057882 $4 aut
700    1_
$a Měšťák, Ondřej $7 xx0175742 $4 aut
710    2_
$a Univerzita Karlova. $b Lékařská fakulta, 1. $7 kn20010709366
710    2_
$a Všeobecná fakultní nemocnice (Praha, Česko) $7 nlk20020120962
710    2_
$a Nemocnice Na Bulovce (Praha, Česko) $7 xx0146477
810    1_
$a Česko. $b Ministerstvo zdravotnictví. $b Interní grantová agentura. $t Závěrečná zpráva o řešení grantu
856    41
$u https://kramerius.medvik.cz $y Digitalizace plánována
910    __
$a ABA008 $b G 4749 $y f
990    __
$a 20151126143624 $b ABA008
991    __
$a 20170427092428 $b ABA008
999    __
$a ok $b medvik21 $g 1098420 $s 201257
BAS    __
$a 30
LZP    __
$b granty 8/2015