• MeSH
• biopsie MeSH
• genomika MeSH
• histologické techniky MeSH
• karcinom diagnóza   MeSH
• multimodální zobrazování MeSH
• nádorové biomarkery MeSH
• nádory prsu diagnóza   MeSH
• počítačové zpracování obrazu MeSH
• prognóza MeSH
• receptory rozpoznávající vzory MeSH
• recidiva MeSH

• Konspekt
• Biochemie. Molekulární biologie. Biofyzika
• NLK Obory
• molekulární biologie, molekulární medicína
• gynekologie a porodnictví
• onkologie
• NLK Publikační typ
• závěrečné zprávy o řešení grantu IGA MZ ČR

The main goal of the proposed project is to bridge the gap between histo-pathological readings and the molecular signatures by combining the two modalities into an improved risk scoring system. The current practice considers the pathological examination and the molecular profiling as two independent stages in patient diagnosis. It is conceivable that new histo-pathological descriptors of the tumor, that are not usually estimated by the pathologist, can be extracted by using quantitative methods for image analysis, such that they are either predicting aspects of molecular profiles or complementing the gene signatures. Such descriptors will enhance the pathological assessment of the tumor and enrich the risk scores. The project will provide both the software tools for computing the image descriptors and the methods for estimating the risk scores. The independent validation of the results will be performed in a retrospective cohort in a follow up project.

Hlavním cílem překládaného projektu je přemostit histopatologické čtení nádorových tkáňových řezů a molekulárních genomických dat integrací obou modalit do vylepšeného rizikového skóre pro relaps. Současná praxe považuje patologické vyšetření a molekulární profilování za dva nezávislé kroky diagnózy nádoru. Předpokládáme, že kvantitativními metodami analýzy obrazu mohou být objeveny některé nové histopatologické charakteristiky nádoru, které normálně nejsou patologem vyhodnocovány, ale jsou buď prediktory molekulárních procesů, a/nebo představují jejich doplňky vylepšující patologické hodnocení nádoru a rizikové skóre. Výsledkem tohoto projektu budou softwarovérové nástroje pro nalezení obrazových charakteristik tkáňových řezů a vylepšená metoda odhadu rizikového skóre, které budou používány patologem a onkologem k lepší rizikové diagnostice nádoru. V případě úspěchu projektu budou výsledky dále validovány na nezávislé retrospektivní kohortě v samostatném projektu.

Doba řešení: 2013-2015