The project is aimed at members of genus Rotavirus groups A, B, and C (RVA, RVB and RVC) which are an important cause of gastroenteritis worldwide. In the Czech Republic, the rotavirus diagnostics is directed to RVA antigen in stools; the prevalence of RVB and RVC in children and adult patients is unknown. RVC was described as an aetiological agent of diarrhoea in several European countries and RVB is commonly diagnosed in Asia as a cause of adult gastroenteritis. Increased migration, aging of population, and documented zoonotic potential of rotaviruses substantiate the need for research in this field. Especially endangered groups of population are socioeconomically segregated subpopulations and immigrants from developing countries. The goal of the project is to carry out an epidemiological study in different age groups of population and assess the distribution of circulating genotypes based on the sequence and phylogenetic analyses including next-generation sequencing. Next the PCR-based diagnostic method will be developed for detection of all rotavirus groups present in populati...

Projekt se zaměřuje na rotaviry skupin A, B a C (RVA, RVB a RVC), které patří celosvětově k významným původcům gastroenteritid dětí i dospělých. V České republice je běžně prováděna diagnostika RVA antigenu ve vzorcích stolice, nicméně prevalence RVB a RVC u dětských i dospělých pacientů není známá. RVC byl prokázán jako původce gastroenteritid v některých evropských zemích a RVB je běžně diagnostikován v Asii jako původce průjmů dospělých. Zvýšená migrace obyvatelstva, prokázaný zoonotický potenciál rotavirů a stárnutí populace odůvodňují potřebu výzkumu v této oblasti. Ohroženy jsou zejména sociálně slabé skupiny obyvatelstva se sníženými hygienickými standardy včetně imigrantů z rozvojových zemí. Cílem projektu bude provést epidemiologickou studii u různých věkových skupin obyvatelstva a na základě sekvenční a fylogenetické analýzy s použitím celogenomového sekvenování stanovit zastoupení cirkulujících genotypů. Na základě získaných údajů bude vyvinuta diagnostická metoda založená na PCR, která umožní detekci všech skupin humánních rotavirů, jejichž výskyt lze v populaci očekáv...

Detailed analysis of human rotavirus infections in the Czech Republic including atypical and emergent strains: development of new diagnostic methods

Doba řešení: 2016-2019

Obsahuje literaturu