Nádory tlustého střeva a konečníku (CRC) patří mezi tři nejčastější maligní onemocnění na světě. Protože většina kolorektálních karcinomů se vyvíjí z adenomatózních polypů, časná identifikace těchto adenomů v konečném důsledku sniží úmrtnost na CRC. Navzdory časnému kolonoskopickému odstranění polypů přetrvává u některých pacientů zvýšené riziko vzniku CRC. Na druhou stranu ne všichni jedinci s adenomy tlustého střeva mají vyšší riziko rozvoje CRC ve srovnání s obecnou populací. V předkládaném projektu se v prospektivní studii zaměříme na současnou profilaci transkriptomu a DNA metylomu u adenomů tlustého střeva. Průvodní analýza mikrobiomu sledovaných pacientů s adenomy přispěje k dalšímu ustavení specifických charakteristik, poukazujících na individuální riziko vývoje CRC. Výše uvedené ukazatele budou validovány u nezávislé skupiny osob s adenomy, u kterých je k dispozici dlouhodobé sledování. Kandidátní marker budou podrobeny funkčnímu testování in vitro. Naše studie mohou přispět k nalezení citlivých ukazatelů, predikujících riziko vzniku CRC.; Colorectal cancer (CRC) is the third common cancer worldwide. Since the majority of colorectal carcinomas evolve from adenomatous polyps, identification of these adenomas can reduce CRC mortality. Despite the removal of colonic polyps at an initial colonoscopy, some patients are still at an increased risk of developing CRC. However, not all individuals with colonic adenomas have a risk of developing CRC higher than that of the general population. In the present project, we will simultaneously profile transcriptome and DNA methylome in adenoma specimen in prospective study. Concomitant analysis of patient ́s microbiome is aimed at identifying specific characteristics capable of discriminating individuals at risk of developing CRC. Selected relevant characteristics will be validated in additional group of subjects with detail follow up as well as functionally tested in vitro. In summary, above markers could provide a sensitive tool in CRC risk prediction.

Identification of diagnostic markers in colorectal cancer by profiling of trascriptome, DNA methylome and microbiome in adenoma-carcinoma transition

Doba řešení: 2018-2022

Obsahuje literaturu